伊扎克·焦耳(イザーク・ジュール，Yzak Joule)
配音：关智一(日本);袁淑珍 / 何伟诚(第二季)(中国香港);于正昇(中国台湾)
生日：C.E.54年8月8日
星座：狮子座
年龄：17岁/19岁
身高：175公分/177公分
体重：56公斤/66公斤
血型：O
种族：调整者
介绍：
母亲为P.L.A.N.T.最高评议会12委员之一，隶属克鲁泽队，一心为了扎夫特的荣誉而战斗，为迪安卡的挚友;表面上与阿斯兰的关系并不和睦，经常出言指责阿斯兰，但内心其实将其当作好朋友，曾多次规劝阿斯兰返回扎夫特并肩作战。
曾参与GAT-X强夺作战，为强夺高达的四名驾驶员之一，夺得的机体为“GAT-X102 决斗高达”，并被任命为该机体的专用驾驶员。之后在第二季坐镇于“纳兹卡级”的“伏尔泰号”与“冈瓦那级”巨型宇宙舰并升格为高阶将领。
第一季初期因无法击败基拉·大和且多次受挫于对方，故此视其为主要敌人，矢志要击败对方。后来在阿拉斯加防卫战中，被驾驶自由高达突然从天而降的基拉告知，现场地底藏有独眼巨人系统并且即将被引爆时，本不相信对方，意欲再战。却被对方闪电制服，并强行抛离现场，终得保性命。亦是因为此事，后来于响博士的研究所再遇叛变了的迪安卡时，未有将他制服或射杀，而任他离开。更于雅金·杜威攻防战末段倒戈帮助迪安卡。
第一季和第二季之间，因在雅金·杜威攻防战中倒戈，本来要受军法审判，但时任最高评议会议长杜兰朵出面干预，免除了所有年轻军人于此次战事中的刑责，因而可以重返扎夫特。
第二季故事出场时已晋升，拥有自己的小队“焦耳队”，以及母舰“笛卡儿号”，成员包括昔日好友迪安卡以及与自己有着共同兴趣的女研究员兼机师的志保·哈尼夫斯。曾驾驶斩击型扎古幽灵协助智慧女神号，阻止尤尼乌斯坠落地球。其后亦率军攻破联合军的巨大毁灭系统“镇魂曲”其中一节组件。
和挚友迪安卡、志保、阿斯兰一样，由于是跟着自己的理念来决定行动，因此做为军人来说忠诚度有点偏低，立场时常转换。在《SEED DESTINY》的弥赛亚攻防战中更是以一介白衣指挥官的身份，非常干脆的和迪安卡、志保一起倒戈帮助身为敌军的阿斯兰破坏镇魂曲，这点常常被评论者拿来批评伊扎克身为指挥官的忠诚严重不足。如果不是因为最后胜利的是拉克丝派，以这种罪行足以让他和迪安卡以及志保遭受枪决。
虽然伊扎克有毒舌的缺点，但是实际上他非常关心自己的朋友及部下，正是因为这样，他的“焦耳队”从第二次战争开始到结束没有出现任何的人员伤亡，是唯一一支建制完好的小队。
《SEED DESTINY》的后续广播剧1中提到他在战争后调入参谋本部，不过由于母亲的催婚和恶搞使他精神崩溃继而搭乘大天使号短暂离开P.L.A.N.T.，但是没过多久还是回去了。
阿斯兰·萨拉(アスラン・ザラ，Athrun Zala)
配音：石田彰(日本);邝树培→苏强文 / 罗伟民(第二季)(中国香港);丘台名(中国台湾)
生日：C.E.55年10月29日
星座：天蝎座
年龄：16岁/18岁
身高：170公分/174公分
体重：63公斤/60公斤
血型：O
种族：调整者
介绍：
第一季与第二季的主角之一，他是基拉·大和从小就认识的挚友，性格冷静温柔，亦为“GAT-X303 神盾高达”及“ZGMF-X09A 正义高达”的驾驶员;之后在第二季驾驶“ZGMF-X23S 救世主高达”与“ZGMF-X19A 无限正义高达”。
他也是P.L.A.N.T.最高评议会成员(后升任为议长)帕特里克·萨拉的独生子，其母于地球军发动的“血腥情人节”事件中丧生。
原为拉克丝·克莱因的婚约人(实际上为政治联姻)，之后因为帕特里克认为拉克丝·克莱因背叛P.L.A.N.T.而中止，拉克丝·克莱因后来与基拉发展成恋人关系。
第一季后期与卡嘉莲·尤拉·阿斯哈发展成恋人关系。
第二季初登场时作为卡嘉莲的保镖一同前往扎夫特一号军械库。同时间潜入军械库一号的史黛菈·路歇与其同伴史汀格·欧格雷和奥尔·尼达曾引起了阿斯兰的注意，阿斯兰与史黛菈短暂地对视过一眼，后来在迪奥基亚再次见面时阿斯兰觉得他们看起来似曾相识，但不知道彼此已经交战了多次。第二季尾末并未清楚交代他与卡嘉莲·尤拉·阿斯哈的感情去向。
劳·卢·克鲁泽(ラウ・ル・クルーゼ，Rau Le Crueset)
配音：关俊彦(日本);陈欣→雷霆(中国香港);熊肇川→于正昇(中国台湾)
生日：C.E.43年6月12日
星座：双子座
年龄：28岁(KIA)
身高：183公分
体重：77公斤
血型：O
种族：自然人/克隆人
介绍：
为第一季的最终反派，亦为第二季命运计划的背后影响者。自由条约黄道联盟高阶将领，戴着一副白色面具，为人神秘，最终决战时操作“ZGMF-X13A 神意高达”。
扎夫特精英部队克鲁泽小队的指挥官，为了隐藏素颜，平常总是戴着面具示人，因而被称呼为“假面之男”。
故事开端即率领小队成员阿斯兰·萨拉等人于中立国欧普的资源卫星殖民地“赫立奥波利斯”发动攻击，最后成功强夺大西洋联邦开发的G兵器五机中的四机，此后执拗地追击突击高达与新造舰大天使号。
其假面下的真面目为穆·拉·福拉卡之父——亚尔·达·福拉卡的克隆人，此事须追溯至C.E.46年，悠连·响博士研究人工子宫不顺利，研究资金困难;亚尔便找上响博士表达愿提供援助，交换条件是响博士必须为他制作自己的克隆人。由于亚尔认为独生子的穆不足以成为福拉卡家族的继承人，故希望能复制出最优秀的自己，完成长生不死的梦。尽管复制、创造人类的行为是违法的，响博士最初面露难色，但在亚尔的威胁利诱以及对超级调整者的渴望下，结果仍接受其条件。然而，由于复制技术的不成熟，响博士仍无法解决技术上染色体端粒基因缩短的问题，身体会迅速老化是体细胞复制的宿命。克隆人年纪轻轻就得面对提早死亡的恐惧以及自己这张布满皱纹的老脸，只能长期服用抗老化药物来延缓，没有梦想也没有未来。因此劳认为自己有制裁全人类的权力，即白老鼠的复仇。劳作为“失败品”被带回福拉卡家，与穆成为兄弟面对面生活一段时间，期间名字不详。然而，亚尔对于这个“失败品”十分失望，劳亦憎恨亚尔抛弃了自己这个诞生于不幸的身体，无法抑制自己的憎恶之心，于后年纵火烧毁福拉卡邸，导致福拉卡夫妇两人死亡。之后劳便改以劳·卢·克鲁泽之名活着并前往P.L.A.N.T.。
虽然有缺陷，克鲁泽仍继承福拉卡家族遗传的才能，拥有异于常人的直觉和强大的空间认识能力，较穆更接近亚尔。除了天分，或许还有复仇的执念，克鲁泽以优秀的驾驶员资质存活下来。C.E.68年，适逢P.L.A.N.T.在扎夫特建军时入伍，于驾驶员养成课程中以优秀成绩毕业并获得了菁英证明的赤服(扎夫特红衣)，克鲁泽很快地就在C.E.70年爆发的血腥情人节战争中出阵，且作为毫不逊于调整者的王牌驾驶员崭露头角，活跃在前线中。与此同时，他遇见了后来就任P.L.A.N.T.最高评议会议长的基因工程学者吉尔伯特·杜兰朵，不久两人便成为好友，克鲁泽从其口中得知自己身为克隆人的残酷真相，杜兰朵则供应克鲁泽其特制的抗老化药物。不过，两人之所以关系密切，似乎是因为克鲁泽是唯一愿意倾听杜兰朵发表高论的人;尽管两人理念完全相反，仍时常针对“世界”、“人类”等主题进行对话。同时期，克鲁泽将与自己同样作为亚尔·达·福拉卡克隆人的雷·札·巴雷尔接回来保护着。另外，往后的时间点，克鲁泽发现可谓是超级调整者基拉·大和的原型卡纳得·帕尔斯，增加他对基拉的敌意。
C.E.70年2月22日的世界树攻防战，以MS击破MA37机、战舰6艘，如此惊人的战绩被授与相称的星云勋章。另外，此时期的克鲁泽因为染色体端粒基因过短之故，开始将素颜隐藏在假面里掩盖自己的老去。接着同年6月2日，搭乘ZGMF-1017M 基恩高机动型(Ginn Type High-Maneuver)的量产型一号机于格里马尔迪战线摧毁地球联合军第三舰队，作为顶尖之枪(Top Gun)勇往直前的活跃被扎夫特领导层注意到。在月面的安提米翁这场战斗中，克鲁泽与穆·拉·福拉卡所属的TS-MA2mod.00 梅比乌斯零式(Möbius Zero)部队交战，尽管克鲁泽大破当时处于技术劣势的地球军，然而其中一架零式的驾驶员仍能与克鲁泽打至不相上下，那个驾驶员就是穆，那时的克鲁泽也是第一次与穆进行感应并进行潜意识对话，然而穆早已忘记克鲁泽的存在。随后克鲁泽由于战功显赫当上了白衣指挥官，并拥有了自己的克鲁泽队，指挥纳斯卡级战舰威萨留斯号。而零式小队唯一生还的穆被地球联合军表扬，并冠以“安提米翁之鹰”的外号。此后双方的因缘存在很长一段时间。这份令人惊异的优秀，周围的扎夫特兵士对他的实力和功绩抱持强烈嫉妒的人也不少，但没有人注意到他其实是自然人;此事仅有杜兰朵与雷知晓。
C.E.71年，为了向创造自己而导致自身悲剧的人类和世界报复，克鲁泽利用地球联合对P.L.A.N.T.的战争，追求着升级为全面战争乃至于双方共倒，期望全人类相互屠杀至灭绝为止。为此克鲁泽多次努力计划，保持战局的均衡，以免形成对单方面有利。1月25日，克鲁泽莫视领导层的指令私自率领克鲁泽小队侵略中立的卫星“赫立奥波利斯”，夺取地球联合军最新型机动兵器“G兵器”五机中的四机;为扎夫特取得PS装甲与光束兵器小型化的技术，并在战后以此告戒扎夫特的高层，让他们开始意识地球军新技术对战况的威胁，加剧了双方的矛盾，而“赫立奥波利斯”亦在此战被彻底摧毁。
及后克鲁泽和他的克鲁泽队持续追击大天使号，并在追击中攻陷了阿尔缇蜜斯要塞和消灭了地球联合军第八舰队，使大天使号紧急迫降在地球上。
克鲁泽为了使战况更为平衡，决定将“Operation Spitbreak”作战的目标地点是地球联合军统合最高司令部的约书亚(JOSH-A)基地一事泄漏给身为敌方的联合军，招致5月8日联合军得知事件后，故意让扎夫军攻入并启动“独眼巨人系统”自爆，让扎夫特在地球的部队在阿拉斯加几近全数毁灭的事态。接着又秘密地入手扎夫特最新锐MS——正义高达(Justice Gundam)与自由高达(Freedom Gundam)搭载的中子干扰消除器的资料，再透过俘虏芙蕾·阿尔斯達之手将此机密送给蓝色宇宙盟主穆尔塔·阿兹拉埃尔，让地球联合军重拾核攻击能力，并在接下来9月23日的波亚兹攻略战，联合军得以用核弹迅速攻陷P.L.A.N.T.的宇宙要塞波亚兹，引发P.L.A.N.T.全体的愤慨。接着联合军于9月26至27日的第二次雅金·杜威攻防战再次对P.L.A.N.T.本国发射核弹，如此一来便轻易地引导阿斯兰·萨拉之父帕特里克·萨拉为报复而下令向联合军与地球发射伽玛线激光兵器“创世纪”，每一步都是为了报复人类陷入更恐怖的相互憎恨与屠杀的漩涡中。
在第二次雅金·杜威攻防战的后期，克鲁泽亲自驾驶同样搭载中子干扰消除器的神意高达(Providence Gundam)出击，首次于实战操作“龙骑兵系统”即展现压倒的战斗能力击坠联合军绝大多数敌机，并大破穆的突击高达和迪安卡·艾斯曼的暴风高达。在与基拉·大和的自由高达势均力敌的对决中，击毁芙蕾的救生舱，芙蕾之死令基拉陷入悔恨和痛苦之中，使其发动SEED能力。最终再次与基拉死斗，尽管最后神意高达在远程中重创了自由高达，但座机神意高达的驾驶舱仍在近战中被自由高达的光束军刀刺穿，随后卷入创世纪爆炸的风暴中被消灭，克鲁泽战死。
战后，基于尤尼乌斯条约的安排，地球联合与P.L.A.N.T.两阵营召开国际法庭审判每个战犯。此时克鲁泽在仍是嫌疑人死亡的状况下被认定为P.L.A.N.T.侧的战争罪人，具体罪状尚未明了。
在SEED爱好者中，拥有不同于一般反派脚色，憎恨世界的思想与逻辑非常鲜明的克鲁泽是一个广受支持者爱戴的角色。克鲁泽在许多场景的台词都深刻的点出了身为一个克隆人的孤悲：且被制造者唾弃、受诅咒般的短暂的生命因而对世界憎恨，发人深省的思考面让基因克隆人的话题拥有更多的解读。然而在被基拉击破的那一瞬间，克鲁泽带着笑容而逝的画面，说明了对他来说自己的死亡才是比起毁灭世界更为完美的结局。
在《SEED DESTINY》HD重制版，雷·札·巴雷尔被泰莉亚·格拉迪斯拥抱时，追加了他看到没有携带面具的素颜克鲁泽对他温柔微笑的一幕。这或许可以解读为透过死亡而解脱的克鲁泽对于雷的努力感到欣慰，并期望他也一同获得安宁。这亦是非常稀有的，拥有克鲁泽正面素颜的画面，而克鲁泽面容比起他实际上的28岁明显老上许多。
为本作系列的第一位面具男，似乎是向初代高达系列的“红色彗星”夏亚致敬。
基拉·大和(キラ・ヤマト，Kira Yamato)
配音：保志总一朗(日本);梁伟德 / 卢志杰(第二季)(中国香港);于正昇(中国台湾)
生日：C.E.55年5月18日
星座：金牛座
年龄：16岁/18岁
身高：165公分/170公分
体重：65公斤/58公斤
血型：A
种族：调整者
介绍：
故事第一季与第二季主角之一，为“GAT-X105 突击高达”及“ZGMF-X10A 自由高达”的驾驶员;之后在第二季驾驶“ZGMF-X10A 自由高达”及“ZGMF-X20A 突击自由高达”。
原居住于欧普的太空殖民地“赫立奥波利斯”，之后因为扎夫特发动攻击使得赫立奥波利斯沦陷而被迫卷入战火。
性格善良温和。
其双胞姐姐为出身自欧普的卡嘉莲·尤拉·阿斯哈;第一季后期与拉克丝·克莱因发展为恋人关系。
生父响博士将他当作“人造子宫”的实验体，得到前所未有的成功，而成为他口中所谓的“最完美的调整者”。
高达SEED前期
赫立奥波利斯的工业学院的16岁学生，在碰上进行夺取G兵器做战的克鲁泽队时，在避难中偶然开上了突击高达，实际上是为了成为最完美的调整者而诞生的超级调整者，MS战斗能力方面是经历过雅金·杜威战役、弥赛亚战役的最强驾驶员。
高达SEED后期
与阿斯兰战后受伤的基拉，在与拉克丝和马尔奇奥导师居住的时间中，思考自己战斗的意义。获得自由高达后，与拉克丝及大天使号合作，为了终止战争继续战斗。基拉将自由的性能最大限度地发挥，使之成为当时最强的MS。
高达SEED DESTINY
前次大战终结后与拉克丝在欧普的别墅隐居，在暗杀部队自主要暗杀拉克丝的事件，因而再次参战，最终与阿斯兰和解后共斗，在弥赛亚攻防战中打败了杜兰朵。
卡嘉莲·尤拉·阿斯哈(カガリ・ユラ・アスハ，Cagalli Yula Athha)
配音：进藤尚美(日本);曾秀清 / 庄巧儿(第二季)(中国香港);詹雅菁(中国台湾)
生日：C.E.55年5月18日
星座：金牛座
年龄：16岁/18岁
身高：162公分/164公分
体重：54公斤/48公斤
血型：A
种族：自然人
介绍：
为欧普代表首长(元首)乌兹米·那拉·阿斯哈的养女，而真实身份为基拉·大和的孪生姐姐;她在第二季升任为欧普首长兼三军统帅。
主要操作“MBF-02 嫣红突击高达”，并在第二季首位驾驶“ORB-01 晓”，只驾驶一次，其后将晓交予穆·拉·福拉卡。
第一季后期与基拉·大和的挚友阿斯兰·萨拉发展成恋人关系。第二季结局与阿斯兰感情去向未有一个明确的答案，但能确认两人战后为了相同目标努力。
迪安卡·艾斯曼(ディアッカ・エルスマン，Dearka Elsman)
配音：笹沼尧罗(日本);陈卓智、雷霆(代配)(中国香港);丘台名(中国台湾)
生日：C.E.54年3月29日
星座：白羊座
年龄：17岁/19岁
身高：176公分/180公分
体重：58公斤/67.5公斤
血型：AB
种族：调整者
介绍：
伊扎克的挚友。
在《SEED》中作为扎夫特军克鲁泽队所属，为参与GAT-X强夺作战的四名驾驶员之一，夺得“GAT-X103 暴风高达”并被任命为该机体的驾驶员。后与大天使号交战中被擒，囚于大天使号中而认识米蕾莉亚·哈乌。后因米蕾莉亚·哈乌之男友被阿斯兰·萨拉所杀而差点被米蕾莉亚杀死。后于第一次欧普保卫战前因大天使号出战而被释放，但已喜欢上米蕾莉亚的他决定要保护米蕾莉亚及大天使号而驾驶暴风高达出战。于第二次雅金·杜威攻防战中与克鲁泽的神意高达交战后被其击败，暴风高达被毁，其则被最后因友情而倒戈之伊扎克·焦耳救回大天使号。
在《SEED DESTINY》于雅金·杜威攻防战后迪安卡与米蕾莉亚分手，离开大天使号与伊扎克重回扎夫特，加入新成立之焦耳队，成为伊扎克之副手。由于前次大战中，在受到大天使号俘虏后成为其成员，因此扎夫特军方在他再次投军后，将他降职。(因此初期身穿一般士兵的绿色军服，以及驾驶的扎古战士未有专用涂装)，直到消灭镇魂曲任务时，才再次被擢升，所用MS亦改为瞬发型扎古幽灵，并加上专用黑色涂装。期间曾与因保护卡嘉莲而重回P.L.A.N.T.的阿斯兰会面，并一起拜祭战友尼可，期间曾力劝阿斯兰重回扎夫特，后曾与伊扎克和志保一起参与多场战役。在P.L.A.N.T.被镇魂曲攻击时未能及阻止，因而对镇魂曲非常痛恨，然而其后却目睹吉尔伯特·杜兰朵使用镇魂曲攻击地球联合军，因此于弥赛亚攻防战中，当阿斯兰与基拉来破坏镇魂曲之第一中转站时，他和伊扎克以及志保一起倒戈协助他们，及后更与伊扎克、志保掩护对弥赛亚进行攻击之永恒号，使其最终成功击毁弥赛亚要塞。
拉克丝·克莱因(ラクス・クライン，Lacus Clyne)
配音：田中理惠(日本);郑丽丽 / 莎拉(第二季)(中国香港);詹雅菁(中国台湾)
生日：C.E.55年2月5日
星座：水瓶座
年龄：16岁/18岁
身高：158公分/160公分
体重：53公斤/46公斤
血型：B
种族：调整者
介绍：
拉克丝·克莱因的名字(Lacus)在拉丁语中的意思是湖。在《DESTINY》中假扮拉克丝的蜜雅(Meer)呼应着拉克丝这个名字，因为蜜雅(Meer)在荷兰语中是“湖”的意思，同时是德语中的“海”或“洋”的意思。
为P.L.A.N.T.议长西盖尔·克莱因的独生女，素有“歌姬”之称，一心追求和平，之后与基拉·大和、阿斯兰·萨拉及卡嘉莲·尤拉·阿斯哈等人投身武装和平运动。
原本与阿斯兰有婚约，后来带领基拉盗取自由高达而被国家视为叛国，并解除与阿斯兰的政治婚约〈阿斯兰曾提及，自己对她的感情大部分来自政治婚约而非个人〉，在遇到跟她一样追求和平理念的基拉后，两人发展为恋人。
第二季在弥赛亚要塞覆灭后在P.L.A.N.T.国防部工作。