日本各地出现了异空间「魔都」──

由于只有女性能从魔都的「桃」得到特异的能力，

因此便由女兵组成了「魔防队」。

某一天，过着抑郁生活的男高中生──和仓优希不小心闯进了突发性产生的魔都入口，

在那里，遇到了「魔防队」第七组的美丽队长──羽前京香，　而她竟向优希宣言：「我要你当我的奴隶。」

正传“罪与罚与赎罪的少女(罪と罚と赎いの少女)”

“那アイ(眼/爱)会改变命运”(「そのアイ(眼/愛)が運命を変える」)

失去姐姐而过著懒散生活的男主角・皋月驱和他的青梅竹马水奈瀬由佳，突然一同被卷入一个染红的世界。然而，与另外4位来自相同世界少年少女一同被卷入到这个事件中，并且以打倒黑骑士们为目的。为了生存下去，并结束“赤之夜”，他们与黑骑士们的战斗也就此开始。

CrossOver追加平行外传“虚空镜界(虚ろなる镜界)”

“这是新世界的魔术(Real)”。(「これが新しい世界の魔術(リアル)」)

Xbox 360版追加的新系列，正外传两个故事开始于同一剧情时间点，男主角天见修隐藏他是位现代科学和魔术融合的“现代魔术师”的身份，并把距离他周围的时间、地点由手机发出。同时街上也谣传著“只要一看见分身(双重存在)后、之后就会行踪不明”。修以他身为现代魔法师的直觉察觉到这令人不安的迹象，就开始调查这起秘密失踪案件。但是他们在解决“双重存在”的问题并接连击败最后的主谋时，却使那能够对抗奈落陨落的力量“人工翠玉碑”彻底消失，于是百野刊在此之后开始正式插手正传的赤夜(幻灯结界)事件(虚空镜界篇自此结束，此时正传剧情尚未完结)。

后传“- Resona Forma -”

本作囊括Before·If·After三个故事，补完本篇中未能详细描述的过去与未来。

before

在原作‘11eyes -罪と罚と赎いの少女-’中登场，阻挡在主角面前的不死魔女“リーゼロッテ·ヴェルクマイスター”。本作将要描述这位魔女在过去与‘禁书目录圣省’的6位使徒展开壮烈死战之时的故事。

if

她唯一心爱的男人，是与她在约550前并肩作战的ドラスベニア国王，维拉德(ヴェラード)。维拉德使用拥有看见未来力量的魔具‘劫之眼 (アイオンの眼)’，让时间追溯到莉婕罗堤尚未成为魔女，走向残酷命运之前的时代，为了阻止纯洁少女 "莉婕罗堤·威尔克麦斯达"(リゼット·ヴェルトール)成为魔女而奔赴战场的故事。

after

原作‘11eyes -罪と罚と赎いの少女-’1年后的世界。由于魔女·リーゼロッテ而被迫面对严苛战斗的主角们，踏上了拯救世界的旅途，在这个过程中，主角与同伴们产生无法磨灭的羁绊。草壁美铃、橘菊理等三年级生，从虹陵馆学园毕业。驱等人则升级，各自欢乐的过著和平的学园生活。在平淡的日常生活中，他们面临了新的烦恼。

为了脱离童贞(DT)而烦恼的高中生羽柴纯一听从损友三人组半强迫建议“只要土下座拜托辣妹就能告别童贞”的迷信，于是抱著一丝希望找到了班里的辣妹—八女由佳奈并向她跪下告白。没想到居然大成功!?虽然顺利地开始了交往，但面对尽管是碧池却守备坚固的八女，非现充的羽柴过着被玩弄的每一天……距离告别童贞还很远。究竟羽柴能否从“第一次”当中毕业!?两人的校园恋爱物语就此开始。

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