人吉 善吉(人吉 善吉(ひとよし ぜんきち)，声：小野友树)
本作的男主角。一年一班的学生，第98代学生会庶务。血型为AB型，狮子座，左撇子。
黑神目泷的青梅竹马，总是守护着目泷不让她受到伤害。曾发誓绝不会让目泷再次联想到当年的球磨川。
非凡的迟钝感让人感觉固执到不行，但经过了解后大多都会为其执著感到真心佩服。个性口是心非，习惯说反话，曾为了耍狠还特地去染黑头发。
本人并非拥有特别的才华，被称是“普通的普通人”，然因个性之故而积极努力，不会因别人做了什么而改变自己，是个被黑神真黑看好的男人。
经常能看出重要契机，而且因努力秉持着自己的信念而教导了许多人，只是本人不自觉。
拥有奇怪的穿着品味，不论是将运动服穿在制服里，或是母亲的诡异品味，都会将它视之为“时尚”。
基本体术是法国踢腿术(Savate)，所有踢击绝招几乎是从母亲教授的。与宗象形一战能看出通晓各种武器及结构性质。
于安心院的推举下，决定把陪伴黑神的方针，改为让她变回普通女生。其后以62%的支持度获取第100任学生会长资格。成为会长后戴上眼镜。
在‘向未来抛花篇’中为了欢送黑神目泷，举办‘百轮走’的活动并且参与。
第70箱发表第一回人气角色投票结果以554票当选第二名。
第113箱发表第二回人气角色投票结果以672票当选第八名。
异常性
欲视力
安心院于“球磨川事件篇”中为其追加。能够看见对方的视点，包括思想观点以及眼睛所见的一切影像。人吉自称“恶魔之眼”。
愚行权
安心院于“黑神目泷的后继者篇”中为其追加。消除机会主义的技能，也就是否决身为主角的强运与奇迹，不让偶然与运气等不确定因素干扰胜负。
改神模式 全吉型
受到不知火的“正食者”的帮助后修炼出的力量。
风格
由贽波 生煮转到人吉的风格，而人吉也运用这招击败了狮子目言彦。
安心院 驯染(安心院 なじみ(あじむ なじみ)，声：水树奈奈)
箱庭学园与烧瓶计划的创始人，AB型，与目泷、人吉同一间中学的女生。
迟来的两人之一。与半缠自称“恶平等”为人的态度十分沉静和善，实际是抱持着全部事物皆平等的逻辑概念，从人吉的“欲视力”中得知是“人”和“那边的橡皮擦”同等，并非鄙视，而是出于人和风景等没有区别的平等价值观，将自己以外的人一律视为平等。喜欢被诚称作安心院小姐。
拥有7932兆1354亿4152万3222个异常性和4925兆9165亿2611万643个过负荷，分别借给球磨川和善吉各一个技能，因此现在有1京2858兆519亿6763万3863个技能。战斗时背景都会变成她所使用的技能。
知道本作世界的真相，即“这个世界是漫画故事，跟现实毫无关系”的事实。因为这项理解，所以她曾得出一个“左右本作未来去向”的决定：黑神目泷已经以传统少年Jump主人公的身份，漂亮地守护学园的和平;所以为了化解这个美满带来的不平等，视为万恶的烧瓶计划要在她毕业后重新开启。这种思维方式类似诺斯替主义，在本作其他人物的眼中，是一种妄想症而认为现实是模拟现实的病症。后来亦因为黑神不希望自己和善吉被此等妄想支配，而肆意用完成技能，对安心院的部分设定重新洗牌，无视了这个真相。直至遇上狮子目言彦，这个想法才被重新提出。
穿着印有学年“3-C”的室内鞋。被球磨川称为最后的恋人，因为不明事理的原因而爱上安心院，因此尝试“如果扒光她的面容，是否还会爱着他”的理由真的将她致死，也因此触怒目泷以乱神模式解决事件，从此之后在他人的精神意识内出现。
少数能令球磨川赤裸裸地露出感情(憎恶、愤怒)的人。在每次球磨川死亡时现身，在意识中恢复因球磨川的过负荷而失去视力的善吉原来的视力，并借给善吉自己特殊的视力-“欲视力”。
3年前被球磨川以剧本制作能力封印住，因而无法出现在球磨川以外的人的梦里。后来以穿着巫女服般的装束，并且全身被大量的“剧本制作”的螺丝钉扎着的形象出场。后由于目泷拯救球磨川的心，使得插在身体上的复数“剧本制作”效果明显减弱不少，以至于能离开梦境行动、说话。
在人吉当上会长时，封印以全部解开，球磨川将解开封印的安心院称作“完全院小姐”。
在163话为了让黑神等人逃离狮子目言彦而留下来争取15秒的时间，最后被狮子目言彦仅用1根橡皮圈腰斩杀死。球磨川在与狮子目言彦战斗时死亡后，见到了安心院薰染的残像(?)，之后安心院讲两项遗物交给了球磨川，而因此在一次诞生出“弥天大谎”，以及新招“安心弥天大谎”。
第113箱发表第二回人气角色第一次参选投票结果以375票当选第十名。
黑神 目泷(黒神 めだか(くろかみ めだか)，声：丰崎爱生)
本作的女主角。一年十三班的特校生，箱庭学园第98代学生会长。15岁。身高166.2cm、体重56kg。三围：B98/W59/H87。
理事长不知火曾用骰子测试，结果发现全部骰子叠在一起的惊人异常结果。
被喻为是这个世界的“主人公”，千百年来难得一见的完美之人。
出生时便失去母亲。成长速度异常到出生半年身体就成长到如同5岁孩童般，并且能经过交战而快速习得他人的异常能力，对她来说没有不可能的事。由于成长过快，曾令自己感到如同罪恶般存在着，摸不清到底为何而存在。直至2岁时，在逃离医院的过程中认识了人吉善吉，并因他的一句“你一定是为了他人的幸福而存在着”成为她生存的意义。
与人吉善吉的关系密切，时而普通如下意识的忌妒人吉和不知火友好的可爱行径，必要时是严以自身的价值观(异常性)来审慎相信着他。之后有明白的说出自己喜欢人吉。
在感情方面略显迟钝，很多时候是单向，可以令单纯的小事情都变得不明就里。身为天才却完全否定天才的存在，相信努力的价值。异常的喜欢动物，但是动物都会回避她。
喜欢模仿他人的动作，并且能够理所当然的在执行部里换衣服。平时手上拿着扇子，心情好时会呈现“天晴”的字样。
为人处事秉持着改善他人的心而从未停止，不会因为讨厌的行为而讨厌行为者，是个为人着想或为相信他人而存在的存在。
‘向未来抛花篇’的最后当上箱庭学园新任理事长。
第70箱发表第一回人气角色投票结果以832票当选第一名。
第113箱发表第二回人气角色投票结果以992票当选第二名。
异常性
动物趋避
动物都会回避其令人恐惧的霸气。对异常喜欢动物的她来说，是一个莫大阴影。
完成
能够将与战斗的人的力量习得，并成长至100%的完全发挥，因而被称具有成为“完全的人类”的资格。若是完成能够连带身体能力都予以支配的王土，便能将身体能力提升至120%或更高。
建基的概念是“别人做得到我也能做到，简单的讲就是想变多强就多强”。
动物亲近(在最终回出现)
黑神目泷的真髓(善吉说)
真髓之一：俯视众生性善说
认为“别人所做的坏事都是因为环境所逼而造成的”，所以努力就可以使之导正。尽管建基的地方可能有错，但结果往往是比任何人来得正确。
真髓之二：傲娇
由前半段男性口吻般说些颇有深意的话后，瞬间转换成女性的质朴口吻的表现。强化善吉的重要事物。
真髓之三：过激的爱情表现
将所有人都当成是自己的家人，并用“强吻”的方式来表现爱意。这招曾经害死不少同届女同学的初吻，经过善吉的强迫而劝阻。
真髓之四：乱神模式
头发呈淡粉红色，是目泷能将力量发挥至极限的最强模式，通常是暴怒或者使出全力时才会发动，最后可以无须暴怒就发动。
完成能力衍生
改神模式
头发呈纯黑色，乱神模式的衍生，是可以凭自己意志发动，但一天最多只能发动三次。
废神模式
头发呈白色，效果跟剧本制作相同，可以让自己进入比任何弱小更弱，也因此无须考虑任何战斗技巧还能耐，毫无保留的去战斗，可以说是为了不做过头的模式。
这个技能原本是因应球磨川“弱者”的思维所提出的悖论想法的技能。
混神模式
头发呈一黑一白双色混搭，改神与废神这种一强一弱的搭配模式。
终神模式
甲贺卍谷
黑神幻影
黑神幻影 升级版
黑神幻影的强化版，可更加迅速爆发，不过无法在短时间内发动超过三次。
黑神平掌击
一瞬间的爆发力冲撞对手，因为黑神没有反射神经，使得她能做出不顾自己身体的夸张动作。不过此招重点是在移动速度，而非力量。
球磨川 禊(球磨川 禊(くまがわ みそぎ)，声：绪方惠美)
三年负十三班的学生，水槽学园的转校生，血型：AB型。小时候头发为白色，总是拿着一个诡异的兔子布偶。说话时会带有双引号，并将好的坏的感情乱七八糟的融入言辞而时常让人受不了，甚至重创他人的心。
喜欢尽说些容易戳破的谎言，根据人吉的发言，似乎有洁癖。但会无耻地表现色气的爱好，使后继者替补称他为“裸体围裙前辈”。后来又进化成比“裸体围裙”还变本加厉的“捂胸牛仔”，之后兴趣又变成了“完全裸体风衣”，但是却意外的受到黑神目泷后继者候补以及管理委员会委员长大刀洗 斩子的欢迎，甚至连喜界岛在故事中期对他越来越有好感，而在漫画番外篇中，他本人曾问过善吉“喜界岛有没有男朋友”这个问题，曾一度引起读者之间的讨论与遐想。
天生就是一个失败者，有着注定会失败的特殊体质。像是玩赤黑七列(类似牌七)时，全拿到A跟K的牌;考大学通通落榜等。
宣称自己本来很弱，事实亦有不少状况因未能发动过负荷而迅速败退，甚至在后期会找一些奇奇怪怪的理由而宣称自己输了，而某些关键时刻则是故意设局让自己输掉，进而达成真正的目的，可以说大部分是输了表面而赢了里子的奇特胜利。
完全让人联想不到的是他那重视同伴的心，初中时正因为下属阿久根的转变，才会导致和黑神对立。
与人吉善吉、黑神目泷和阿久根高贵为同一个初中出身，一直到成为学生会副会长前仍穿着水槽学院的校服，并曾经有以支持率0成为学生会长纪录(虽然很快就被罢免)，不过后来也因为他而被废校。
喜欢看周刊少年Jump，讲话时常常会说些有关周刊少年Jump的话。由于脑中都在想些极端思想，连行桥都无法透知，是最难预测行动的危险人物。
过负荷“弥天大谎”本来并非是自己的能力。初时安心院为了封印他，而用“掌心孵化”跟球磨川最初的能力“剧本制作”交换，没想到会以此作为原料，化为极度危险的“弥天大谎”。于是后来才在梦中交换回来，但那时候似乎已完全掌握开发技术，凭借自身之力获得真正力量。
出场过7月25日的庶务战、8月8日的会计战和最后8月22日的会长战。选举战结束后，在目泷的推举下成为学生会的副会长。
在‘向未来抛花篇’中为了欢送黑神目泷，而参与‘百轮走’的活动。
十年后行踪成迷，不过目泷说没有消息才表示他们都平安无事，喜界岛在当时也若有所思，但其中有参杂着一份信任的神情。
第70箱发表第一回人气角色投票结果以185票当选第十名。
第113箱发表第二回人气角色投票结果以3854票高票当选第一名(史上第一次球磨川打赢黑神的纪录，也因此第二回人气投票的彩页全是穿着裸体围裙的女生)。
根据作者西尾维新所说，该角色本来做为一个大反派已然差不多完成了他的任务，但后期的剧情塑造到了一个极致，也是因为在读者间的人气很高所致，被公认为日本漫画史上最成功的角色人设之一。
名言
‘不是我的错。’
‘即使和自己想的不一样，即使输了，即使赢不了，就算白痴也罢，被踩了也好，被踢了也好，悲伤也好，痛苦也好，贫弱也好，痛苦也好，艰苦也好，弱小也好，不正确也好，卑鄙也好，即使如此也要微笑，这才是过负荷!!!’
‘淡淡的友情，徒劳的努力，空虚的胜利，这就是我们负13班的口号!’
‘把所有的菁英都给杀掉就好了,这样的话,世界就平等而和平了。笨蛋什么也不会想,没有烦扰,更没有困惑。没有菁英的话,连忌妒也不会有了,每个人吃吃睡睡,多幸福啊!’
‘说人生是正负零的人,肯定是个积极的人,因为是个幸福的家伙,所以才能说出大彻大悟的套话啊!至少对于过负荷,我不认为因为有消极,所以就可以抵销掉积极,什么也没有,我也许只是希望,幸福积极的大家,能够明白消极的心情......’
‘因为有能力,所以能交到朋友;因为有能力,所以能努力;因为有能力,所以能得到胜利，这样绝望的现实,我作为有能力的人,都难以忍受啊!有能力的人会战胜无能的人,这就是世界的现实……我想赢过那些家伙!即使不帅气,即使不强大,即使不正确,即使不美丽,即使不可爱,即使不干净,我也想赢过那些……帅气,强大,正确,美丽,可爱,干净的家伙。即使没有被赋予才能,即使头脑不好,即使性格恶劣,即使学习跟不上,即使误入歧途,即使是废物,也想赢过那些富有才干、头脑、性格都很好,总是一帆风顺的家伙。交不到朋友就想赢过交到朋友的人;不能付出努力就想赢过可以努力的人;得不到胜利就想赢过可以胜利的人;不幸就想赢过那些幸福的人!即使是被讨厌的人!即使是被憎恶的孩子!即使是小角色!也想证明自己能演好主角!!!’
过负荷
纯属虚构/弥天大谎(All Fiction)
将指定的事物变虚构情况，用短小而粗的十字螺丝钉瞄准(实际上可以不需要，只是因为这样比较醒目而已)，而即是受伤、视力、死亡等都能变不见，不过变没有的事物无法变回来。作为调回最初的过负荷所而失去无的能力，成了只能随意使出螺丝钉的攻击。
剧本制作(Book Maker)
将强变弱的能力。使用的是更加残忍的加长巨型“一字”螺丝刺向目标，被命中的人不管肉体、精神、技术、头脑、才能都会跟球磨川一样“弱”，也就是“无能”。被剧本制作攻击成功的话，头发都会变成白色的。
安心弥天大谎
将弥天大谎、安心院死前所留给球磨川的掌心孵化以及另一遗物实力胜负所融合而成的技能。可以将变不见的事物在3分钟之后复原的技能。
虚数弥天大谎
球磨川在外传时新登场的能力，能够将抹消这件事都能抹消的能够复原一切的技能，为弥天大谎的升级版。