东京篇

主角绯村剑心流浪至东京，因为神谷薰的挽留而留在东京。其后认识了明神弥彦、相乐左之助及高荷惠等人，又与前幕府杀手鹈堂刃卫、御庭番众首领四乃森苍紫决斗，其间剑心经历了多次战斗，令剑心自觉慢慢变回昔日的刽子手拔刀斋(千人斩拔刀斋)(人斩り抜刀斎)。最后在与幕末时代的对手前新撰组第三小队组长斋藤一决战及得知志志雄一党的阴谋后，独自前往京都与志志雄一党对决。(漫画、电视动画)

京都篇

前维新志士志志雄真实及他的同党正在秘密活动，目的是推翻明治政府，由他带领日本成为强国。剑心为了阻止志志雄的计划得逞，独自离开东京前往京都。后来剑心的同伴亦逐一赶到京都寻找剑心，剑心从师傅比古清十郎身上学会飞天御剑流的最终奥义“天翔龙闪”后，与其同伴相乐左之助及斋藤一、四乃森苍紫联手，终于打败了志志雄一党。(漫画、电视动画)

漫画及电视动画的东京篇及京都篇在故事上大致相同。在京都篇完结后，由于当时漫画只是刚开始连载人诛篇，跟不上电视动画的制作进度，因此电视动画另行制作了岛原篇、胜海舟篇、由太郎篇(黑骑士团篇)及风水篇。但受到原作版本的读者批评与原作版浪客剑心的世界观相异，因此后期收视不太理想，在风水篇后便终止制作。

追忆篇

故事发生于剑心在幕末身为长州派维新志士时担当刽子手的年代(东京篇之前的故事)。故事讲述剑心与第一任妻子雪代巴的过去，解明了剑心左边面颊的十字疤之谜。OVA故事共分四幕，第四幕尾段雪代巴为阻挡敌人向剑心发出最后一撃的同时，亦被剑心一剑杀死，临死前用自杀的小刀在剑心面上划上一刀，与未婚夫清里和剑心死斗时划下的一刀，交织成剑心脸上的十字疤。漫画版的追忆篇连载于人诛篇初期剑心的回忆自述，而OVA则独立讲述剑心的过去。(漫画、OVA)

OVA版本的追忆篇内容虽然与漫画原著并无太大出入，但其风格却与之前的电视动画版大大不同。彻底摆脱了少年漫画的风格，特别是拔刀斋出招时其没有像过往一般大喊出必杀技名称，而一般很难于少年漫画及电视动画中出现的大量血花四溅的残酷场面亦一一呈现。坊间对此等手法毁誉参半，例如其血腥露骨的场面可能不适合原作的主要读者(小学生、中学生)，但亦得到一般未看过原作的人支持。而本作于日本海外评价亦相当高，在美国的销售亦曾登上全年DVD销售榜的第7位。

人诛篇

雪代巴之弟雪代缘当年亲眼看到姐姐死于剑心的刀下，长大后集合了“六人同志”，向剑心展开复仇行动(在上海流浪垂死之际被好心日本家庭收留，却因为只想练能攻克剑心武功的念头而杀死对方一家并取走武功秘笈单刀法而自练出倭刀术以及其绝招虎伏绝刀势)。由于雪代缘的阴谋，使剑心一度以为神谷薰被杀而意志消沈(神谷薰之死令当时少年JUMP周刊的读者引起一阵回响)。最后剑心回复斗志并打败雪代缘，雪代缘持着其姊的日记消失在剑心等人面前。(漫画)

番外篇

结束连载以后以SP模式连载两个番外篇，分别是《早春樱花》及《弥彦的逆刃刀》。前者提到了结局之后众人各自的新旅程，如左之助的世界一圈之旅到了蒙古。后者是弥彦以神谷活心流行侠仗义的活跃篇。

第零幕

2012年初由日本漫画杂志“JUMP SQ”公开了《浪客剑心》将于八月号开始推出新连载《第零幕》，与1999年结束的连载相隔十三年的新篇章。

北海道篇

2017年9月连载的新续篇，故事发生在“人诛篇”后5年(1885年)，绯村剑心和神谷薰动身前往北海道寻找薰的父亲神谷越路郎，同时和环游世界回来的左之助、在日本流浪的宗次郎、在北海道服刑的安慈、与调往北海道的斋藤一重逢。就连新撰组的永仓新八，也将在“北海道篇”出现。

时间是1990年代至2000年代的日本，远野贵树与篠原明里原本是同班同学的好朋友，自从小学毕业之后，两人因搬家都没有再见一次面。分隔两地的两个人，靠着书信往来保持联络，直到贵树知道即将跟随家人搬到鹿儿岛，距离明里更远的地方，于是两人约定了再见面的时间。计划好的行程，却遇上了暴风雪。之后大家都长大了，各有各的生活，但对彼此的思念，一直留在心中。

本片由三个故事构成，分别是〈樱花抄〉描述贵树和明里的重逢、〈宇航员〉描述在别人眼中的贵树、〈秒速五厘米〉描述之后他们各人的生活事情和贵树内心的徬徨。

本作品是由〈樱花抄〉、〈宇航员〉、〈秒速五厘米〉3篇短编故事构成。

樱花抄(约28分钟)

东京的小学生，远野贵树和篠原明里是青梅竹马的朋友。小学毕业之后，原本与贵树考上同一所中学的明里因父母工作关系突然要转校至栃木县下都贺郡岩舟町，在那之后只能通过书信联络。升上初中后的第一年冬天，因父母工作关系需转校到鹿儿岛县种子岛的贵树，与明里在信中约定，于转学前的数天乘坐火车前往栃木县下都贺郡岩舟町车站见面，但是他们相约见面的那天，却下起了大雪……

宇航员(约22分钟)

种子岛的高中生澄田花苗自初中以来就喜欢上了从东京转校过来的同学远野贵树，却一直无法说出口。花苗知道了贵树要前往东京升读大学后，打算将心意诉说出来。日本的探索卫星也在这段时间于种子岛宇宙中心地发射……

秒速五厘米(约15分钟)

根据小说设定约发生在樱花抄的15年后，远野贵树大学毕业后，选择一个人在东京工作，但不知道是什么原因，他的心好像被什么束缚了一样。通过主角已成为大人的自问自答以及借由贵树生活情境的画面快速切换，将贵树心灵的彷徨感表现得淋漓尽致。最后贵树终于和明里在小时候曾约定的平交道上偶然擦身而过，但在电车自两人间通过后，明里离开了。而贵树也决定潇洒地转身走向属于他的未来。

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故事发生于1935年，一个能够预感世界即将风云四起的时代。

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长时间的假期就要结束,新的学期就要开始,

站在讲坛上的新校长,在迎接结束了休假而回到学校的学生们

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