第1季

天才黄金脑(Phi-Brain)是指拥有黄金比例大脑之人，而主角大门界人作为Phi-Brain的候补者之一，为解开传说中的“神之谜题”而展开一场冒险。热爱解谜的私立路德学园高一学生大门界人，在偶然的机遇下挑战了潜藏在学园近郊地下遗迹中的“不可解之谜”，那是由神秘的智囊集团POG所制造的、招致生命危险的“贤者之谜”。被真相激怒的大门界人漂亮地攻克了贤者之谜和愚者之谜，意外地从中获得了“Solver(解答者)”的指名。于是大门界人与青梅竹马的少女井藤野乃叶以及其他拥有解答者身份的同伴们一起，以存在于世界各地的“贤者之谜”和“愚者之谜”为舞台，与POG展开解谜对决。

第2季

与POG结束战斗的界人及同伴们，不断挑战世界各地馀下的愚者之谜并过着和平的学园生活。

有一天，持有俄尔甫斯手镯的谜之团体“Orpheus Order”将整个路德学园封锁了。

接受了从Orpheus Order发出挑战的界人，在学园内的制裁之谜内与普利谢尔对决。可是，之后等着他的，是被由复制的俄尔甫斯环操控着的路德学园学生所制作的致命谜题。

第3季

在Orpheus Order之战后，成功晋级并开始了平稳的学生生活的大门界人面前，新的敌人莱赛尔出现了！

第2轮的挑战开始了！握有关键的是挑战“神之谜题”的男人——真方仁。而最终界人是否能掌握“仁的真实”呢？

前田一也(岛崎信长 配音)是一个过着平凡生活的高中生，但当他从父亲那里获得了一台数码照相机后，前田平凡的生活划上了休止符。对于照相机强大的功能，前田兴致极高，但照相机必须有被拍摄的对象才能产生价值，那么个性耿直善良的前田会将谁作为拍摄的对象呢?

品学兼优在学校有着极高人气的学院偶像新见遥佳(伊藤加奈惠 配音)，行事严谨个性严肃的学生会长室户亚岐(中原麻衣 配音)，个性内向沉默寡言的可爱少女早仓舞衣(金元寿子 配音)，温柔贤惠成熟可人的料理能手柚之木梨奈(大龟明日香 配音)，随着前田不断的按下快门，这些漂亮的女孩子们逐渐聚集在了他的身边。