2029年，日本因突然爆发的”Apocalypse Virus（天启病毒）“的蔓延而陷入了混乱之中。处于无政府状态的日本，受到了由超国家之间所组织成的名为“GHQ”的组织的武力介入并接受其统治，东京的六本木更成为被封锁的地区。之后又以名为“lost christmas（失落的圣诞）”的事件为契机，日本失去了独立国家的实质权力，并被赋予了表面上的自治权，由此人们开始享受短暂的和平。

时光流逝，10年后的2039年。少年樱满集怀抱着抑郁的心境，并对世间冷眼相待。樱满集是在天王州第一高校就读的高中二年生，与同学们保持着一定距离的同时，度过着闲散而又平静的日子。

然而集安稳的日常在某一天突然宣告结束。那天放学后，在自己中意的老地方和一名少女不期而遇。少女名为楪祈。她正是集所憧憬，并在网上有着巨大影响力的歌手。而她也有不为人知的一面。祈正是由17岁青少年恙神涯所率领的“葬仪社”——一个在被封锁的城市中歌颂着从”GHQ“手中得到”日本的解放“而赌上性命不断孤独地战斗着的抵抗组织——的成员之一。

集在祈与涯引导之下，与葬仪社而发生了关联。尔后因为关系紧迫获被女主使用了虚空基因组，他的右手上出现了“王之刻印”。通过刻印，集可以自在地从人的身体里抽取出名为“void（虚空）”的物质，并以借此为武器得到战斗的力量。然而这也仅仅是，他所背负的“罪之王冠”的物语的开幕罢了……

居住在吉祥寺的高中生我闻悠太是汇整超自然现象的博客“轻轻松松破假象”(キリキリバサラ)的管理人，他一心想着靠联盟行销致富。一天悠太偶然知道了网络上人气很高的占卜师相川实优羽，并对她抱有好感。在悠太的后辈，同时也是网站运营团队成员的成泽棱歌的陪同下，他前往成明高校与相川实优羽会面，最终让她加入运营团队。

之后，悠太在棱歌的要求下赴成明大学采访以肯定超自然现象而出名的桥上谏征教授，但当他进入到研究室的时候，却发现教授已经被人杀害。3月1日，即教授被杀的数日后，井之头公园的池塘内发现256具遗体。与此同时，悠太的身边也聚集着与这一连串事件相关的人物，而随着悠太等人对事件调查的深入，一系列事实和真相也逐渐浮出水面。