东京篇

主角绯村剑心流浪至东京，因为神谷薰的挽留而留在东京。其后认识了明神弥彦、相乐左之助及高荷惠等人，又与前幕府杀手鹈堂刃卫、御庭番众首领四乃森苍紫决斗，其间剑心经历了多次战斗，令剑心自觉慢慢变回昔日的刽子手拔刀斋(千人斩拔刀斋)(人斩り抜刀斎)。最后在与幕末时代的对手前新撰组第三小队组长斋藤一决战及得知志志雄一党的阴谋后，独自前往京都与志志雄一党对决。(漫画、电视动画)

京都篇

前维新志士志志雄真实及他的同党正在秘密活动，目的是推翻明治政府，由他带领日本成为强国。剑心为了阻止志志雄的计划得逞，独自离开东京前往京都。后来剑心的同伴亦逐一赶到京都寻找剑心，剑心从师傅比古清十郎身上学会飞天御剑流的最终奥义“天翔龙闪”后，与其同伴相乐左之助及斋藤一、四乃森苍紫联手，终于打败了志志雄一党。(漫画、电视动画)

漫画及电视动画的东京篇及京都篇在故事上大致相同。在京都篇完结后，由于当时漫画只是刚开始连载人诛篇，跟不上电视动画的制作进度，因此电视动画另行制作了岛原篇、胜海舟篇、由太郎篇(黑骑士团篇)及风水篇。但受到原作版本的读者批评与原作版浪客剑心的世界观相异，因此后期收视不太理想，在风水篇后便终止制作。

追忆篇

故事发生于剑心在幕末身为长州派维新志士时担当刽子手的年代(东京篇之前的故事)。故事讲述剑心与第一任妻子雪代巴的过去，解明了剑心左边面颊的十字疤之谜。OVA故事共分四幕，第四幕尾段雪代巴为阻挡敌人向剑心发出最后一撃的同时，亦被剑心一剑杀死，临死前用自杀的小刀在剑心面上划上一刀，与未婚夫清里和剑心死斗时划下的一刀，交织成剑心脸上的十字疤。漫画版的追忆篇连载于人诛篇初期剑心的回忆自述，而OVA则独立讲述剑心的过去。(漫画、OVA)

OVA版本的追忆篇内容虽然与漫画原著并无太大出入，但其风格却与之前的电视动画版大大不同。彻底摆脱了少年漫画的风格，特别是拔刀斋出招时其没有像过往一般大喊出必杀技名称，而一般很难于少年漫画及电视动画中出现的大量血花四溅的残酷场面亦一一呈现。坊间对此等手法毁誉参半，例如其血腥露骨的场面可能不适合原作的主要读者(小学生、中学生)，但亦得到一般未看过原作的人支持。而本作于日本海外评价亦相当高，在美国的销售亦曾登上全年DVD销售榜的第7位。

人诛篇

雪代巴之弟雪代缘当年亲眼看到姐姐死于剑心的刀下，长大后集合了“六人同志”，向剑心展开复仇行动(在上海流浪垂死之际被好心日本家庭收留，却因为只想练能攻克剑心武功的念头而杀死对方一家并取走武功秘笈单刀法而自练出倭刀术以及其绝招虎伏绝刀势)。由于雪代缘的阴谋，使剑心一度以为神谷薰被杀而意志消沈(神谷薰之死令当时少年JUMP周刊的读者引起一阵回响)。最后剑心回复斗志并打败雪代缘，雪代缘持着其姊的日记消失在剑心等人面前。(漫画)

番外篇

结束连载以后以SP模式连载两个番外篇，分别是《早春樱花》及《弥彦的逆刃刀》。前者提到了结局之后众人各自的新旅程，如左之助的世界一圈之旅到了蒙古。后者是弥彦以神谷活心流行侠仗义的活跃篇。

第零幕

2012年初由日本漫画杂志“JUMP SQ”公开了《浪客剑心》将于八月号开始推出新连载《第零幕》，与1999年结束的连载相隔十三年的新篇章。

北海道篇

2017年9月连载的新续篇，故事发生在“人诛篇”后5年(1885年)，绯村剑心和神谷薰动身前往北海道寻找薰的父亲神谷越路郎，同时和环游世界回来的左之助、在日本流浪的宗次郎、在北海道服刑的安慈、与调往北海道的斋藤一重逢。就连新撰组的永仓新八，也将在“北海道篇”出现。

“在我遇见他之前，我是不相信（奇迹）那种东西存在的。”带着这样的想法，漆叶凛华在回家路上发现了“飞在空中的企鹅”为了一夜暴富的凛华追踪企鹅的时候遇到了发光的鱼群，在追寻“飞在空中的企鹅”时，与空中飞过的光之鱼接触后失去了意识。第二天醒来，身体竟然穿过了地板！？同时东京出现了大量的超能力觉醒者……之后....

用语解说

超能力（ESP：Extra Sensory Perception的缩写）

光之鱼

唤醒ESP的谜之存在，只在夜晚现身，有人看得到有人看不到。可以将通过的生物体进行细胞突变而唤醒ESP。除了人类之外，甚至连动物也可以唤醒ESP。当宿主濒死时光之鱼则会离开宿主，即使宿主后来被救活亦会失去ESP。但可通过再接触光之鱼重新获得ESP，而能力也将和上次的一样，所以所有光之鱼都是一样的，有无接触光之鱼的能力，和当事人不同的能力是个人间的差别。

石板

传说中的十诫石板，藏着光之鱼。被发现时共有两块，一同放在“约柜”里被藏在某个地方。其中一块在发现时被人摔破。

每集列表

随著双方父母再婚，神前夕哉和神前美月成为兄妹，两人的关系并不融洽。

某日，美月被行经天桥时被自称寿日和的幽灵推倒，清醒后发现自己被装上了名为“TST”的贞操带。日和表示自己丧失记忆，只知道自己死于车祸，而未能升天的原因是对暗恋对象夕哉念念不忘，必须透过与夕哉亲密互动，让TST上的满足度计量器达到顶点，才能达成愿望并跨过“天之门”升天转世。日和声称计量器过低时美月也有生命危险，因此美月不得不协助。

在那之后，日和不时强行附身美月，试图色诱夕哉以提升他对自己的好感，虽然经常适得其反，但却促进了夕哉和美月的关系，也让美月解开了对母亲的心结。因为美月被附身前后的性格差异甚大，也让夕哉误以为美月有双重人格。另一方面，与夕哉是青梅竹马的桐谷雪那在与夕哉重逢之后表现出对他的爱意，由于雪那具通灵体质，她发现日和的存在，并将此事告知夕哉。

在新年参拜并许愿后，美月回到与日和相遇的天桥，遇到日和照顾的白猫。白猫让美月观看了日和的记忆，并表示日和的灵魂是生灵，所谓“升天”的考验实际是让日和“生存”的考验。透过这些记忆，日和、夕哉、雪那和美月得知四人从小便是玩伴，后来体弱多病的日和为了治病而搬家，在她得知夕哉和美月将成为兄妹后心生忌妒，却在寻找夕哉的过程中因车祸而昏迷，并透过许下与夕哉相爱的愿望而成为生灵，当初将美月推下天桥也是为了夺舍。美月也得知自己在被推下天桥时，和日和一样向天桥旁的石碑许下希望一家和乐愿望。

为了让日和尽早升天，夕哉和被附身的美月将对方模拟成恋人，虽然这一度让日和心满意足，但在她发现这会让自己与夕哉分离后，便沉眠于徬徨灵魂所待的“奈洛之海”中昏迷不醒。为了拯救日和，美月和夕哉进入奈洛之海，消除了她的不安，并让她展现出生存的意志。在下定决心跨过“天之门”后，日和（本名子瑞希）在医院中清醒，并在不久后与夕哉和美月重逢。

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