故事背景为一场史无前例的大灾害彻底摧毁了现代文明并且已经过去了十五年。故事使用双线描述，其中一支为一群孩子被圈养在某个封闭设施中，他们被告知外面世界充满各种怪物，一天时男收到一条消息询问他是否想到设施外面，而和他亲密的弥美姬则预言到外面会有两个人到来救她出去，而且其中一个人和时男样貌相同;另一支则是在外面荒废的世界，贵留子受委托作为保镖，带着小丸前去一个名为“天国”的地方。

每集列表

于史克威尔艾尼克斯的刊物“Fresh GANGAN”2008年春季号推出初版后，在2009年5月21日正式搬至网上GANGAN ONLINE进行逢星期四更新的连载，其后透过GANGAN漫画ONLINE的品牌发售单行本。直到2011年12月，前5卷的销量累计突破100万本。

过往的空气系作品都是以女性角色为中心，或以少女的情节居多。本作一反常态以男子高中生的特征为主，作者只表示“没想过有关的描绘会流行起来”。而他初期亦特别遵从不绘画女子眼睛的方针，尽管后来例外的情况越来越多。之后更出现外传《女子高中生是异常》，女性角色全都有眼睛。

《男子高中生的日常》以真田北男校为舞台，围绕着主角忠邦（入野自由 配音），以及他的死党秀则（杉田智和 配音）和吉竹（铃村健一 配音）的日常高中生活而展开。忠邦主要担任吐槽的角色，长相中性的他常常被秀则和吉竹联合欺负。登场人物还有同校学生会的元治、唐泽、副会长和会长等人，这是一群基本上没有女朋友的男校学生，在鲜有女生参与的情况下，展开了插科打诨的日常高中生活。

这是一部搞笑向的作品，内容短小，笑点十足。动画以每集一个小故事的节奏，采用“男子高中生与XX”的标题形式，将男子高中生的爆笑日常故事呈现给观众。

本作根据山内泰延的同名漫画《男子高中生的日常》改编而成。

一般被称为是“大小姐学校”的名校“私立藤崎女子中学”（略称：藤女）的学生会执行部，因为会长的意向而有时会做“恋爱的研究”。随后被称为‘恋爱实验室’（原文标题ラボ(lab)=laboratory），以漫画的形式描绘“爱上恋爱的少女们”的学生会成员，进行恋爱研究以及他们实践的样子。

于两本杂志同时连载时、‘Manga Home’与‘Comic YELL!’（→‘Manga Time Special’）有各自的故事中心，因此有不同的主题、前者以学生会成员之间的互动为中心的“研究篇”。后者以リコ上的补习班的学生为中心，男女恋爱喜剧的要素相当强，被称为“实践篇”。‘Special’单独连载后，有一段时间前半为“研究篇”、后半为“实践篇”的形态，现在两个故事线正在整合。

虽然本传大致上为四格漫的形式、也有“特别篇”等采用故事形式的例外。

藤崎女子中学

常简称为“藤女”，学校法人名为“藤崎女学园”。从幼稚园（幼稚舎）到高校（大学以上不明）皆具备的女子教育名门。作品中该校创立有100多年。在作品中迎接创立100周年。坐落于“夏原市”。校规非常严格，禁止男女交往，禁止外出购买食品（莉子与真木到速食店时更换穿着），禁止带手机。也没出现骑自行车通勤的情况。

校服为绿色裙子加黄色上衣。

由于学生居住分布范围广，允许使用公共交通通勤。此外莉子与小铃持有IC卡。

いりきみ塾

补习班，被莉子的母亲用“让莉子能够考上藤女的奇迹之塾”形容。

交流会

市内各中学在暑假所举办的学生会交流会，藤女首次参加。