日俄战争结束后的1907年冬天，原隶属陆军第一师团士兵杉元佐一因服役期满退役。受了于1904年（明治37年）战死的同乡战友遗嘱“请治好我妻子的眼睛”之托，故而需要大量金钱的杉元，听闻北海道的河川充满沙金，便只身前往北海道淘金。在淘金时，杉元偶然听闻一起牵涉到约值八亿日圆的黄金劫案。

之后，杉元遭到熊攻击，在击退熊的过程中，结识了阿伊努族少女阿席莉帕，而阿席莉帕的父亲正是死于那起抢案的其中一人。为了探寻父亲身亡的真相，阿席莉帕同意与杉元共同行动：由自战争中生还的杉元负责战斗、因阿伊努信仰而不愿意杀人的阿席莉帕，则运用阿伊努人的智慧负责追踪与野外求生。这特别的二人组就此踏上追寻黄金的险恶之旅。

故事发生在19世纪（维多利亚时代）的英格兰。主角是17岁的少女莉迪雅?克鲁顿。她可以和妖精说话，因此被称为“妖精博士”。为了和父亲共度复活节，她和伙伴尼可一起乘船前往伦敦。在船上他们遇到了自称是传说中的“青骑士伯爵”的英俊青年爱德格。爱德格为了得到宝剑，而向莉迪雅寻求帮助。莉迪雅虽然觉得爱德格不大可信，但还是听信了他的花言巧语，加入他的队伍。从此莉迪雅被卷入了围绕宝剑的争夺之中。

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千叶县立总北高中的新生小野田坂道是个热爱动漫、游戏和秋叶原的御宅族。由于在国中时没有遇到同样喜好的同学，所以他打算进高中后一定要加入动漫研究社，不过却因社员不足而中止活动。面对这种状况，坂道因此意志消沉。另一方面，同样是高一新生，国中时活跃于各大自行车比赛的今泉俊辅，某日在训练时见到坂道骑车爬坡的过程，故事从此展开……。