2003年，在英国威尔士梅尔帝亚纳魔法学校学习魔法并以第一名毕业的涅吉·史普林菲尔德(ネギ·スプリングフィールド)(虚岁10岁)，目标是成为像他爸爸一样的“伟大的魔法师”(Magister Magi)。毕业的修业课程是“a teacher in Japan”——被指派到日本埼玉县麻帆良学园担任实习教师。想不到，他竟然被分配到“女子中学”，到有31个人的问题班级“2年A班”(2-A)担任班导师……

故事背景始于自从开发FRACTALE系统(フラクタル・システム)成功后，人类不再需要工作就能生活下去。这样的乐园维持了千年，系统仍然运作，可是再没有人能准确解析系统的状态。居住在世上大部分的人类，依然相信只要系统维持运作，就能永远的幸福下去。可是随着某小岛的FRACTALE系统开始崩坏，故事进入序幕。

每天过着平淡生活的少年克莱因救下了因被人追赶而堕崖的少女芙琉奈。这次的偶遇使克莱因的心神起伏不巳，然而一晚过后芙琉奈却突然消失得无影无踪，只遗留了一枚胸针。芙琉奈说这是她笑容的泉源，看了克莱因婴孩时期的笑容后更相信胸针能守护着克莱因。胸针内封印着一个跟芙琉奈相似的女孩奈莎。克莱因与从胸针具现化的奈莎一起踏上找寻芙琉奈的旅途，终于发现FRACTALE系统的秘密......

用语

FRACTALE系统 (フラクタルシステム)

又称“分形系统”，为22世纪网络化的科学产物，是数量高达数兆的电脑的总称。通过植入体内的FRACTALE终端定期向浮空服务器传送生活数据，使所有人能得到基本的保障，并且赚取一定数量的收入。系统主宰著世界，造就了一个就算不工作也能保证生活、没有争端的世界。

浮空服务器

又称“Balloon”(气球)，漂浮在平流层固定点的高空浮动服务器中继站。

FRACTALE终端

微型装置，能植入人体内，能对人体的营养进行调节，也能培植药剂成分，防止人体患病。还能使人直接与电子分身沟通。可是会使人容易受跟收发器同步协调的影响。个体能除去FRACTALE终端以避免系统的监控，但同样会丧失系统所带来的利益。

星

实为卫星般的收发器，围绕着地球运转，主要用作数据连输(像现今的互联网)，也负责与植有FRACTALE终端的个体进行协调，当人凝视星时，就会自动获得当事人的数据。

奉星祭 (星祭り)

由修道院举行的“庆典”。与普通的节日不同，人们需要靠近向一条指向天空的天线，亦要凝视着在天线上方的“星”。修道院对外称参加奉星祭是为了获得星的庇护，但事实上是更新人体中的纳米机器，即“洗脑”，以使人们摒弃不必要的疑惑。另外，在更新过程中，装有FRACTALE终端的人都将无法移动。此外，附有FRACTALE终端的人可以带上特制的眼镜，以避免与“星”进行同步更新。

迷失千年运动 (ロストミレニアム運動)

是为了摆脱FRACTALE系统而诞生的运动。参与运动的有不同的部族，其中就包括以桑达(Sunda)为首的部族“格拉尼茨家(Granitz family)”，有关“格拉尼茨家”详情请参见格拉尼茨家。

修道院 (僧院)

由教士主理的教派，负责维护FRACTALE 系统。鼓励人民对星许愿，以协调人体。院内设有高科技武器，作防卫用途。

电子分身 (ドッペル)

名称取自德文doppelgänger的简称doppel，真实世界内以虚拟的层面互动地呈现一个人。大部分分身为真人创立的代替物，一般的电子分身外型以机器人为主，但也有例外，如奈莎的外型跟人类无异。电子分身能触碰及被触及，能拥有像真人般的感觉，但只有奈莎为唯一的例子。电子分身由数据组成，因此能渗透入电子显示屏，在任何地方随意出现。可是遇上电流干扰，分身便会消失。

笨蛋王子来袭篇

升上高中后一个人来到山形的高中生筒井雪隆，住进了学生附近的宿舍，却发现自己的租处已被入侵，里面有个自称自己是外星人的失忆男子。本来打算将他赶出去，但是在同情心及对方的说服下开始相信他是外星人并和他同居，安定下来不久后，王子的护卫军紧追而来，同时发现降落地落在好战的狄肯星人地盘上还有上研究外星人的机构同时也在追查，情况变的十分危急，就在雪隆为了外星王子的安危心急如焚时，本人却攸闲的在逛街买衣服。

食人鬼篇

学校的校外教学期间，4个学生偶然目击到同年级的同学被食人鬼吃掉，为了防止自己也成为食人鬼的目标，于是4个人对食人鬼展开追查，但4人中的矢先在此时却失踨了，担心自身安危的众人于是分别向奇怪的精神科医生求助，这篇故事是王子在故事中所创作的漫画，是一种剧中剧的型式。

原色战队篇

起因于卑鄙的笨蛋王子绑架了5个住在东京的小学生。在放学回家的途中，5人被王子的太空船绑架，在王子无理的要求下，5个人经过改造，成为会变身的超级原色战队的成员，5人就这样被卷入笨蛋王子巧妙而充满恶意的圈套之中。

马克巴克女王篇

在宇宙中流浪的马克巴克族，全体由雌性组成，在繁殖期时，女王会在相异的种族中选出一个雄性体来做为交配的对象，其后便可产下无数的后代。但在交配后异种族的数世代内会因为生育下降而造成种族灭绝。因为知道马克巴克女王前来地球的目地，所以王子护卫军的三人在接待女王时极力的阻止女王对地球产生好感，但就在此时一个和女朋友一起来到饭店的女子却和女王一见钟情了。

高校野球地区预选篇

山形县的夏季高中棒球选手预选。雪隆所属的如月高中棒球部再差一胜就能得到进入甲子园的资格、就在大家为胜利努力时，玻璃自己破碎之类的灵异现象却频繁的困扰着他们。因为支持强棒有机会能前进甲子园而太兴奋的狄肯星人、骑着单车追在如月高中前往比赛场地的巴士后面，突然整辆巴士消失在眼前，预赛马上要开始了，雪隆一行人却被困在里面的，众人焦急的思考如何才能在比赛前脱困。

人鱼篇

一个知名企业老董在拍卖会上买下一条双尾人鱼，被警告不能对人鱼说谎，因为一旦对她说谎，人鱼就会本能的用舌头攻击对方。这个女人鱼是外星盗猎集团在她的原栖地抓到的最后一群人鱼中的其中一只，和盗猎者作出约定，她愿意做足所有人等份的工作请放过其他的人鱼。但是盗猎者并没有放过人鱼的打算，就在这个时候，被王子改造成原色战队5人组的清水，正因为父亲的工作问题必需面临转学的命运。

笨蛋王子结婚篇

很久不见的笨蛋王子，突然造访雪隆的宿舍。一开口就说有人在追我，借我躲一下，就在讲话的当口，追兵杀到，原来是王子的亲弟弟，铎古拉星的第二王子，他为了让笨蛋王子屡行和玛古拉星公主的婚约并继承王位而来。原来王子通过一个法案，王位候选人必需在20岁时结婚，否则就由第二顺位的继承人继承王位，为了让笨蛋王子可以不结婚不当国王，王子护卫军难得的和王子同一阵线，展开逃婚行动。

蜜月篇

时光飞逝，笨蛋王子和雪隆的相遇也过了十年，王子最后和鲁娜结婚，女儿也7岁大了，之前忙着让铎古拉王朝的内政上轨道，一直没有蜜月的两人出发前往迟来的蜜月。但是不幸的遇上了凶恶的武装绑架集团。

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