妖怪，精灵，众神，超自然生物，这些普通人不会感知，通常被称为“ANOTHER”。在东京23区所有的区政府中，还存在着不为人知的“夜间地区交流科”。 这是解决“超自然事件”的特殊部门。本作主人公“宫古新”是被分配到这个部门的社会新人，这样的他在新宿御苑处理入部以来第一宗事件中竟发现可以听见“ANOTHER”的对话！还被ANOTHER称之为“安倍晴明”！？
每集列表
| 话数 | 日文标题 | 中文标题 | 剧本 | 分镜 | 演出 | 作画监督 | 总作画监督 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| #1 | 新宿上空の天狗と天使 | 新宿上空天狗和天使 | 樋口达人 | 渡边哲哉 | 大石康之 | 江上夏树、浦岛美纪 伊藤依织子 |
伊藤依织子 |
| #2 | 神楽坂の白い猫又 | 神乐坂的白色猫又 | 大石康之 | 浦岛美纪、久松沙纪 田中彩、铃木勘太 |
吉田南 | ||
| #3 | 琥珀の瞳のトリックスター | 琥珀色眼睛的捣蛋鬼 | 久行宏和 | 髙田美里 | 西田美弥子、铃木春香 铃木勘太、江上夏树 |
伊藤依织子 | |
| #4 | 歌舞伎町の定点観測 | 歌舞伎町的定点观测 | 小太刀右京 | 西泽晋 | 石乡冈范和 | 沼田广、中山和子 | 横山爱 |
| #5 | 都庁展望室の異世界エレベーター | 都厅展望室的异世界电梯 | 池田临太郎 | 酒井和男 | 石崎裕子、佐贺野樱子 池田志乃、角谷理 |
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| #6 | 悪魔と喪失感 | 悪魔与丧失感 | 三轮清宗 | 福田道生 | 髙田美里 | 吉田肇、西田美弥子 铃木春香、角谷理 东美帆、清水胜祐 |
松冈谦治 |
| #7 | 喪失感と絶望の証明 | 丧失感与绝望的证明 | 伊东优一 | 青野厚司、门智昭 富泽和雄、铃木勘太 |
伊藤依织子 | ||
| #8 | 老いたコヨーテと星降る庭 | 老去的郊狼和流星庭园 | 樋口达人 | 外山草 | 外山草 石井辉 |
西田美弥子、铃木春香 江上夏树、石崎裕子 池田志乃、东美帆 |
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| #9 | 幽霊団地の夢魔 | 幽灵住宅区的梦魔 | 小太刀右京 | 森邦宏 | 伊部勇志 | 佐贺野樱子、森悦史 金贤敬、青野厚司 门智昭 |
横山爱 |
| #10 | 白い茧と青い炎 | 白色虫茧与蓝色火焰 | 池田临太郎 | 久行宏和 | 宇野亘 | 饭饲一幸、饭冢叶子 永田有香、江上夏树 |
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| #11 | 砂の耳と新人の根性 | 砂之耳与新人的骨气 | 樋口达人 | 西泽晋 | 宅野诚起 | 星野真澄、井上贵骑 嘉村弘之、増田俊介 横山纱弓、藤田正幸 |
吉田南、佐贺野桜子 |
| #12 | 新宿区夜間地域交流課 | 新宿区夜间地域交流科 | 三轮清宗 | 久行宏和 | 石郷冈范和 髙田美里 大石康之 |
佐贺野桜子、石崎裕子 铃木春香、西田美弥子 増田俊介、江上夏树 森悦司 |
松冈谦治、伊藤依织子 |
在梵蒂冈内，有一个专门受理全球的“神迹申请”并负责检证其真伪的机关——“圣座(聖徒の座)”，而隶属圣座的神父则会被称作奇迹调查官。
天才科学家平贺·约瑟夫·庚及暗号解读专家罗贝多·尼可拉斯均是圣座的奇迹调查官，他们经常调查在世界各地所发生的神迹。但在调查期间，却逐渐揭露一些被隐藏的事件及阴谋。
看破虚假，击退伪装，终至神之奇迹。这就是我们奇迹调查官的义务——天才科学家平贺，与古文书暗号解读专家罗伯托。两人是一对好搭档，是梵蒂冈所属的“奇迹调查官”——那是对来自全世界的奇迹的真伪进行调查与判别的秘密调查官。在为调查而造访的地点遇到的不可思议事件——浮现的圣痕、流泪的玛利亚像。在判定奇迹的真伪过程中，突然发生的奇怪事件——天才神父组合的事件簿，开幕!
在一次机缘巧合之下，和妹妹天奈(三泽纱千香 配音) 相依为命的杰(铃木达央 配音)穿越到了100年后的世界，杰震惊的发现，100后的他们曾经的宅邸，变成了一所学校。就这样，杰隐姓埋名改名为神宫司高马，开始在学校中一边学习，一边寻找回到过去世界的方法。
在学校里，杰很快就结识了一帮好友。以自我为中心，谁也不放在眼里的大少爷藤代悠希(KENN 配音)、拥有可爱外表，并常常利用自己的可爱来操纵他人的青叶萤(永冢拓马 配音)、智商和人气都很高，但始终不会以真心待人的绯樱春人(丰永利行 配音)、拥有着和福尔摩斯一样的好奇心的茶野京一(小林千晃 配音)