在东京求学的粕壁隼，因为接到奶奶的死讯而回到了阔别三年的老家，却发现奶奶所经营的咖啡厅里竟然住着五个女孩子。他本想拆掉这家店，与过去一刀两段，却在跟这五个女孩子相处过程中想起了奶奶开店的初衷，打消了拆除老店的想法，并决定和这五个女生一起重新开始经营这家店。

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故事设定在第二次世界大战后，日本的国家主权受制于美国。90年代中期。日本首都制药公司在大脑机能领域开发出了新药。新进和平塾得知后开始推行雅典娜计划。共聚集了26个小于5岁的孩子，人工培养出类学者症候群。但药物严重的副作用导致孩子相继死亡，最终计划以失败告终。在这些孩子中NINE和TWELVE一起逃出了试验基地，而未曾逃走但幸存下来的FIVE则秘密被美国政府收留。

长大后NINE和TWELVE于某日在青森县的核废料处理设施中合同抢走了秘密开发的雏形原子弹，之后他们二人以斯芬克斯的代号针对参与了雅典娜计划的政府官员进行复仇。于是他们成功地炸毁了东京都厅的部分建筑，以此向社会引起警示。

半年后，暑假即将开始前的夏日里，先前不明身份的两人化名为九重新(其中九代表9)的9与久见冬二(日语中“冬”与10读音相同，二则指2)的12以转校生的名义来到一所高中，但不久又离开，期间他们在一栋大楼制造了恐怖袭击事件，并以此为某一计划的开始。之后两人开始以斯宾克斯(スピンクス)为名，在城市制造炸弹袭击事件(并未伤及人员)向他们所憎恨的已终止进行的“雅典娜计划”的策划者及执行者复仇，为此展开了与日本警视厅(特别是柴崎健次郎)的对战。

雅典娜计划(アテネ计画)

在90年代中期，专门从事脑机能研究的日本首都制药公司偶然开发出一种新药，成为一切的开端。新进平和塾看中他们的研究成果，于是就策划出“雅典娜计划”，毫无保留地投放大量研究费用和最优秀的人才。该计划成立的最终目标就是要用人工的方法，培育出一群有近似学者症候群的小朋友，换句话说就是他们想制造出一群人工天才。

不过那种新药不是对所有人都有效，只是对在成长期，即是五岁以下的小朋友才有效。因此主导这个计划的团体-新进平和塾，便为全国五岁以下的孤儿进行智能测试，将通过测试的小朋友召集回来。最后一共集合了26个小孩进行计划，他们全都是白老鼠。他们把那个地方称为“租界”，在那里进行实验。那里的小孩全都没有名字，因为是用实验号码来称呼他们。

不仅如此，新药的药效不是普通人的肉体和精神能够轻易承受。很多实验体的身体支持不了，又或是精神上出现严重问题，结果大部分都受不住而死掉。到最后，雅典娜计划以失败告终。

美国政府发现了这计划后随之介入，于是计划被迫于7年前被迫终止。实验结束之后，只Five存活下来，被美国机构接收，NINE和TWELVE则8年前(计划终止前一年)于“租界”放火，破坏保安系统，并且翻墙逃出。

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因其太空西部主题，枪神是关于未来世界的一个人类迁徙居住的荒凉星球中，一个绰号“人间台风”的通缉犯恐慌威席和两个跟随威席以降低保险公司要赔偿因恐慌威席所造成的损失的保险公司雇员。大部分赔偿是因赏金猎人 要猎杀恐慌威席以获取极高额赏金——60,000,000,000$$(六百亿$$)。而恐慌威席在重获记忆的路上，他尽量避免造成伤亡。后来他与伍夫伍德，一位枪法准确，自称牧师的人共旅。

当剧情继续发展，读者会更清楚恐慌威席的过去和硝烟星球——人间台风们生活的星球的神秘历史。

漫画版《TRIGUN》(1995年4月 - 1997年1月)

最初于《月刊少年CAPTIAN》连载。最初试载版刊登于1995年2月。试载时的故事背景与之后连载时相同，但在主角细节上与试载版时稍微有点不一样。后来作为外传收录在单行本中。

同年4月开始正式连载，之后在1997年1月突然停止连载。

之后在《TRIGUN MAXIMUM》开始连载中，《TRIGUN》与《TRIGUN MAXIMUM》中间不连续的部分在《Animage》1998年9月号的增刊上以《TRIGUN最终完成型》的形式补完，德间书店之后将1997年1月为止的内容发行为全三卷《TRIGUN》单行本，少年画报社则将同一时期的连载收录于两卷单行本，内容相同，只是封面和卷末的附录不同。这两或三卷的单行本又被称作“无印”。

2010年时发行完全版，也是全两册收录。

漫画版《TRIGUN MAXIMUM》(1997年 - 2007年)

1997年10月起改以TRIGUN MAXIMUM名义在少年画报社的月刊《YOUNG KING OURs》上连载。新故事的时间是在《TRIGUN》之后的二年，风格上有微妙的变化，与《TRIGUN》时期相比更偏向青年漫画;在画风和人物性格描写方面也有明显差异。连载将近十年，在2007年5月号的最终话完结。

《TRIGUN MAXIMUM》单行本全14册，最后一卷即第14册于2008年2月27日发行。2010年再次发行完全版，全7册。