黑发的人物角色
白藤杏子(白藤 杏子(しらふじ きょうこ)，Shirafuji Kyouko) 配音员：日：皆川纯子(广播剧)、渡边久美子(动画)/港：陈凯婷 (第一季)→许盈(第二季)
瓦古娜利亚店长。28岁。于漫画第一话登场。原本是不良少女，连客人都不放过，似乎有很多只要打电话指挥便什么事都会做的便利小弟。
所有事情都不做，虽然身材苗条，却只要一有空便找东西吃，食量相当大。认为店内的食物全部是自己的东西，会派遣前述的小弟对付吃霸王餐的客人。行动时具备尽管稀少却有某种程度的店长责任感(从坚决反对在店里谈恋爱和驱赶欺负种岛的客人可见)。
高中时便认识了当时为小学生的轰八千代，从此生活起居便由她代为照料。对轰八千代没有恋爱感情，不过从只会分给她食物的行为看来，对她相当疼爱。
其实相当疼爱年幼的小孩，即便是非常饿了也没有抢小孩的蛋糕吃。
对年纪大与相关言词感到不愉快。
店内的工读生基本全是杏子采用的。
和在网路连载漫画中的店长榊研一郎认识，并三不五时会强迫对方请客。
音尾兵吾(音尾 兵吾(おとお ひょうご)，Otoo Hyougo) 配音员：日：中村大树(广播剧)、中田让治(动画)/港：刘昭文
瓦古娜利亚经理。37岁。于漫画第8话登场。
为了寻找妻子音尾春菜而在日本各地徘徊，偶而回店礼时会顺道带来一些和妻子样子很像的礼物，白藤杏子重要的食物配送人员。
立场上是店内最伟大的人物，但每次回去时，被种岛说“在不在都一样”、小鸟游宗太说“当成空气就好”、被轰八千代拿刀威胁、被白藤杏子遗忘(除了轰八千代以外都没有恶意)，受到残酷的对待，却没有解雇任何人，人品相当好。很少来到店里，却能靠著仅有的机会处理累积的工作，相当有能力。
除了小鸟游宗太和轰八千代以外的店员都是白藤杏子依照音尾的要求聘入的。
由于被山田要求成为其养女，最近连问题人物山田葵也成了烦恼之一，回到店里的频率逐渐降低。直到山田被其母亲找到并找回了妻子，不过存在感仍然低微。
在番外篇中透露高中时为没参加社团活动，但多次撞见迷路中的春菜，后来被缠上了而帮助其回家，最后变成了长期帮助。
松本麻耶(松本 麻耶(まつもと まや)，Matsumoto Maya) 配音员：日：川濑晶子/港：陆惠玲
负责瓦古娜利亚外场。18岁。于漫画第4话登场。为本作的隐藏人物之一。在本篇第四话时以背影方式登场。在作者网站的企划与人气投票时被问到“那家伙是谁”，后来在2007年10月号时的商务旅行时以主角的方式登场。
以平凡的人生为目标，具有不强出头的小市民思想。执著于平凡的原因是因为在国小的远足时，她的便当放了非常臭的鱼干，以为很正常的麻耶被朋友认真地说“那很奇怪”，从此心灵受到创伤，开始执著于平凡。
由于认为自己是平凡人而周围的同事都是奇怪的人，于是不愿与他们为伍(这也是松本剧情较少的原因)，但是相马说她却没注意到她在充满怪人的环境工作反而成为怪人了，被小鸟游宗太等人当成怪人。
在动画中总以路人般无声地短暂出现，只有在第一，二季的第13集有较长的出现并说话，于第三季第十四集最后有和众人一起拍摄团体照。
支仓孝平(支倉 孝平(はせくら こうへい)，声：无(游戏)、中本伸辅(广播剧CD)/小野大辅)
身高：174.7公分 体重：60多公斤 房间号码：2A-18
男主角，修智馆学院五年级生，由于父母工作的原因而有多次转学的经验，最后因为父母必须到国外工作的关系而决定转学到全体寄宿制的修智馆学院。小时候曾经在珠津岛住过一段时间，七年后的现在又回到岛上。长相不差，待人有礼的好青年，具有优秀的构思力和行动力。喜欢炒面，讨厌生姜。
疑似因为小时候在珠津岛上的某个意外事件而使体质改变，连带造成七年后与千堂瑛里华初次见面时让对方感受到异样的感觉，进而引发千堂伊织的兴趣，最后在千堂伊织的计画下，半强迫半自愿地加入学生会。
青砥正则(青砥 正則(あおと まさのり)，声：一条和矢/同左)
生日：1月15日 血型：O型 星座：魔羯座 身高：171.5cm
修智馆学院的男性化学教师，又被称为“青海苔”。孝平、阳菜、桐叶、司的班主任。
御法川 实(御法川 実(みのりかわ みのる)，Minoru Minorikawa，声优：日本：滨田贤二/中国香港：何承骏)
身高：175cm，国籍：日本。
职业是“Heaven杂志社”的采访记者。对采访工作有着坚持真相的追求，一直很想爆料独家大新闻的热血记者。由杂志社的头山社长委托照顾大泽玛丽亚。对玛丽亚而言，有如兄长般的存在。看起来有些狂人、怪人的个性，实际上是一位温柔体贴的人，对玛丽亚和矶千晶相当照顾。抵达中国上海后，遇到一连串怪离事件，开始着手调查，进而得知关于UA病毒、消失的村民、人体实验、中情局和犯罪组织合作…等一连串的内幕消息。
夏目 百合(夏目 ユリ(なつめ)，Natsume，声优：日本：皆川纯子/中国香港：谢洁贞)
身高：170cm，国籍：日本
电视动画原创角色。NGO组织“OWL”(鸮组织)的主要干部，动画版戏中对抗阿尔珐尔德领导的“蛇组织”。夏目的真实身份是日本防卫省情报总部综合情报部所属的少佐。日本情报局的高层人员，也是国际反恐会议的议员，游走世界的多重国际间谍。雇用迦南是为了抹杀阿尔珐尔德，意图夺取手中的病毒数据资料。立场性而言，亦正亦邪。自以为真实身份无人知晓，没想到阿尔珐尔德早已经查清底细;迦南透过共感觉知道夏目不怀好意，但是并未揭发夏目的底牌。最后夏目来个全面性背叛，带着数据回日本，离开了中国。要求美国军方的特殊任务部队SMU(全名：Special Mission Unit)销毁“工厂”的运作。提到的4153外交案件，指工厂破坏作战行动中，假设可以获得中华人民共和国政府的轰炸许可，其代偿是日本政府可以承诺对中国某事件的通过，其详细不明。
艾尔珐尔德·艾尔·修雅(アルファルド・アル・シュヤ，Alphard.Al.Shua，声优：日本：坂本真绫/中国香港：黄玉娟)
身高：167cm，国籍：阿富汗，年龄：动画21岁、本篇19岁。年幼时期12岁、身高150cm
本作反派，国际恐怖组织“蛇”的实质首领，迦南的宿敌。容貌出众、天赋过人，个性狡黠、冷血无情，为人处事经常不照常理出牌，让人摸不着头绪的智能犯罪高手。精通多国语言，有着丰富的经济学知识和破解密码等专长。格斗体术超凡，主要武器是FN Five-seveN USG手枪。
涩谷事件，新加坡动用调虎离山之计，将迦南引诱骗到新加坡，拖延迦南前往东京救人的步调，等待涩谷事件沉寂落幕后，入股DAEDALA(戴达拉)公司，控股民间军事保安公司的幕后老板，甘明治担任公司表面上的负责人，由部属梁琪担任秘书负责监视甘明治，筹备两年时间，入侵了在上海举行的国际反恐会议，制造恐怖活动。
真正的姓名不详，Alphard的含义为“蛇的心脏”，欧洲天文学家把“Alphard”称作“Cor Hydrae”，意为“蛇的心脏”，长蛇座心脏(α星)古阿拉伯人又形象称之为“孤独者”。幼年接受军事训练，监护人萨岩给她取其新名字为Canaan，后来自己改名称为Alphard，电玩迦南篇出任务时，以Sadaka这个假名代号自称，Sadaka中译萨达卡意思是“施舍者”，源自伊斯兰教中的“天课”。(注：原著428中为Alfard，动画写为Alphard，两个都可用)。每个人都有自己的名字，一个人的名字多半是父母对孩子的期待，名字也是婴儿降生在世上被赋予的第一份爱。Alphard原本的家庭和真正名字已从历史纪录中被抹消掉，老兵萨岩为了孤儿的她另起一个新名“Canaan”，一个新名字是一个新的身份，新的名字进入新名的呼召和命定，萨岩期许她的人生会和名字意义一样。为了不辱名字的意义，持之以恒的训练，付出极大努力。自称舍弃了“Canaan”之名，其实内心很在乎“Canaan”这名字。
先代组织首领阿布·尼达尔死后，Alphard接下弱小组织，壮大成武装集团-“蛇”，“蛇”在世界各地泛指魔鬼诱惑的化身，也是神秘黑暗的代表，是原罪也是力量的象征，在中东地区“蛇”被视为邪恶与智慧的形象，刻在左手臂的纹身即是“蛇”纹。两年前涩谷恐怖事件的元凶，世界各地引起各项恐怖活动，游走国际兜售军火，进行生意上的获利。夺取UA病毒，开发病毒力量，和中情局在偏乡进行人体实验研究，企图制造出最强异能战士，Alphard为出资者身份，整个花园计划为部属梁琪主导。
出生显赫背景的中东名门望族，阿富汗前王室成员，大家长父亲贩售军火却不使用武器，偏好繁琐的政治手段，崇尚和平理念，父亲和兄长过于重视人性与社会良知，努力想成为开明的领袖，对敌人过于仁慈的下场，不幸遭来政敌迫害，暴力政变中家人全数战死。父亲政争的失败，使她不得不逃离，家逢巨变失去原本地位、失去原本姓氏，丧失了原本国籍。公元2001年爆发阿富汗战争，这一年Alphard年龄12岁，父亲将幼年的她藏在地下室而逃过死劫，该家族唯一幸存者，数日后被父亲的残存部属救了出来，救出她的大人们把她送到萨岩那里，继承父母亲的遗产和人脉的她，以报酬作为代价，佣兵同意收养她，承诺培训作为一般意义上的到达”专业”这一领域的人们。导师对该名学生的智力超群和优秀潜质寄予厚望，期望学生有过人成长，重新赐予孤儿学生，一个了不起的"新名字"-“Canaan”。面对监护人给的设定，Alphard带着期盼压力，想证明自己的能耐高低，砥砺自己一切种种成为出类拔萃的佼佼者是理所当然。
导师萨岩形容Alphard：‘没有瑕疵、是完美的。只要不犯错，就不会召来失败，但你所走的那一条道路是错误的。’，原本贵为阿富汗公主，从王室沦落为异乡的难民，以犯罪天才自居，在憎恨中诞生的战士，其坚决好斗、残酷报复的性情，导师全然不认同学生是正确的。经历血腥屠门，年幼时期产生的心灵创伤之延续，使她的内心世界筑起一道很高的心墙，不允许别人靠得太近，强大外表的背后是个脆弱的自我，对任何人保持距离、戒心很重，面对训练她数年的男人萨岩的保护、指导、安抚、陪伴与照顾，使其心墙软化，娃娃兵时代对恩师产生了依赖和信任，和迦南一样，尊敬着萨岩，高傲自尊心底下有些话只能止于唇齿，不能正确表达感受，喜欢把感情放心底。
师徒三角关系中，Alphard认为自己是不被爱的的第三者，根源于Canaan的出现，使自己无法获得导师关爱的眼神，煽起仇恨值，没太多意识到自己被导师背叛。最后，设一个诡计，杀害了导师，随后告别中东解放战争和中东基本教义派，流亡各国从事地下活动，不受任何约束、为所欲为，抛弃了过去、投身纷争，制造战乱，没有任何区别性的向这个世界散布战争的火种，带领犯罪组织引发多起混乱世界秩序的复仇的火焰。
手刃尊师以后，人生犹如一潭死水，心魔(亡灵诅咒)长年困扰着她，十分讨厌被感情自扰，心中的迷惘对萨岩和迦南却又难掩幽幽感情流露。嘴里嚼著无味的菜，面对迦南向着她拔枪，难掩心中的兴奋感，对于同门师妹迦南，心中藏有多种复杂感情，嫉妒又憎恨;欣赏又痛恨，同门手足的感情出现了一个灰色地带-暧昧。迦南的死缠烂打并不讨厌，迦南寻找复仇机会的想法更会让她感到快乐，享受战斗快感，一种‘找乐子、寻消遣’的心情。
涩谷篇遭到美国中情局杰克上司“戈登”的逮补，透过非法手续入关美国。戈登是被蛇组织收买的中情局高层，以其他名义放走了Alphard，电视动画版从夏目百合语中获知，戈登已经遭到中情局内部调查而被处置。
没有饮酒的习惯，遵守不饮酒教义。动画第四话，举杯干杯时以饮料替代红酒。性格虽然叛逆，但在某方面习性上，例如穆斯林女性佩戴头巾，仍遵守着民族信仰。
华园光(はなその ひかり Hanasono Hikari)
声优：后藤邑子、浅野真澄(广播剧)
名次：学年二位(万年第二)
生日：3月20日(双鱼座)
身高：166cm
年龄：17岁
血型：O型
喜欢的人：泷岛彗
超级有精力，元气十足，但也极端迟钝的女主角。
“对这种小事这么敏感，对自己的事却那么迟钝。”(泷岛语) “总爱管别人的事，可对自己的事却察觉不到。......”(八寻语)
把泷岛当作是最大的竞争对手(因为从小到大从来都没赢过泷岛)成绩是学年的万年第二，心中一直不忘小时候的屈辱，整天为了打倒泷岛而努力。被泷岛彗戏称为“万年第二名”而激起好胜心，在各方面对泷岛奋起直追。但在八寻告诉她要想让彗高兴就吻一下他后，竟真的这样做了，其实喜欢泷岛不过她却意识不到自己的感情。但在生病的时候就会性格180度大转弯变得很黏泷岛，裹成毛虫状也不忘找他，但是病好之后完全没有这段记忆。后来直到泷岛离开S·A转学去了伦敦才发现，他对自己来说是特别的，不仅是作为永远的竞争对手。最后和S·A其他人一起去找彗，并带着彗回到了S·A。
注：称所有S.A的人都用名，但一直称彗(名字)为泷岛(姓)，原因是小时候认为不能对竞争对手叫的太亲昵。
香织(香織さん，声：浅沼晋太郎、桧山修之)
LoveDoll，俗称的情趣娃娃。价格昂贵，外表有如真人般美丽。是城崎的所有物，被倾注了大量感情。
许多的敌对社团或与城崎有过节的人都在觊觎其人偶，最后也因此引发了“香织诱拐事件”。
一度成为主角“我”的另一人格强尼使其发生关系的对象，但是因为“我”太犹豫拖了太久，最终被听到消息后赶来的城崎及时阻止。