大正年间，豆狸小豆从乡下到大城市大阪办事，在以幻术戏弄人类时，于春来亭遇见知名落语家大黑亭文狐，见到她以落语让人类沉醉不已。小豆深受感动，立志成为落语家，并求文狐收自己为徒。身为上方落语四天王之一的文狐原先无意收徒，但在见到小豆的诚意后，允许她偷师。小豆寄于文狐篱下，除了学习有关落语的一切，也精进自身的幻术，并认识文狐以外的落语界的人士，包括四天王之一的椿白团治和他的弟子椿白良。

文狐曾与上一代大黑亭约好不收弟子。为了避免小豆遭业界封杀，文狐便按照白团治的建议，将她逐出师门，并让她接受四天王的考验，以证明她有能耐继承“大黑亭”之名。在通过考验后，小豆成功回到文狐门下。在一次演出后，小豆发现自己的变身术失灵，正逐渐变回原形。为了避免失去法力，小豆在天神的帮助下进入地狱，向传说中的狸猫左卫门讨教。

21世纪初，日本的首都东京被外部入侵者“姆”(Mu)用半圆形的障壁与外界隔绝，身处障壁外部的人称该障壁为“东京木星”(Tokyo Jupiter，因障壁的外观酷似木星)，身处内部的人则相信“东京以外的世界已经灭亡”。数年之后，居住在东京的主角神名绫人在赶往模拟考试的试场途中，遇上了电车意外。绫人在寻找救援的途中，遇到了一名神秘少女“美嶋玲香”，并在她的引导之下，到了一座地下神殿。此时，东京上空突然出现了会“唱歌”的神秘“物体”，并与绫人产生了“共鸣”，使他在神殿倒下了。在混乱的意识之中，绫人说了一声“RahXephon”。然后，神殿内的“巨人”觉醒了……

与太郎放浪篇

单行本第1卷到第2卷收录。舞台是昭和50年代时。在监狱刑满出狱的原小混混的与太郎，在1年前因慰问会而来访的落语家第八代有乐亭八云表演的死神闻之感动，出狱后就直奔八云表演的寄席，并对他提出成为弟子的申请。原来不打算收弟子的八云，却答应用他并赋予他与太郎之名而一起行动，并在他家中与八云的养女小夏相遇。

八云与助六篇

单行本第2卷到第5卷收录。舞台是战争前到昭和30年代时。“放浪篇”的前传。描写年轻时的第八代八云当时还叫菊比古，与小夏的父亲也是同门的助六当时还叫初太郎的青春模样。

助六再现篇

单行本第5卷以后收录。舞台是昭和末期到平成初期时。落语受欢迎度式微，都市内的寄席只剩下1轩的时候，磨练技艺的与太郎升为真打，并继承小夏的父亲“助六”的名号。