居住在海明星平凡的高一生“加藤茉莉香”，死去父亲的部下突然要求她担任宇宙海贼船“辩天丸”(弁天丸)的船长。由于1世纪前独立战争颁发的私掠许可证规定船长一旦死亡，继任条件须为直系子嗣，高中女生兼宇宙海贼船船长的冒险生活从此展开……
用语
星球、设施
海明星(海明星)
位于 “天仓五星系”(鯨座宮たう星系)的第三行星。是一个已开发的星球，亦是主角——加藤茉莉香所居住的星球。
白凰女学院(白凰女学院)
名门女子学校并设立初中、高中部，在 “太秦星系海森星”(ウズマサ星系海森星)也有分校。位于海明星新奥滨市的郊外地区，亦是加藤茉莉香就读的学校。
油灯咖啡馆(ランプ館)
位于新奥滨市的运河沿岸，由仓库改造以仿古风天井油灯照明的咖啡馆。加藤茉莉香兼职的地方，但在就任辩天丸船长后就没常去兼职。
国家、星系
塞雷尼提联合王国(セレニティ連合王国)
历史悠久、由塞雷尼提王室管理的星际国家。格里埃尔是塞雷尼提王室第七正统皇女，而格琉希尔德是第八正统皇女。
银河帝国(銀河帝国)
一个有银河系数十亿个星球加盟的星际国家，海明星亦包括在内。
动画原创现由女王统治。
其他
宇宙海贼(宇宙海賊)
一世纪前海明星独立战争爆发，海明星的独立政府为使脆弱的战斗力得以提升，便发出了私掠许可证，使当时的宇宙海贼可名正言顺掠夺星际联合的舰船。
由于由宗主星系和殖民星幕后组合的银河帝国反而将宗主星系和各独立星系征服，各星系的战争就此结束，但由于海明星的海贼是属于海明星政府承认的武装力量，和作为历史的记录，现在作为一种特殊的表演行为被保留，客船通过保险公司购置相应“保险”作为支付表演费，由保险公司指派相应海贼进行“劫持”表演，所缴“赃款”要上缴海明星政府作为税款，和由保险公司作为“赔偿”返还客船乘客，保险公司支付演出费给海贼。除外，海贼也被视作军队，也要遵守相应守则。
动画原创海明星抄袭银河帝国承认海贼存在，当年帝国也有些海贼到海明星打仗赚外快，资历仅次原始七船;也原创其他海贼，例如“银狐”、“Big Catch”、“铁胡子”等。
原始七船(ァ￡ジナルセブン)
海明星发生独立战争时，最初获得“私掠许可证”的七艘海贼船，亦被称为传说之七船。
辩天丸(弁天丸)
前任船长︰权左卫门加藤
现任船长︰加藤茉莉香
原作、动画版造型迥异;漫画版沿用动画版设计。
巴巴罗萨(バルバルーサ)
现任船长︰栗原见城
原作即单圆胴设计，与动画版辩天丸相同。
奥黛塔二世(ァ∏ットII世)
以前是海贼船，原名字为“白鸟号”(白鳥号)，能使用太阳帆推进。现在是白凰女学院的练习用船，母港于海明星中途站。
黑鸟号(黒鳥号)
长命种(長命種(メトセラ))
短命种(短命種(ショートタイマー))
比种别平均寿命多一倍的种族称为长命种;反之未达平均寿命一半的种族则是短命种。例如塞雷尼提星系王室枢密院侍从长约特夫属长命种。
动画版未提其设定。
星云杯(ビュラカップ)
动画原创每年举行一次的杯赛，由星云杯运营委员会管理。
六年前，白凰宇宙风帆部某两位学姐在星云杯举行前得到未公开的赛程情报，并认为路线太简单，于是拜托当时还是初中的琳·兰美达，更改星云杯运营委员会的数据，把路线的难度提升。到了比赛当天，因为路线被更改，令该届比赛只有两名参赛者能完成整个赛程(该届比赛的参赛者为142人)。比赛后运营委员会追查路线被更改的原因时，发现是白凰女学院所为，因此被停赛五年以作为惩罚，而该届比赛亦被称为“恶梦的第十三届大赛”。
比赛规则：参赛者使用风帆船，由星云杯运营委员会所在的中途站降落至风凪星，然后依照比赛前发出的路线图到达行星上的数个检查站，最快完成比赛的为之胜出。
海贼巢穴(海賊の巣)
动画原创。以前海明星的宇宙海贼举行海贼会议的地方，周围遍布小行星带、气体云和星际物质。
用语
| 集数 | 日文标题 | 中文标题 | 剧本 | 分镜 | 演出 | 作画监督 | 改编 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SAILING 1 | 海賊、罷り通る | 海贼，招摇过市 | 佐藤龙雄 | 大脊户聪 | 竹内浩志 | 第1卷 | |
| SAILING 2 | 私の力、海賊の力 | 我的力量，海贼的力量 | 水本叶月 | 仓田绫子 | |||
| SAILING 3 | オデット二世、出航！ | 奥黛塔二世，出航！ | 佐藤龙雄 | 下田正美 | 佐佐木奈奈子 | 杉村友和 寺尾宪治 |
|
| SAILING 4 | 決戦は深夜 | 决战在深夜 | 大脊户聪 | 山下英美 | |||
| SAILING 5 | 茉莉香、決意する | 茉莉香，下定决心 | 西村聪 | 近藤一英 | 大河内忍 | ||
| SAILING 6 | 茉莉香、初仕事する | 茉莉香，首次工作 | 佐山圣子 | 福岛利规 | 福岛丰明 伊佐英朗 兴石晓 |
||
| SAILING 7 | 平穏ままならず | 不得安宁 | 岛津裕行 | 室谷靖 | 小谷杏子 吉川真帆 |
第2卷 | |
| SAILING 8 | 姫と海賊 | 公主与海贼 | 森健 | 筑紫大介 | 今西亨 | ||
| SAILING 9 | 華麗なる船出 | 华丽的起航 | 小野胜巳 | 水本叶月 | 伊藤真理子 | ||
| SAILING 10 | 嵐の砲撃戦 | 暴风雨的炮击战 | 佐山圣子 | 大野和寿 | 高乘阳子 山村俊了 |
||
| SAILING 11 | 閃光の彷徨者 | 闪光的徬徨者 | 伊藤达文 | 伊藤真理子 | |||
| SAILING 12 | 永遠よりの帰還 | 自永恒回归 | 西村聪 | 室谷靖 | 山下英美 盐川贵史 |
||
| SAILING 13 | 茉莉香、招待する | 茉莉香的招待 | 下田正美 | 大脊户聪 | 大河内忍 寺尾宪治 |
||
| SAILING 14 | 茉莉香、募集する | 茉莉香的招募 | 伊藤美智子 | 岛津裕行 | 大野和寿 | 中野彰子 | 第3卷 |
| SAILING 15 | 密航出航大跳躍 | 密航出航大跳跃 | 仓田绫子 | 伊藤真理子 | |||
| SAILING 16 | 初仕事！白凰海賊団 | 初次工作！白凰海贼团 | 筑紫大介 | 小谷杏子 | |||
| SAILING 17 | 意外な依頼人 | 意外的委托人 | 室谷靖 | 泉保良辅 | |||
| SAILING 18 | 打ち上げはジュース | 庆功宴上必备果汁 | 大脊户聪 | 今西亨 | |||
| SAILING 19 | 四人の絆 | 四人羁绊 | 水野健太郎 | 佐佐木奈奈子 | 羽多野浩平 | 安藤正浩 | 原创 |
| SAILING 20 | 茉莉香、波に乗る | 茉莉香，乘风破浪 | 宫崎真一 | 安田贤司 | 近藤一英 | 盐川贵史 伊藤真理子 |
|
| SAILING 21 | 決戦！ネビュラカップ | 决战！星云杯 | 西村聪 | 筑紫大介 | 大河原晴男 山下英美 |
||
| SAILING 22 | 海賊狩り | 狩猎海贼 | 佐藤龙雄 | 室谷靖 | 泉保良辅 | ||
| SAILING 23 | 目指せ！海賊の巣 | 目标！海贼巢穴 | 水本叶月 | 大河内忍 馆崎大 |
|||
| SAILING 24 | 傷だらけの弁天 | 伤痕累累的辩天 | 下田正美 | 羽多野浩平 | 松下纯子 福世孝明 |
||
| SAILING 25 | 開催！海賊会議 | 召开！海贼会议 | 佐藤龙雄 | 大野和寿 | 小谷杏子 今西亨 |
||
| SAILING 26 | そして、海賊は行く | 尔后，海贼行 | 仓田绫子 | 竹内浩志 | |||
1998年，本应在90年代初结束的冷战因为种种原因而没有结束，这是一个铁幕依然存在的时代，美苏两个超级大国仍然在明争暗斗，世界依然被铁幕分成东西两大阵营，大国间虽然没有进行大规模的军事行动，但是各个小国间的战争和冲突依然不断发生，而各国的情报人员也进行着残酷的间谍战，而原本应被装甲车和战斗直升机支配的战场因强袭机兵“Arm Slave”的出现而发生很大的变化。
幼年遭遇飞机事故，因而在阿富汗长大的男主角相良宗介中士是神秘的国际组织秘银特殊部队成员，专门在世界各地即将发生战争或武装冲突的地区执行组织下达的秘密任务，对抗恐怖份子，缓救人质，化解各式各样危机。
而宗介最新的任务要尽快前往日本，任务内容为伪装成高中生潜入都立阵代高校，去保护一位16岁的女高中生千鸟要。这位少女似乎和普通的女高中生没有什么两样，但不知什么原因却成为各国间谍秘密争夺的目标。为了保护千鸟，宗介驾驶着80年代末才在战场中出现的新式兵器--强袭机兵“Arm Slave”与其他神秘组织对峙。