故事背景为一场史无前例的大灾害彻底摧毁了现代文明并且已经过去了十五年。故事使用双线描述，其中一支为一群孩子被圈养在某个封闭设施中，他们被告知外面世界充满各种怪物，一天时男收到一条消息询问他是否想到设施外面，而和他亲密的弥美姬则预言到外面会有两个人到来救她出去，而且其中一个人和时男样貌相同;另一支则是在外面荒废的世界，贵留子受委托作为保镖，带着小丸前去一个名为“天国”的地方。

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高中生夏目贵志有灵异体质，能看见别人所看不到的。当他得到祖母玲子的遗物“友人帐”之后，不论白天或晚上，开始有各式各样的妖怪纷纷找上门！

原来玲子也和贵志一样有灵异体质，大家都对她敬而远之。玲子因为十分寂寞，便到处向妖怪下战书，并要战败的妖怪交出名字，订立服从的契约。而贵志拿到的，正是这本写有众多妖怪名字，能够号令百妖，力量引人觊觎的“友人帐”！

贵志在得知事情原委之后，决心要将“友人帐”上的名字一一还给被玲子击败的妖怪。而想要不费吹灰之力拿到友人帐的妖怪“猫咪老师”，则自愿当保镳，保护贵志和“友人帐”，共同踏上妖怪之旅！

主角仓下月海是一名梦想着成为插画家，并且非常喜欢水母的家里蹲。她为了梦想而来到东京，后入住了女生公寓“天水馆”，这里的住客大多是宅女兼尼特族，对她们来讲拥有时尚感的人就全是她们的敌人。一天为了救水母，月海遇到一名超美的伪娘。于是发生在尼特族、伪娘之间的故事就此展开。

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