笨蛋王子来袭篇

升上高中后一个人来到山形的高中生筒井雪隆，住进了学生附近的宿舍，却发现自己的租处已被入侵，里面有个自称自己是外星人的失忆男子。本来打算将他赶出去，但是在同情心及对方的说服下开始相信他是外星人并和他同居，安定下来不久后，王子的护卫军紧追而来，同时发现降落地落在好战的狄肯星人地盘上还有上研究外星人的机构同时也在追查，情况变的十分危急，就在雪隆为了外星王子的安危心急如焚时，本人却攸闲的在逛街买衣服。

食人鬼篇

学校的校外教学期间，4个学生偶然目击到同年级的同学被食人鬼吃掉，为了防止自己也成为食人鬼的目标，于是4个人对食人鬼展开追查，但4人中的矢先在此时却失踨了，担心自身安危的众人于是分别向奇怪的精神科医生求助，这篇故事是王子在故事中所创作的漫画，是一种剧中剧的型式。

原色战队篇

起因于卑鄙的笨蛋王子绑架了5个住在东京的小学生。在放学回家的途中，5人被王子的太空船绑架，在王子无理的要求下，5个人经过改造，成为会变身的超级原色战队的成员，5人就这样被卷入笨蛋王子巧妙而充满恶意的圈套之中。

马克巴克女王篇

在宇宙中流浪的马克巴克族，全体由雌性组成，在繁殖期时，女王会在相异的种族中选出一个雄性体来做为交配的对象，其后便可产下无数的后代。但在交配后异种族的数世代内会因为生育下降而造成种族灭绝。因为知道马克巴克女王前来地球的目地，所以王子护卫军的三人在接待女王时极力的阻止女王对地球产生好感，但就在此时一个和女朋友一起来到饭店的女子却和女王一见钟情了。

高校野球地区预选篇

山形县的夏季高中棒球选手预选。雪隆所属的如月高中棒球部再差一胜就能得到进入甲子园的资格、就在大家为胜利努力时，玻璃自己破碎之类的灵异现象却频繁的困扰着他们。因为支持强棒有机会能前进甲子园而太兴奋的狄肯星人、骑着单车追在如月高中前往比赛场地的巴士后面，突然整辆巴士消失在眼前，预赛马上要开始了，雪隆一行人却被困在里面的，众人焦急的思考如何才能在比赛前脱困。

人鱼篇

一个知名企业老董在拍卖会上买下一条双尾人鱼，被警告不能对人鱼说谎，因为一旦对她说谎，人鱼就会本能的用舌头攻击对方。这个女人鱼是外星盗猎集团在她的原栖地抓到的最后一群人鱼中的其中一只，和盗猎者作出约定，她愿意做足所有人等份的工作请放过其他的人鱼。但是盗猎者并没有放过人鱼的打算，就在这个时候，被王子改造成原色战队5人组的清水，正因为父亲的工作问题必需面临转学的命运。

笨蛋王子结婚篇

很久不见的笨蛋王子，突然造访雪隆的宿舍。一开口就说有人在追我，借我躲一下，就在讲话的当口，追兵杀到，原来是王子的亲弟弟，铎古拉星的第二王子，他为了让笨蛋王子屡行和玛古拉星公主的婚约并继承王位而来。原来王子通过一个法案，王位候选人必需在20岁时结婚，否则就由第二顺位的继承人继承王位，为了让笨蛋王子可以不结婚不当国王，王子护卫军难得的和王子同一阵线，展开逃婚行动。

蜜月篇

时光飞逝，笨蛋王子和雪隆的相遇也过了十年，王子最后和鲁娜结婚，女儿也7岁大了，之前忙着让铎古拉王朝的内政上轨道，一直没有蜜月的两人出发前往迟来的蜜月。但是不幸的遇上了凶恶的武装绑架集团。

每集列表

东京篇

主角绯村剑心流浪至东京，因为神谷薰的挽留而留在东京。其后认识了明神弥彦、相乐左之助及高荷惠等人，又与前幕府杀手鹈堂刃卫、御庭番众首领四乃森苍紫决斗，其间剑心经历了多次战斗，令剑心自觉慢慢变回昔日的刽子手拔刀斋(千人斩拔刀斋)(人斩り抜刀斎)。最后在与幕末时代的对手前新撰组第三小队组长斋藤一决战及得知志志雄一党的阴谋后，独自前往京都与志志雄一党对决。(漫画、电视动画)

京都篇

前维新志士志志雄真实及他的同党正在秘密活动，目的是推翻明治政府，由他带领日本成为强国。剑心为了阻止志志雄的计划得逞，独自离开东京前往京都。后来剑心的同伴亦逐一赶到京都寻找剑心，剑心从师傅比古清十郎身上学会飞天御剑流的最终奥义“天翔龙闪”后，与其同伴相乐左之助及斋藤一、四乃森苍紫联手，终于打败了志志雄一党。(漫画、电视动画)

漫画及电视动画的东京篇及京都篇在故事上大致相同。在京都篇完结后，由于当时漫画只是刚开始连载人诛篇，跟不上电视动画的制作进度，因此电视动画另行制作了岛原篇、胜海舟篇、由太郎篇(黑骑士团篇)及风水篇。但受到原作版本的读者批评与原作版浪客剑心的世界观相异，因此后期收视不太理想，在风水篇后便终止制作。

追忆篇

故事发生于剑心在幕末身为长州派维新志士时担当刽子手的年代(东京篇之前的故事)。故事讲述剑心与第一任妻子雪代巴的过去，解明了剑心左边面颊的十字疤之谜。OVA故事共分四幕，第四幕尾段雪代巴为阻挡敌人向剑心发出最后一撃的同时，亦被剑心一剑杀死，临死前用自杀的小刀在剑心面上划上一刀，与未婚夫清里和剑心死斗时划下的一刀，交织成剑心脸上的十字疤。漫画版的追忆篇连载于人诛篇初期剑心的回忆自述，而OVA则独立讲述剑心的过去。(漫画、OVA)

OVA版本的追忆篇内容虽然与漫画原著并无太大出入，但其风格却与之前的电视动画版大大不同。彻底摆脱了少年漫画的风格，特别是拔刀斋出招时其没有像过往一般大喊出必杀技名称，而一般很难于少年漫画及电视动画中出现的大量血花四溅的残酷场面亦一一呈现。坊间对此等手法毁誉参半，例如其血腥露骨的场面可能不适合原作的主要读者(小学生、中学生)，但亦得到一般未看过原作的人支持。而本作于日本海外评价亦相当高，在美国的销售亦曾登上全年DVD销售榜的第7位。

人诛篇

雪代巴之弟雪代缘当年亲眼看到姐姐死于剑心的刀下，长大后集合了“六人同志”，向剑心展开复仇行动(在上海流浪垂死之际被好心日本家庭收留，却因为只想练能攻克剑心武功的念头而杀死对方一家并取走武功秘笈单刀法而自练出倭刀术以及其绝招虎伏绝刀势)。由于雪代缘的阴谋，使剑心一度以为神谷薰被杀而意志消沈(神谷薰之死令当时少年JUMP周刊的读者引起一阵回响)。最后剑心回复斗志并打败雪代缘，雪代缘持着其姊的日记消失在剑心等人面前。(漫画)

番外篇

结束连载以后以SP模式连载两个番外篇，分别是《早春樱花》及《弥彦的逆刃刀》。前者提到了结局之后众人各自的新旅程，如左之助的世界一圈之旅到了蒙古。后者是弥彦以神谷活心流行侠仗义的活跃篇。

第零幕

2012年初由日本漫画杂志“JUMP SQ”公开了《浪客剑心》将于八月号开始推出新连载《第零幕》，与1999年结束的连载相隔十三年的新篇章。

北海道篇

2017年9月连载的新续篇，故事发生在“人诛篇”后5年(1885年)，绯村剑心和神谷薰动身前往北海道寻找薰的父亲神谷越路郎，同时和环游世界回来的左之助、在日本流浪的宗次郎、在北海道服刑的安慈、与调往北海道的斋藤一重逢。就连新撰组的永仓新八，也将在“北海道篇”出现。

女主角妮可蕾特在年纪还小的时候，母亲因为再婚而把她留给了祖母照顾后而离开了她。妮可蕾特渐渐长大成人之后，她决定离开乡下前往罗马去寻找母亲及和她再婚的那个餐馆老板，并打算把一切都告诉母亲的再婚对象。因为餐馆老板并不知道她的妻子有一个女儿，而后找到餐馆的妮可蕾特并不知道将有一场命运的邂逅正在等待着她。

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