日本的御宅族文化在神秘组织“SSC”出现后遭到镇压，此时一位热爱御宅族文化的男子“御宅英雄”与仰慕他的三名魔法少女一起率领御宅族们挺身反抗SSC，双方展开一场壮烈的战斗。

2008年——因一股神秘的力量出现，

日本的动画、游戏、漫画、音乐、铁道、cos等御宅文化被消灭。

就这样，在维持秩序的「SSC」维护下，御宅文化几乎消失殆尽。

为了夺回御宅文化，比任何人还深爱秋叶原以及御宅文化的「御宅英雄」，

以及崇拜他的3名魔法少女「安那其」、「Blue」、「Pink」举起反旗。

舞台为2011年的日本，秋叶原革命军与SSC首领「SHOBON」展开激战。

居住在海明星平凡的高一生“加藤茉莉香”，死去父亲的部下突然要求她担任宇宙海贼船“辩天丸”(弁天丸)的船长。由于1世纪前独立战争颁发的私掠许可证规定船长一旦死亡，继任条件须为直系子嗣，高中女生兼宇宙海贼船船长的冒险生活从此展开……

用语

星球、设施

海明星(海明星)

位于 “天仓五星系”(鯨座宮たう星系)的第三行星。是一个已开发的星球，亦是主角——加藤茉莉香所居住的星球。

白凰女学院(白凰女学院)

名门女子学校并设立初中、高中部，在 “太秦星系海森星”(ウズマサ星系海森星)也有分校。位于海明星新奥滨市的郊外地区，亦是加藤茉莉香就读的学校。

油灯咖啡馆(ランプ館)

位于新奥滨市的运河沿岸，由仓库改造以仿古风天井油灯照明的咖啡馆。加藤茉莉香兼职的地方，但在就任辩天丸船长后就没常去兼职。

国家、星系

塞雷尼提联合王国(セレニティ連合王国)

历史悠久、由塞雷尼提王室管理的星际国家。格里埃尔是塞雷尼提王室第七正统皇女，而格琉希尔德是第八正统皇女。

银河帝国(銀河帝国)

一个有银河系数十亿个星球加盟的星际国家，海明星亦包括在内。

动画原创现由女王统治。

其他

宇宙海贼(宇宙海賊)

一世纪前海明星独立战争爆发，海明星的独立政府为使脆弱的战斗力得以提升，便发出了私掠许可证，使当时的宇宙海贼可名正言顺掠夺星际联合的舰船。

由于由宗主星系和殖民星幕后组合的银河帝国反而将宗主星系和各独立星系征服，各星系的战争就此结束，但由于海明星的海贼是属于海明星政府承认的武装力量，和作为历史的记录，现在作为一种特殊的表演行为被保留，客船通过保险公司购置相应“保险”作为支付表演费，由保险公司指派相应海贼进行“劫持”表演，所缴“赃款”要上缴海明星政府作为税款，和由保险公司作为“赔偿”返还客船乘客，保险公司支付演出费给海贼。除外，海贼也被视作军队，也要遵守相应守则。

动画原创海明星抄袭银河帝国承认海贼存在，当年帝国也有些海贼到海明星打仗赚外快，资历仅次原始七船;也原创其他海贼，例如“银狐”、“Big Catch”、“铁胡子”等。

原始七船(ァ￡ジナルセブン)

海明星发生独立战争时，最初获得“私掠许可证”的七艘海贼船，亦被称为传说之七船。

辩天丸(弁天丸)

前任船长︰权左卫门加藤

现任船长︰加藤茉莉香

原作、动画版造型迥异;漫画版沿用动画版设计。

巴巴罗萨(バルバルーサ)

现任船长︰栗原见城

原作即单圆胴设计，与动画版辩天丸相同。

奥黛塔二世(ァ∏ットII世)

以前是海贼船，原名字为“白鸟号”(白鳥号)，能使用太阳帆推进。现在是白凰女学院的练习用船，母港于海明星中途站。

黑鸟号(黒鳥号)

长命种(長命種(メトセラ))

短命种(短命種(ショートタイマー))

比种别平均寿命多一倍的种族称为长命种;反之未达平均寿命一半的种族则是短命种。例如塞雷尼提星系王室枢密院侍从长约特夫属长命种。

动画版未提其设定。

星云杯(ビュラカップ)

动画原创每年举行一次的杯赛，由星云杯运营委员会管理。

六年前，白凰宇宙风帆部某两位学姐在星云杯举行前得到未公开的赛程情报，并认为路线太简单，于是拜托当时还是初中的琳·兰美达，更改星云杯运营委员会的数据，把路线的难度提升。到了比赛当天，因为路线被更改，令该届比赛只有两名参赛者能完成整个赛程(该届比赛的参赛者为142人)。比赛后运营委员会追查路线被更改的原因时，发现是白凰女学院所为，因此被停赛五年以作为惩罚，而该届比赛亦被称为“恶梦的第十三届大赛”。

比赛规则：参赛者使用风帆船，由星云杯运营委员会所在的中途站降落至风凪星，然后依照比赛前发出的路线图到达行星上的数个检查站，最快完成比赛的为之胜出。

海贼巢穴(海賊の巣)

动画原创。以前海明星的宇宙海贼举行海贼会议的地方，周围遍布小行星带、气体云和星际物质。

用语

集数	日文标题	中文标题	剧本	分镜	演出	作画监督	改编
SAILING 1	海賊、罷り通る	海贼，招摇过市	佐藤龙雄		大脊户聪	竹内浩志	第1卷
SAILING 2	私の力、海賊の力	我的力量，海贼的力量			水本叶月	仓田绫子
SAILING 3	オデット二世、出航！	奥黛塔二世，出航！	佐藤龙雄	下田正美	佐佐木奈奈子	杉村友和 寺尾宪治
SAILING 4	決戦は深夜	决战在深夜			大脊户聪	山下英美
SAILING 5	茉莉香、決意する	茉莉香，下定决心		西村聪	近藤一英	大河内忍
SAILING 6	茉莉香、初仕事する	茉莉香，首次工作		佐山圣子	福岛利规	福岛丰明 伊佐英朗 兴石晓
SAILING 7	平穏ままならず	不得安宁		岛津裕行	室谷靖	小谷杏子 吉川真帆	第2卷
SAILING 8	姫と海賊	公主与海贼		森健	筑紫大介	今西亨
SAILING 9	華麗なる船出	华丽的起航		小野胜巳	水本叶月	伊藤真理子
SAILING 10	嵐の砲撃戦	暴风雨的炮击战		佐山圣子	大野和寿	高乘阳子 山村俊了
SAILING 11	閃光の彷徨者	闪光的徬徨者		伊藤达文		伊藤真理子
SAILING 12	永遠よりの帰還	自永恒回归		西村聪	室谷靖	山下英美 盐川贵史
SAILING 13	茉莉香、招待する	茉莉香的招待		下田正美	大脊户聪	大河内忍 寺尾宪治
SAILING 14	茉莉香、募集する	茉莉香的招募	伊藤美智子	岛津裕行	大野和寿	中野彰子	第3卷
SAILING 15	密航出航大跳躍	密航出航大跳跃		仓田绫子		伊藤真理子
SAILING 16	初仕事！白凰海賊団	初次工作！白凰海贼团		筑紫大介		小谷杏子
SAILING 17	意外な依頼人	意外的委托人		室谷靖		泉保良辅
SAILING 18	打ち上げはジュース	庆功宴上必备果汁		大脊户聪		今西亨
SAILING 19	四人の絆	四人羁绊	水野健太郎	佐佐木奈奈子	羽多野浩平	安藤正浩	原创
SAILING 20	茉莉香、波に乗る	茉莉香，乘风破浪	宫崎真一	安田贤司	近藤一英	盐川贵史 伊藤真理子
SAILING 21	決戦！ネビュラカップ	决战！星云杯		西村聪	筑紫大介	大河原晴男 山下英美
SAILING 22	海賊狩り	狩猎海贼	佐藤龙雄	室谷靖		泉保良辅
SAILING 23	目指せ！海賊の巣	目标！海贼巢穴		水本叶月		大河内忍 馆崎大
SAILING 24	傷だらけの弁天	伤痕累累的辩天		下田正美	羽多野浩平	松下纯子 福世孝明
SAILING 25	開催！海賊会議	召开！海贼会议	佐藤龙雄		大野和寿	小谷杏子 今西亨
SAILING 26	そして、海賊は行く	尔后，海贼行			仓田绫子	竹内浩志

舞台设置

故事舞台位于虚构的见泷原（日语：見滝原／みたきはら Mitakihara）市。城中充斥着可能实现的新科技，因此剧中的现代世界充满未来感，许多建筑物以迪拜、美国、欧洲与日本群马县的真实建筑为范本。在设置中，见泷原是近几年新开发的地方都市，新兴住宅区毗邻人工的景观绿地以及小溪，郊外则有风力发电设施、水门以及工厂等。见泷原作为行政区，有时被称为“市”，有时则又是“町”，官方资料并未统一。

剧中世界设置了魔法少女与魔女的存在，但不为一般人知晓。然而，早在史前时代全世界就有许多魔法少女了，历史借由她们的暗中活跃而被推动，包括克丽奥佩脱拉七世、卑弥呼、圣女贞德等史实人物都在其中。此外，被魔女盯上的人，则会原因不明地自杀或杀人。

本作故事围绕着鹿目圆、晓美焰、美树沙耶香、巴麻美、佐仓杏子5名魔法少女以及外星生物丘比（QB）依次展开。

本作所谓的魔法少女，是以“可以实现任何一个愿望”的代价与QB交换契约后，背负着“讨伐魔女”此一使命的存在。象征魔法少女资质的魔法系数，则取决于该名少女拥有的因果量，资质较高者通常是一国之主、被称为救世主的人物。然而，主角小圆虽然只是平凡的中学生，却拥有神明等级的高资质。

魔法少女缔约时，会同时生成名为“灵魂宝石”的物品。灵魂宝石是魔法力量的泉源，可以感知魔女存在的位置，也有发动变身的功能。基本外型都是鸡蛋状，但平常也化为戒指状，变身后依各人状况，变化为外型相异的饰品，镶嵌于身上某个地方。

魔女是一种奇形怪状的异物，通常伴随一般人看不见的异世界“结界”以及部下“使魔”出现。魔女身上携有名为“悲叹之种”的黑色宝石，这是魔法少女消灭魔女的直接酬劳。

使用魔法会使灵魂宝石逐渐混浊失去光辉，即使完全不使用魔法，维持一般身体活动仍会一点一滴累积混浊。悲叹之种可以转移灵魂宝石的混浊，以便魔法少女可以继续活动。因此，魔法少女必须定期消灭魔女，以避免灵魂宝石变得混浊。

在续作《［新篇］叛逆的物语》剧中，首次出现与灵魂宝石不同的“黑暗宝玉”。这是由“fort/da”游戏的粉红线轴与灵魂宝石的碎片、加上人类感情的极致所构筑而成的。黑暗宝玉通常呈夹式耳环状，附着在晓美焰的左耳上，耳环中的宝石封印了小圆的力量。

情节展开

出身于良好家庭，亲朋好友团聚，有哭有笑，是谁都拥有的日常生活。就读市立见泷原中学2年级的少女鹿目圆，如此平凡地过着幸福的每一天。直至一名神秘转学生晓美焰的出现，让小圆的命运开始改变。

当天，小圆与好友美树沙耶香在返家途中，撞见一只伤痕累累，被焰所猎杀的不明生物丘比（QB）。风波过后，QB希望少女们和自己交换契约，成为“魔法少女”讨伐人类之敌。然而此后，随着残酷真相渐遭揭露，小圆的想法也一再受到冲击……