为对抗残暴罪犯，存在着警察无法应对的治安危机的世界之中，出现了一种弥补警察不足的武装侦探，在法律限制内解决个人或组织的委托，通称“武侦”。2009年，东京武侦高中是专门培育武侦的特殊学校，学生的义务是必须携带枪械与刀剑，在这所学校侦探科二年级的男主角远山金次，被自己所拥有的某种特殊体质(一种会在某种契机之下使大脑细胞高度活性化，并且附带某种奇怪的副作用)所深深困扰著，对于这一点他始终希望对其他人保密，只祈求能过平凡的校园生活…

可惜事与愿违，二年级的远山金次在某天上学途中被卷入一起“武侦杀手”的炸弹魔攻击，在身处绝境时，一位美少女从天而降，从此金次与强袭科的超精英─S级武侦神崎·H·亚里亚相遇(外表可爱、身材娇小却非常有能力，同时也是个狂暴并富有攻击性的女孩)，就这样，被迫与最强武侦亚里亚组队的金次，开始了面对凶恶罪犯的日常生活，而他冀望的平凡生活也逐渐远去…

武侦相关

武侦(武装侦探)

为了对抗凶恶化犯罪而新设的国家资格。

武侦等级由低到高为E级、D级、C级、B级、A级、S级以及R级。

S级的评定标准是可以单人对战一个特种部队中队。而R级则可以对战整个大队，甚至可以单人灭掉一个极小国的全部军队。

S级的人数极少，R级更是全世界仅有七名的强者(取Royal字的头字R，代表其实力足以单独保护国家元首或王室)。

E级之下，还有一般不会用到的F级。

超侦

泛指使用超能力进行搜查及作战的武侦。

超侦以G为等级，G后面会有带有数字，数字越大代表能力越强。

双武者

会使用双刀、双枪或是任何双手同时使用武器技巧的武侦通称。

亚鲁卡达

在武侦之间广泛流传的一种近身格斗技的通称。

在防弹技术长足进步的时代，多数的手枪弹药已经无法打穿武侦所穿着的防弹衣，而两名穿着防弹衣的武侦之间发生近距离格斗战时，手枪不是一种贯穿杀伤性武器，而是作为一种重击武器被使用(被击中虽然打不死，但还是会很痛)，这种战斗就被称为亚鲁卡达。熟练的武侦甚至能利用手枪的冲击力加速或是改变身体轨迹。

不只是手枪，多数拥有双武者称号的武侦也会交替使用小刀或是匕首等近身武器作战。

武侦宪章：

武侦宪章第一条：相信同伴，帮助同伴。

武侦宪章第二条：与委托人订下的契约，必须确实遵守。

武侦宪章第三条：要有实力，不过在那之前，必须先走在正道上。

武侦宪章第四条：武侦应当自立自强，对方没求援就不该出手干涉。

武侦宪章第五条：行动快速。武侦必须以先发制人为第一宗旨。

武侦宪章第六条：自我思考，独立行动。

武侦宪章第七条：凡事要做最坏的打算，乐观去行动。

武侦宪章第八条：任务必须彻底完成。

武侦宪章第九条：放眼世界。展翅高飞，不分国籍人种，共同奋战。

武侦宪章第十条：不要放弃，武侦绝不放弃。

(此宪章是以作者在高中时的母校校训为蓝本，并加以修改而成。)

注意：此为作品中国际武侦联盟创立的宪章，与日本武侦法不同，勿混淆。

一宫绘瑠奈在国中时期过着单纯的御宅生活。在亲人与表哥二宫时雨的说服下开始挑选想要就读的高中，挑选条件毫无疑问是“可爱的制服”。最终挑选的结果是私立御神乐学园，虽然原本因为“二宫就读”而在最初就剔除，不过一宫在招生指南上看到御神乐星锁穿着制服的模样后马上就回心转意。不过，开学当天对今后生活心情激动的一宫，却在新生欢迎会上见到学长姐们暴走的身影。而且，这所学校里存在着“一个月内未参加任何社团活动的人将被强制退学”这样的校规。一宫能在学园中度过理想中的校园生活吗?

私立御神乐学园(私立ミカグラ学園)

作为本作背景舞台的学校。采取全住宿制，所有学生必须入住学校所提供的宿舍。

只存在文化类型的社团，而且也不允许建立文化类型以外的社团[b]。并且存在着强制参加社团的校规，无所属社团的人甚至会被退学。

御神乐学园采取完全中学的教育制度。有部分名额直升，部分名额借由入学考试审核从外部招募。

学校腹地广大，且建筑物应有尽有。学园内所有事物皆可由内部购得，包括各种日用品，甚至还有电影院跟游乐园。

每位学生都会拥有一件“终端机”，用来处理学园内生活事物以及“点数”。校园内事务包括各种校内指南以及对于对抗战的完善协助服务。而点数则是校内货币，所有的校内日用品包括餐点和热水都需要用点数来购买，可以借由出席日常课程或在对抗战中取胜来获得。

由御神乐、一宫与二宫的祖先们创建。

社团对抗战(部活対抗戦)

御神乐学园特有的系统。简称对抗战。

校内将会定期举办社团对抗战，用以将各社团排名。因此各社团除了社长以外，还会特别有“代表”一职用来代表社团出席对抗战[c]。

对抗战的场所是整栋校舍，而校舍四周会被结界封住无法通行。选手的身周会有三个心形水晶漂浮着，代表选手的生命值[d]。一个小时内将对手的水晶破坏殆尽，或者是让对手投降即算获胜。如果超过时间仍未分出胜负即算平局，但通常不会有这种事情发生。

对抗战的种类繁多，其中最具影响力的就是“期中战(中間試戦)”与“期末战(期末本戦)”，除此之外还有由学园官方指定出赛者的“单挑战(単発対抗戦)”以及限定一年级生出战的“新秀战(ルーキー戦)”等等。社团对抗战的表现将会影响社团排名，并进一步干涉所有社员的各种待遇，例如住宿与伙食。排名较高的社团会拥有较优良的居住环境以及膳食，相对的排名落后的社团甚至必须睡在走廊尽头楼梯底下的睡袋中。

学园内各处都有监视器，基本上是用来转播对抗战。

变态假扮游戏(変質者ごっこ)

幼年时的一宫原创的游戏。

基本规则以鬼ごっこ(日本游戏，规则近于捉迷藏)演变而来，只不过将鬼变成了变态，并且必须以兴奋状态来追逐未感染者。另外，因为在一宫的主观中有着“变态都跑不快”这样的误解，因此变态被禁止全力奔跑。

游戏的结局是整个公园充满了变态般缓慢行走并故作猥亵的小孩子们。也因为这样，使幼年的一宫以不好的方向声名大噪。