故事背景为一场史无前例的大灾害彻底摧毁了现代文明并且已经过去了十五年。故事使用双线描述，其中一支为一群孩子被圈养在某个封闭设施中，他们被告知外面世界充满各种怪物，一天时男收到一条消息询问他是否想到设施外面，而和他亲密的弥美姬则预言到外面会有两个人到来救她出去，而且其中一个人和时男样貌相同;另一支则是在外面荒废的世界，贵留子受委托作为保镖，带着小丸前去一个名为“天国”的地方。

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主角“瓜生新吾”是平凡的高中“各务台学园”的男学生。明年四月各务台学园和名叫“结姬女子学园”的名门女校预定合并。从今年十月到明年三月的合并试办期间，含新吾在内的数十名各务台学园生试验性地到结女学园上学，新吾因此喜欢上某个女学生。

在同伴的眼中，瓜生新吾（水岛大宙 配音）是一个乐于助人的好好先生，而今年，新吾所就读的各务台私立学园即将和当地有名的结姬私立女子学园合并，而包括新吾在内的数十名学生，则被预先送往女校习惯未来的学习生活。面对着汹涌而来的，身穿洁白校服的纯洁女孩子们，有些羞涩的新吾会遇到怎 样的浪漫情缘呢？

个性傲娇专横的大小姐濑名爱理（小野凉子 配音），温柔可人沉默寡言的文学少女瓜生樱乃（後藤麻衣 配音），居家型混血少女安洁莉娜（壱智村小真 配音），个头迷你性格又有些天然呆的自然系学姐天羽美羽（松田理沙 配音），在和这些从未和男孩子打过交道的女孩子们交往的同时，新吾也找到了属于自己的，小小的，纯洁的爱情。

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东京大地震十年后，人们逐渐淡忘这场大灾难所带来的恐怖回忆，当时亲身经历这场灾难的男主角“五十岚丸太”，却因当时的意外丧失记忆。现今的丸太与其他同学过着普通而平凡无奇的每一日，但这一切并未带来永久的幸福，而是死亡的开始。某天，一名红色男子“赤之男”突然现身学校，并将所有丸太的同班同学杀害，并置入一个红色核心在丸太的体内。原本见到事实的丸太以为将被赤之男杀死，醒来却躺在医院得以幸存，但这活着却彻底改变他的命运。被拯救后的丸太，表面虽在辨护律师“玉木常长”帮忙下，最后仍被莫名冠上莫须有的罪名予以起诉，最后的判决竟是处以“死刑”，被强迫送至民营化的监狱“DEADMAN WONDERLAND（死囚乐园）”。死囚乐园是以东京复兴为目的，在日本建立唯一的民营化刑务所，表面上是为了各种囚犯而建立，并让人观光的乐园，但其实是个利用死囚互相厮杀，并借此吸引大量金钱投资，把拥有特殊能力的死囚做为实验的不祥之地。在这充满绝望的“乐园”里，丸太先与死囚乐园的看守长“真纪奈”见面，了解此乐园对各种刑犯的残酷，绝望下，与青梅竹马的神秘少女“白”再次相遇，并展开对抗死亡命运的战斗……

名词解释

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