某一天，成为大财阀财产继承者的女高中生富士原苗香，在本人不知道的地方性命被企图抢走财产的人盯上。于是，为了保护苗香到继承财产的18岁生日之时，也为了撑起做饭洗衣等生活能力为零的苗香的生活，一位具备高超战斗能力，并且能够每天侍奉好苗香的强大“女仆”被派遣来了——其名为，男仆·寒风。他是位运用弯曲的身躯和各种古怪的必杀技解决一切纠纷的“超级男仆”。今天也刮起了名为侍奉的暴风雨。

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故事设定在24世纪。彼时人类在火星上进行地球化改造工程，由于两极冰帽融解的水量超乎预期，全星球有90%被海洋覆盖，因而被称为“水星”(Aqua)。在此星球上有个以过去被称为“水都”的威尼斯为范本所建造的城市新威尼斯(Neo-Venezia)，因其仿古的建筑与承袭传统的生活方式而广受观光客喜爱;而其中有一种驾驶贡多拉穿梭于运河之间、带领观光客游览整座城市的职业，称为领航员(Undine)。

出身于地球(故事中称为“行星Manhome”)的水无灯里，以成为能独当一面的领航员为目标而来到新威尼斯，在“亚利亚公司”(Aria Company)见习;身为半熟手的她，每天都持续练习操控贡多拉及观光导览。《水星领航员》便是在描写灯里以及她身旁的朋友在一年四季中的日常生活点滴。

在本作品里出现的Undine(本意为水之精灵温蒂妮)指的是专为观光导览的贡多拉操控者。能从事的只有女性，是Aqua的明星职业。

领航员手上是否有戴手套为能力的指标：见习生的手为双手套(Pair)，半熟手为单手套(Single)，能独当一面的老手则无手套(Prima)。这是因为有本事的领航员不必使用过多的力量即可操控贡多拉、手也不大会起水泡，所以也就没有戴手套保护的必要了。

Pair 升级 Single 的测验是操控贡多拉到达称为“希望之丘”的地点，而此为测验内容、其位置与路程皆禁止泄漏;要升格为Prima，虽须通过贡多拉协会特定的考验，但升级并无明确标准，一般是交由各家公司或负责指导的前辈，关于测验的方法或标准完全由主考官决定。Prima 的平均升格年龄为18～20岁，成为 Prima 后便可允许为自己取个通称。

可以自由营业载客的只有无手套，单手套需有负责指导的无手套陪同。渡船(Traghetto)则允许单手套自行营业的，费用上比起Prima 较为便宜，也是由于 Prima 所操控的贡多拉较为安全之故。灯里经常使出“不收取费用，而以朋友的名义乘船”的钻漏洞招数，因为“规则上所禁止的是单手套以下的领航员所控船之营业行为，并非禁止让人一同乘船”，而周遭的人们也会默许。此招的发明者是以消磨时间为目的而想免费乘船的看火人阿晓;动画里的发明者则是小爱，只是后来阿晓也免费乘船。此外，单手套也能以助手的身份搭乘无手套所操控的贡多拉，动画中却有身为双手套的艾里须搭乘雅典娜或晃所操控之贡多拉的场面，小说里同样也有雅典娜的贡多拉让艾里须搭乘的情况。在月刊Undine第3集(18月号)里，艾里须操纵贡多拉，却在有雅典娜搭乘的情况下接受采访，想来也是用这个招数来随机应变。

领航员的制服为统一，夏天为类似水手服的衬衫(亚利亚公司的设计有很大的不同，衬衫的前襟为西服领，只有后领还保留水手服的形式)、贴身衣则为下䙓带有开口的连衣裙，再加上帽子、鞋子、和半指手套，胸口系上领结;冬季服饰方面，从长袖连衣裙的上面、肩膀的地方披着系有领结的短斗蓬(手套的设计也和夏天不同)。每家公司的服饰花样、帽子、领结、鞋子、手套、及连衣裙下䙓的开口位置不尽相同，成为各家公司的特色。另外在袖子和帽子上则带有各家公司的标识。

对他人目光极度恐惧，只要一成为众人目光的焦点时就会紧张地讲不出话来的主角－麻井麦，却意外地加入了戏剧研究会。麻井麦到底可不可以克服目光恐惧症，顺利地登上舞台呢？

麻井麦（树元织江 配音）是一个平凡的15岁少女，就读于熊鹰艺术学院。小麦是一个性格非常内向的女生，一旦在人多的场合就会双颊通红说不出话来，对自己的能力极度缺乏自信。然而，这样一个害羞的女孩，却在误打误撞之中加入了学校里的演戏研究会。在众人面前连话都说不利索的她，又怎么能够在舞台上进行表演呢？

对小麦给予了无限信任的远山佳代（宫川美保 配音）、外表冷漠内心火热的学姐一之濑野乃（川澄绫子 配音）、性格开朗淘气的西田甲斐（岸尾大辅 配音）、每天都元气满满的活力少女西田理咲（氷上恭子 配音），在学校里，小麦结识了一干志同道合的好友们。

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