故事由天和国秘女王交接仪式展开，由于秘女族惟有少女可以继任，秘女族的少年諽被其祖母逼迫假扮女装参与秘女王交接仪式。仪式中发生秘女王的部属12神鞘的背叛，諽被指称行凶者而被追杀，却被神开之森吞噬……

另一方面，现代日本，就读高中一年级的日之原革，为了遗忘伤痛的过去，原本也决心在高中重新开始，但是没想到在国中发生的噩梦再次袭来，绝望中期望自己从世上消失，在暗巷中听到某人呼唤他的名字……

两个异世界的少年革与諽彼此交换身份，諽替换革的身份来到日本，而革替换成諽来到天和国……

革在天和国接受了秘女王的请托，并带着剑神“创世”一同开启与其他12神鞘的降服大战……

第1期

某天，老牌网游《幻境神话》在引入第十二次资料片改版“开拓智域”之后，将日本三万名在线用户囚禁在了游戏中。其中游戏资历8年的大学生城惠也被卷入了异世界之中。

不断的与怪物战斗、连死了也无法结束的情况。不知道接下来会发生什么的玩家们充满了不安，“大和”地区最大的都市“秋叶原”就这样失去了秩序。

曾经如同一匹孤高的狼般的城惠和老朋友直继、美少女刺客晓一起创立了公会“记录的地平线”。

于是，在这个与游戏十分相似的世界，不善与他人交往的内向大学生和伙伴们就此一起踏上了从废墟秋叶原开始改变世界的旅程。

第2期

自从城惠等冒险者们被关进网络游戏《幻境神话》的世界，时间已经过了半年。

当初充满着混乱的都市秋叶原，由于自治性的组织“圆桌会议”的结成，取回了活力和平稳。更借着桑托利夫半岛的地精防卫战，与游戏世界的居民“大地人”加深了彼此间的信赖。最后，大地人贵族们的领袖的柯文家的千金——蕾妮希雅，作为大使前往秋叶原赴任了。

渐渐踏入冬季，冒险者们对于在这个异世界该怎样行动、以什么为目标，都各自在摸索着。不论是在秋叶原的街头、西方的都市、北方的大地、甚至是遥远的异国，冒险者们的思想相互碰撞、交错着……到底会有什么样的冒险在等待着城惠和他的同伴们呢？

柔道场长男坂东晴希决定放弃柔道，宣布退出大学柔道部的那天，和一起退出柔道部的青梅竹马桥本一马组成男子啦啦队，吸引各具特色的成员加入，没有经验、土法炼钢的他们，却以全国大赛为目标。

坂东晴希(米内佑希 配音)曾经渴望成为一名柔道运动员，然而随着对这项运动的深入了解，晴希渐渐发现，自己也许永远都无法参透其中的精髓了。于是，晴希选择了放弃。桥本一马(冈本信彦 配音)是晴希青梅竹马的玩伴，看到晴希消沉的模样，一马组建了独一无二的男子拉拉队“BREAKERS”，邀请晴希加入。

就这样，晴希进入了一个前所未知的新世界。和晴希一起的，还有性格非常严厉，但穿衣品味风格异常糟糕的德川翔(小野友树 配音)、虽然体格现状，但毫无运动细胞的沟口涉(杉田智和 配音)、重量级选手，想要通过跳啦啦操来减肥的远野浩司(林勇 配音)。