剧情描述一位12岁少年小杰·富力士寻找父亲——金·富力士的故事。猎人（HUNTER）一词是故事设定的世界中各种领域的社会菁英。此外，此本作的角色及设定用语请参考以下条目介绍。

猎人试验篇 No.001－038（单行本1卷 - 5卷）

自小生长在鲸鱼岛的小杰小时候因误入母狐熊的势力范围，就快要被攻击时，一名路过、名叫凯特的男子救了他。原来凯特是他的父亲──金的徒弟，凯特告诉小杰许多关于他的父亲及猎人相关的事情，因此小杰对金及猎人这个职业有很大的憧憬。他在考试的过程中结识酷拉皮卡、雷欧力、奇犽等好友，并与西索结下再战之缘。最后，在互相帮助下小杰通过试验成为猎人。

揍敌客家族篇 No.039－043（单行本5卷）

小杰、酷拉皮卡和雷欧力皆通过了猎人试验，为了带回回到家族的奇犽，三人往奇犽的家出发。三人顺利地来到奇犽家门口却无法进去，原来要进入揍敌客家必须打开沉重的“试炼之门”，否则就会被看门犬视为入侵者后咬死。后来在大门看守人皆卜戎的协助下，三人终于具备开门的能力，往本邸前进。被囚禁在家的奇犽在得知小杰等人已来到家中，在与父亲长谈后便前往与其会合；虽然奇犽的母亲反对父亲这么做，但奇犽的父亲却意味深长的表示，奇犽总有一天会再回来。

在奇犽还未与三人会合的空档，揍敌客管家梧桐对三人进行“猜铜板”考验，并透过此考验给予小杰忠告。四人再次团聚后，雷欧力为了准备医学院的考试要离开，奇犽和小杰则一起行动，酷拉皮卡则在猎人试验时，从西索口中得知幻影旅团线索与西索约在九月友克鑫市碰面，在那之前准备利用猎人身份开始工作与寻找族人的眼睛“火红眼”，四人相约在九月一日友克鑫市见。

天空斗技场篇 No.044－063（单行本5卷 - 7卷）

小杰为了要再次与西索交手，便与奇犽一起去天空竞技场修练顺便赚钱。在那里，奇犽和同年的智喜对战，并对智喜未知的力量感到疑惑，两人见到智喜的师父云古、得知那是神秘的念能力，云古便协助他们开发这种力量。因为小杰在修行“凝”时，所放出来的念能力，表现令西索激赏，也因此西索答应与小杰展开战斗的约定。虽然结果是西索轻松胜利，不过小杰也终于还了西索在试验时给予协助的人情，之后小杰和奇犽跟着云古和智喜修练，某天疾斗及狸狈多以卑鄙手段逼迫两人与他们展开战斗，但最终结果由小杰和奇犽获得胜利，此战过后两人也离开天空竞技场，决定回到鲸鱼岛。

返回鲸鱼岛篇 No.064－070（单行本8卷）

小杰与奇犽回到小杰生长的故乡──鲸鱼岛。而后米特阿姨把小杰父亲金?富力士所留下的小箱子交给小杰。小杰从而得知“贪婪之岛”（G.I）的存在。

拍卖会篇 No.071－119（单行本8卷 - 13卷）

主角4人再次在友克鑫市相遇。故事世界中最大规模的拍卖会在友克鑫市举行。小杰、奇犽和雷欧力涌进各种方法筹集资金购买名称为“贪婪之岛”的游戏，这是藏有金的线索的游戏，在过程中也与酷拉皮卡的仇人幻影旅团发生冲突。最后小杰和奇犽顺利得到玩游戏的资格，四人再次各自旅程。

贪婪之岛篇 No.120－185（单行本13卷 - 18卷）

小杰与奇犽进入由金与他的朋友们所制作──猎人专用的梦幻电玩游戏《贪婪之岛》，当他们进入游戏之没过多久就见识到此游戏的危险之处──并遇到了神秘少女比司吉，她看不下去小杰和奇犽的战斗方式，要他们拜自己为师，之后两人在比司吉的指导下修行并且一路闯关，在最后打倒了贪婪之岛中的凶恶玩家炸弹魔甘舒，并取得一百张卡片、破关成功。

蚁王篇 No.186－318（单行本18卷 - 30卷）

小杰与奇犽使用贪婪之岛破关奖品打算去找金。但是在那里等著的并不是金，而是凯特。凯特他们在未确认生物的探索和调查中，发现巨型嵌合蚁的残骸，一行人前往NGL。小杰和奇犽了解嵌合蚁的强大，在凯特的牺牲下逃出NGL。在讨伐队还尚未准备完全之际，嵌合蚁王诞生了。王率领直属护卫队和一部分士兵，在背后统治东果陀共和国，打算进行‘选别’（挑选）。为了防止更多的人死亡以及为凯特报仇，小杰一行人再次向嵌合蚁挑战。

十二支会长篇 No.319－339（单行本30卷 - 32卷）

十二支登场，尼特罗会长于嵌合蚁之役死后，从猎人协会会长退位，开始选拔新的猎人协会会长。全世界的猎人为了新的猎人会长选举一事纷纷开始活动；另一方面，奇犽为了拯救伤重的小杰而再度回到揍敌客家族。

暗黑大陆篇 No.340－ （单行本32卷 - ）

有天自称尼特罗之子的比洋德·尼特罗在卡丁帝国支持下向全世界发表招募同伴前往暗黑大陆的影片，在十二支们接获V5所发出的“追捕比洋德”命令的同一时间，比洋德主动前来被逮捕并要求交换条件──十二支需陪同他一起至暗黑大陆。同时雷欧力和酷拉皮卡加入十二支并接替十二支的子、亥之位置。

金以No.2身份加入比洋德雇用前往暗黑大陆的专家团队，后来当卡丁帝国的船发出后，和其他包括12支的猎人也登上船，酷拉皮卡成为第八王妃奥伊特和第十四王子的保镖，其目的为第四王子手上收藏的族人眼睛。船的目的地为邻近暗黑大陆边界的假想“新大陆”，航行过程中，王位争夺战正式展开。

2013年，居住在理想都市“NO.6”的少年紫苑，在9月7日迎接自己的第12个生日。不过，这同时也是改变他命运的一天。他和从“矫正设施”中逃出来、身为重大犯罪者的谜之少年老鼠相遇了。他窝藏老鼠的行为被治安局发现，令他和家人从高级住宅区“克洛诺斯”被驱逐至“下城”。四年后，由于谜之事件的影响，被卷入各种各样的事件中，和很多人相遇。然后知道了理想都市背面的现实，及理想都市NO.6所隐藏的本质与意图……

作中用语

NO.6（ナンバーシックス）

有理想都市、神圣都市等称号。医疗、教育非常发达，是世界仅存的6个理想都市之一，详细地点不明。边界以高墙围住，完全与外部隔离。NO.6的外侧分为东南西北四个区域。北部是广大的自然山林，完全受到保护；南部及东部是为NO.6提供大半食物的农地和牧地。西区参见下方。

市庁舎/月の雫（しちょうしゃ）

市中央的一个从地下5层至地上10层的圆顶建筑。被称“月の雫”。市庁舎周围有个超大的森林公园，占市内面积的1/6。

治安局

表面上是守护市民的警察。实际上是把反派的市民逮捕、抹杀、当爱丽乌丽亚斯（エリウリアス）研究用的政府机关。

保健卫生局

管辖市立中央医院，公园管理事务所和老人设施“黄昏之家”。每年选拔2岁的天才幼童。

负责爱丽乌丽亚斯研究（实验样本从矫正施设运来）。研究寄生蜂的成长。

市立中央病院

保健卫生局管辖的最高设备医院。参与爱丽乌丽亚斯的研究。

黄昏之家

表面上为NO.6最先端的老人安治设施，实际上是使无工作能力的老人安乐死。

中央管理局

NO.6的市庁舎的中枢机关，负责管理市民个人情报。

克洛诺斯/黑色巢穴（クロノス）

为NO.6的高级住宅区，只有被认定为智能最高级别的人以及其家属才可以入住。

下城/失落之镇（ロストタウン）

低阶市民居住的地方

矫正施设（きょうせいしせつ）

远离西区的空旷土地，以监禁、感化NO.6的罪犯。

只有一条路可通。非常巨大的建筑物，以不规则的长方体组成。

NO.6没有审判制度，以治安局负责逮捕、监禁嫌犯，并安置在此。但No.6的犯罪率几乎为0，所以主要监禁西区的人民。入监服刑时，为防止逃走会在人体内植入VC（Violence-Chip）芯片。刑期以年齢、前科、罪名而定，从1年至无期不等。

实际设施内负责研究爱丽乌丽亚斯（エリウリアス）的行动。需要使用人脑，除了犯罪者以外，也透过每年的“大扫除”获得。

西区

位于NO.6外部。矫正施设附近的特别警戒地域。是NO.6以外有市民的地方。沿着No.6外壁的密集建物。有许多旅店和餐厅，有着繁荣的商业。但是大多数的房子都很破烂，比失落之镇还糟，而且没有警察，治安极差。市民需要特别许可证明才能进入，且申请特别许可证明的考察非常严格。

爱丽乌丽亚斯（エリウリアス）（声优：大地真央）

与森之民生活，并拥有比人类高的智慧。寄身在有大脑的生物中（人类最好），有着像蜂的外观。被森之民以“神”称之。因为她的力量引发了NO.6的“大虐杀”。矫正施设也为了做实验而成立。

每集列表

状态持续低迷的ETU迎来了新的教练。其名为达海猛、在英格兰足总杯中以低级俱乐部将最高级别俱乐部追逼到危险境地的人物。由于他的来到而在俱乐部中引起了骚动，对他的起用到底是好还是坏呢？

每集列表