春假时，为了购买动画蓝光片而打工的御宅族安艺伦也，在开满樱花的坡道上邂逅一位少女，帮她捡一顶被风吹走的贝雷帽。于是有了以该少女为女主角制作同人游戏的构想。一周后才知道，少女是他的同班同学加藤惠。

为了制作同人游戏，安艺伦也还要说服同年级美术部的绘画高手泽村·斯潘塞·英梨梨，以及优等生学姐霞之丘诗羽和加藤惠共组游戏社团，开始同人游戏的制作。之后又与过去认识的学妹波岛出海有了连络，紧接着擅长音乐的表姐冰堂美智留也加入社团。

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2003年，在英国威尔士梅尔帝亚纳魔法学校学习魔法并以第一名毕业的涅吉·史普林菲尔德(ネギ·スプリングフィールド)(虚岁10岁)，目标是成为像他爸爸一样的“伟大的魔法师”(Magister Magi)。毕业的修业课程是“a teacher in Japan”——被指派到日本埼玉县麻帆良学园担任实习教师。想不到，他竟然被分配到“女子中学”，到有31个人的问题班级“2年A班”(2-A)担任班导师……

在少年支仓孝平(小野大辅 配音)的记忆中，自己好像一直都在转学中，这样的遭遇使得孝平很难拥有一段长久且稳定的友谊。这一次，孝平转入了修智馆学院，这所全日制的寄宿学校为孝平晦暗的心情带来了新的希望，孝平决定，一定要在这所学校里交到要好的朋友。

很快的，热情善良的孝平身边就聚集了一群朋友们。阳光健气的千堂瑛里华(神田理江 配音)，娇小害羞的东仪白(峰岸由里香 配音)，沉默冷静的红瀬桐叶(鸣海绘里香 配音)，这些可爱女孩子们的存在丰富了孝平的课余生活，但在交往的同时，孝平也在不经意间发现了她们的秘密，这也为他进入学生会这“狼窝”奠定了基础。

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