故事发生在面积占据东京都的三分之一，居住着230万名人口且其中八成人口是学生的巨大都市“学园都市”。学园都市的学生均会接受超能力开发，借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。能力者以范围和威力分为无能力者Level 0至超能力者Level 5。

主角御坂美琴是学园都市中仅七位超能力者Level 5的其中一人，排行第三。她是拥有操纵电击能力的“电击使”，因其特有的绝招(将硬币以音速的3倍的初始速度发射)“超电磁炮Railgun”而得名。

本作通过美琴的视角来描绘学园都市的平常而不平凡的日常生活，也叙述学园都市秘密进行非人道性质的实验，从而使大家对于本作及本篇《魔法禁书目录》的背景(世界观中科学侧)的认识慢慢变得清楚。
 

本传故事

眼神凶恶、看起来像不良少年的高须龙儿，事实上连跟别人吵架都没有吵过，是个很普通的少年。如今，他正要升上高中二年级，并幸运地跟暗恋一年的栉枝实乃梨和高一时的好友北村祐作同班。担心自己再度被新班级的同学误会的龙儿，却意外地因为与被称为“掌中老虎”的逢坂大河邂逅而解开大家对他的误解。

事实上，大河暗恋的是北村。某天大河正要将情书放进北村的书包时，龙儿正好走进教室里。慌忙间，大河将情书误放进龙儿的书包中，于是她决定晚上带着木刀潜入龙儿家中将情书抢回来，没想到放进龙儿书包内的只有信封。那一晚，龙儿决定要帮助大河，让她能与北村交往。由于大河一人独居，且完全不会作家事及料理，因此龙儿与大河便常常一起在龙儿家吃晚餐、一起上学、一起去超市买料理材料。因为这件事情，他们两人被实乃梨与北村误解正在交往了……

书名《TIGER×DRAGON!》即是来自于“掌中老虎”的老虎及“龙儿”的龙。

外传故事《幸福的樱色龙卷风》

高一学生富家幸太因为其生来就会招来不幸的体质，与狩野樱意外邂逅并成为了朋友。樱的姐姐——学生会长狩野堇，借此命令幸太辅导樱糟糕的功课。随着幸太与樱的关系越来越亲密，围绕在幸太身边的不幸也慢慢地消散了?

每集列表

柴木耕太(高桥信 配音)是一位非常平凡的男子高中生，性格木讷的他向来就没有什么女生缘，一直过着形单影只的生活。一次偶然中，耕太得到了一本魔导书，通过这本魔导书，耕太召唤出了名为璐璐萌(三森铃子 配音)的魔女。璐璐萌是一个可以实现别人愿望的魔女，但是对方必须付出生命作为交换，可是，因为违反了魔界的规定，璐璐萌被开除了魔籍，不仅契约失效，而且无家可归。

善良的耕太收留了璐璐萌，就这样两个人开始了吵吵闹闹的同居生活，和他们一起的，还有璐璐萌的黑猫使魔奇洛(福圆美里 配音)。热热闹闹的每一天拉开了序幕。

各集列表