日俄战争结束后的1907年冬天，原隶属陆军第一师团士兵杉元佐一因服役期满退役。受了于1904年（明治37年）战死的同乡战友遗嘱“请治好我妻子的眼睛”之托，故而需要大量金钱的杉元，听闻北海道的河川充满沙金，便只身前往北海道淘金。在淘金时，杉元偶然听闻一起牵涉到约值八亿日圆的黄金劫案。

之后，杉元遭到熊攻击，在击退熊的过程中，结识了阿伊努族少女阿席莉帕，而阿席莉帕的父亲正是死于那起抢案的其中一人。为了探寻父亲身亡的真相，阿席莉帕同意与杉元共同行动：由自战争中生还的杉元负责战斗、因阿伊努信仰而不愿意杀人的阿席莉帕，则运用阿伊努人的智慧负责追踪与野外求生。这特别的二人组就此踏上追寻黄金的险恶之旅。

故事讲述一位中二病女大学生花园百合铃偶然从魔界召唤了恶魔邪神酱，却不知道让邪神酱回去的方法。邪神酱说让召唤者死亡就行了，于是邪神酱为了回到魔界开始各种暗杀行动，然而花园百合铃拥有彻底碾压邪神酱的强大武力，因此两人被迫展开日常喜剧的同居生活。

花园百合铃（大森日雅 配音）是一个标准的中二少女，虽然已经升入了大学，还整日里一副哥特萝莉的打扮，虽然右眼带着眼罩，但实际上视力毫无问题。表面看来，百合铃有些古怪和难以接近，可实际上，她对待朋友非常的热情友善。一次偶然中，百合铃竟然从魔界里召唤出了恶魔邪神酱（铃木爱奈 配音），她可是那里里地位最崇高的恶魔。

邪神酱一心想要回到魔界，而回去的唯一方法就是杀死她的召唤者百合铃，可是实际上，邪神酱是一个笨手笨脚的废柴，每当她设计想要袭击百合铃时，总是会被后者在有意无意之中一招化解。除了邪神酱外，美杜莎（久保田未梦 配音）、佩柯拉（小坂井祐莉绘 配音）等恶魔也降临人间。

在每一个角落都被探索完毕的世界中，唯一残留的秘境——大洞穴“深渊”。

不知道延续到何方，深不见底的巨大纵向洞穴，栖息着奇妙奇怪的生物们，

沉眠着现在的人类无法制造的贵重遗物。

“深渊”那充满了不可思议的姿态吸引了人们，并驱使人们展开冒险。

如此，多次挑战大洞穴的冒险者们，陆续得到了“探窟家”的名号。

住在建造于深渊边缘的城镇“奥斯”的孤儿莉可，

梦想着有朝一日成为母亲那样伟大的探窟家，并解开深渊的谜团。

这样的某一天，莉可在探索深渊的途中，捡到了有着少年样貌的机器人……？

深渊的分层

深界一层 “阿比斯之渊”（アビスの渊）：0 - 1350米。

深界二层 “诱惑之森”（诱いの森）：1350 - 2600米，底部为监视基地所在的“逆之森”

深界三层 “大断层”（大断层）：2600 - 7000米。

深界四层“巨人之杯”（巨人の杯）： 7000 - 12000 米。

深界五层“亡骸之海”（なきがらの海）：12000 - 13000 米，高度最低、宽度最大的区段，大型地底湖沉积著大量生物残骸。

深界六层“来无回之都”（还らずの都）：13000 - 15500 米。生骸村所在地，“歼灭之莱莎”曾在此发现真身不明、疑似雷古同族的人形生物。

深界七层“最终极之涡”（最果ての涡）：15500 - ????? 米。

深界极点“奈落之底”（奈落の底）：20000 米以下。

深渊的诅咒

自深渊向上返回超过10米高时，探窟家会遭遇因深渊“力场”而对人体（集中在大脑、心脏、脊髓等维持生命的关键部位）造成的作用现象，下潜越深，上升负荷越大，可借由游走力场较弱处或是弹药包来回避。通常来说，离纵穴越远力场越弱。

自深界一层返回 - 轻微的晕眩与呕吐感。

自深界二层返回 - 严重呕吐感、头痛、末端神经麻痹。

自深界三层返回 - 平衡感异常、幻听、幻觉。

自深界四层返回 - 浑身剧烈疼痛、全身孔洞流血。

自深界五层返回 - 丧失所有感觉、意识混乱、自残行为。似乎无法影响人类没有的感觉。

自深界六层返回 - 丧失人性、人体机能，甚至致死。

自深界七层返回 - 绝对死亡。

探窟家的笛

探窟家的笛是通行证，也是身份的证明，一般也常以笛的颜色代指探险者的级别。

持铃生：学生，为了成为探窟家而学习。

赤笛（红色）：见习生，仅能下潜至多550米。

苍笛（蓝色）：可独当一面的探窟家，可以下潜至深界二层。一般要15岁后才能获得。

月笛（紫色）：教师级探窟家。

黑笛（黑色）：大师级探窟家，可以下潜至深界四层。

白笛（白色）：传说级探窟家。其持有的白笛皆为使用遗物“生命回响之石”加工而成，且只有本人可使用，被生骸村的人们称为“梅迪波图特”（人类结晶之乐器，需至少牺牲一名人类）。深界五层“前线基地”内进入深界六层的唯一突破口需要以白笛启动，除此之外还能让身上的所持遗物觉醒，发挥超常力量。

已知的白笛

歼灭卿“歼灭之莱莎”

不动卿“不动如山之奥森”

黎明卿“崭新之波多尔多”

神秘卿“神秘之斯拉乔”

先导卿“天选之瓦库那”