故事发生在前传故事《鹫尾须美是勇者》两年后，神世纪300年。主要讲述初中二年级学生结城友奈，天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系。本作正是以友奈等人的“勇者部”的活动为主线进行相关叙述的。

表面看来，结城友奈(照井春佳 配音)是一个平凡的初中二年级女生，个性开朗热情的她是校园中的活跃分子，深受老师和朋友们的喜爱。可实际上，放课后的她还有着另一重身份——勇者部的部员。

友奈的邻居兼好友，沉默寡言却意外的温柔的东乡美森(三森铃子 配音)、个性大大咧咧果断直率，却意外的擅长做家务的犬吠埼风(内山夕实 配音)、风的妹妹，像小动物一样惹人怜爱的犬吠埼树(黑泽朋世 配音)、看似桀骜不驯难以接近，实际上非常害羞傲娇的三好夏凛(长妻树里 配音)，除了友奈，活跃在勇者部的是这些性格迥异的女孩们，她们所要面对的，是名为巴提克的强大敌人。

主角苗木诚于希望之峰学园举行开学典礼当天踏进校门后不久便突然晕倒。当他醒来时发现自己身旁有一张和恶作剧没两样的入学章程。他在看完章程后环顾四周，这下他才发现自己身在一个窗户被金属板所封闭的课室……

故事发生在私立希望之峰学园中，苛刻的入学条件和优厚的毕业待遇让这所历史悠久的学园笼罩着一股贵族和精英的气氛，只有超高校级的学生才有资格进入其中学习。今年，苗木诚(绪方惠美 配音)以“超高校级幸运”为由收到了来自学园的录取通知，奇怪的是，他平凡的生活中并没有遇到过什么幸运的事情，如果硬要说有的话，那就是此次的录取了。

这一届，包括苗木诚在内共有15名新生，均为各个领域内的尖端人士，而在开学典礼上，黑白熊(大山羡代 配音)的出现却让他们落入了永恒的炼狱。闭锁的出口，昏暗的空间，残酷的脱出规则，激烈的学级审判，只有双手沾满鲜血的人才能够成为最后的胜者重获自由。这一回，被称为超高校级幸运的苗木诚能够继续他的幸运吗?