在藤田和日郎绘制《潮与虎》时，故事中出现了机关傀儡，当时他对此进行调查，认为非常有趣且可以写成长篇故事，在《潮与虎》完结后隔年，1997年3月决定朝马戏团的方向发展故事，并在4月到法国取材，5月拟出故事大纲。

《魔偶马戏团》将整个故事设计为一出马戏团表演，不时有旁白报幕，故事涉及到转世，时间跨度超过两百年。

背景

1772年，白银和白金兄弟从故乡中国前往布拉格学习炼金术，借此精进傀儡技术，两人遇见美女法兰西奴且都爱上了她。1782年，在法兰西奴答应与白银结婚后，忌妒的白金绑架法兰西奴。经过9年追查，白银在法国基伯龙发现法兰西奴，她因患病而被当地居民囚禁，白银为了救她而制造出炼金术的终极产物“柔石”，并以柔石造出生命之水，饮下此水者可延缓老化并获得强力的再生能力。然而在他完成时，法兰西奴已被烧死。之后白银四处流浪，曾短暂造访长崎，结识成濑正二郎，教导他医术和傀儡术。

1814年，白金以法兰西奴的形象制造出自动傀儡，并注入生命之水让它活动起来，但他意识到这个傀儡终究不是真正的法兰西奴，因为傀儡并不会笑，他制造了多个自动傀儡（后来的午夜马戏团）来逗法兰西奴傀儡开心，又制造出Zonapha病虫，将其释放到克罗格村，罹患Zonapha病者在发病时若不逗人发笑就会呼吸困难、生不如死，村中农妇露西尔就是受害者之一，只是两种方法都无法逗笑它。1820年，白银造访克罗格村并想解决白金犯下的错，衰老的他只能带着柔石投井自尽，让井水变成生命之水拯救村民，同时让村民成为“白银”，继承自己的记忆和知识，以及消灭自动傀儡的意志。柔石随后被藏在露西尔的女儿安洁莉娜体内。

1842年，成濑正二郎结识旅行至日本的安洁莉娜，两人互有好感并订下终身，之后正二郎喝下生命之水并改名为才贺正二。夫妻收了汀?麦斯特为养子，并将他取名为才贺贞义，正二还遇到了放弃寻找笑容的法兰西奴傀儡。1910年，安洁莉娜生下爱蕾诺。这家人遭到寻找柔石的自动傀儡袭击，安洁莉娜将体内有柔石的爱蕾诺交给法兰西奴傀儡保护，之后战死，法兰西奴傀儡保住了爱蕾诺，但遭生命之水溶解消灭。正二为了保护爱蕾诺，将她送往基伯龙给露西尔抚养。

1982年，正二造访基伯龙，发现爱蕾诺长期遭到洗脑，其后他得知贞义有了一个名为小胜的私生子。贞义的计划是诈死后将遗产留给小胜，并引发兄弟阋墙，消灭黑贺村的傀儡师一族。贞义的真实身份是白金，白金以生命之水将自己的记忆转移到年轻男童脑袋里，并自称汀?麦斯特，他计划再将记忆转移到小胜脑袋里，借此永生不死。然而此计划遭到正二阻止，正二摧毁了记忆资料，并请露西尔派出爱蕾诺保护小胜。

小胜之幕

身穿布偶装的加藤鸣海在街头发送麦秆马戏团的传单时遇见才贺胜，鸣海的Zonapha病发作，在他把小胜逗笑之后得救了。小胜即将继承“亡父”才贺贞义的巨额遗产，他的兄姊十分不满，便派傀儡师暗杀小胜，所幸爱蕾诺即时现身，她击败对手后表示自己会誓死保护小胜。小胜的叔叔才贺善治希望收养他，借此获得遗产，小胜因此被绑架到才贺豪宅。鸣海和爱蕾诺闯入豪宅救他，在激战之后，炸药炸毁了豪宅并引发火灾，鸣海在灾难中保护小胜，之后他不知所终，只留下断掉的左臂。

在序幕结束后，故事分为两个看似独立但互相交织的主线，分别叙述小胜和爱蕾诺加入仲町马戏团，以及鸣海和同伴四处攻打自动傀儡的过程。

马戏团篇

小胜和爱蕾诺试图上学并回归日常生活，他也希望爱蕾诺能做自己喜欢的事，两人一起加入濒临倒闭的仲町马戏团。他们在那里结识同伴，一起进行戏剧演出，让仲町马戏团的表演步入正轨，而在将展开大型演出时，因为遇到飞机失事而取消。小胜认为自己害死了鸣海并对此耿耿于怀，决定查清父亲为何将遗产留给自己。他回到才贺豪宅，发现才贺贞义计划将记忆转移到自己脑中，他还取得贞义留下的悬丝傀儡。小胜随后到了黑贺村，见到祖父才贺正二，得知贞义的计划并读取了白金的记忆。汀?麦斯特（无脸司令）自揭身份，在暗示自己有个为期两年的计划后便离去。小胜则开始特训，准备与他决战。

傀儡篇

失去左臂的鸣海被奇用生命之水救助，成为“白银”，丧失记忆的他被带到法国，并得知了傀儡与白银间的战争。他四处击破自动傀儡，并会见白银的领导者露西尔，表示自己愿意一起对抗自动傀儡及散播Zonapha病的午夜马戏团。鸣海等人踏上寻找柔石之旅，他在途中目睹太多孩童因Zonapha病痛苦不堪，只好戴上面具掩盖自己的感情。众人打探到午夜马戏团的下个目标在中国，在飞机上，鸣海等人遭到袭击，飞机迫降在仲町马戏团的帐篷前，但他与小胜和白银并未相认。鸣海等人抵达四川后，找到鸣海的师父梁剑峰，梁剑峰道出两百多年前的故事。接着鸣海等人追查到撒哈拉沙漠，与午夜马戏团厮杀，但他们最终发现统帅午夜马戏团的法兰西奴傀儡是冒牌货。

本篇

鸣海受到胡氏企业协助，知晓无脸司令的真实身份，并认为身为法兰西奴转世的爱蕾诺知道Zonapha病的治疗方法，他暂且加入仲町马戏团。小胜在黑贺村进行特训，期间结识了几位年龄相仿的朋友，击败了多个无脸司令派出的刺客。

机关傀儡之神

无脸司令在全世界散播Zonapha病，并掳走了爱蕾诺，搭著飞行船来到法国，并预计搭火箭到国际太空站。小胜一路追到法国与无脸司令对战，战败后被无脸司令以转送装置输入记忆，但小胜喝过爱蕾诺的血（生命之水），得以治愈被洗脑的脑细胞。小胜假装被他洗脑并配合演出，随后救下爱蕾诺，并把无脸司令独自送上宇宙。

鸣海到了美国后负责保护能治疗Zonapha病的机器，在胡氏的安排下，他与仲町马戏团部分成员会合。无脸司令宣告自己对这个世界感到失望，并加速散播Zonapha病。为了问出阻止Zonapha病的方法，仲町马戏团护送航天飞机到俄罗斯的发射基地。众人在途中接连击败自动傀儡，而小胜也终于再次与鸣海相遇并与他并肩作战。小胜搭上航天飞机后，在太空站里和无脸司令决战。无脸司令被小胜的信念说服，不再与他为敌并透露Zonapha病的治疗方法，他坦承自己的错误并选择与坠毁的太空站一起灭亡，而小胜平安返回地球。世界回归和平，故事最后是身穿布偶装、长大后的小胜帮助了受难的陌生孩童。

谢幕

在故事结束后，所有角色不分敌我、不分生或死都一起携手登场，满面笑容地向读者谢幕。

源桃是在空崎的高中就读的一位少女。她的另一面，是守护他人的正义的私立情报机关“月影”的一员。

身为月影新人，在师父雪的训练之下，和伙伴们一起为了守护城市的和平，今天也充满干劲。

故事发生在虚构的城市空崎市，在那里，存在着一支由身手矫健的少女们所组成的特工组织“月影”，每天入夜，少女们的身影便会在月亮的映照下穿梭在城市的角角落落，守护这座城市与市民们的安全。犯罪组织“魍魉”一直对空崎市虎视眈眈，屡屡进犯，他们是月影最大也是最难对付的对手。

源桃（安斋由香里 配音）是一名高中二年级的学生，本来 平凡无异的她，凭借着自己的特殊能力，在机缘巧合之下加入了月影。在那里，她结识了个性认真严谨的半藏门雪（沼仓爱美 配音）、积极向上的相模枫（藤田茜 配音）和桀骜不驯古灵精怪的八千代命（洲崎绫 配音）等人。

每集列表

设定

故事开始的250年前，世界各地的某些地方喷出火焰，导致陆地四分五裂，也使得许多国家消失、大量生物灭绝，文化发展有些许倒退。部分国家的遗民进入仍然完好的东京皇国生活。受到移民影响，多数人开始将姓和名倒过来称呼，而原国主义者则排斥这种变化并尽可能维持原有传统，因此双方多有冲突。而250年的灾难更被后世称为“大灾害”。

在政教合一、信仰“圣阳教”的东京皇国，部分人类受到原因不明的人体自燃影响而变成“焰人”，第一世代的焰人受其所苦。人类发展到第二世代后，具有操纵火焰的能力，但不能从无生有地释放火焰。第三世代则具释放火焰并操控之的能力；不过无法控制不是由自己释放的火焰，且若用尽体内氧气会陷入晕眩甚至罹患“灰病”。第四世代则是有拥有安德拉爆炎这种火焰的人。为了对抗焰人造成的灾难，皇国组成了特殊消防队与焰人作战并进行镇魂，原本的消防厅、圣阳教教会、东京军队以及专门供给消防装备的巨型企业“灰岛重工”分别建立了首六队，而第七及第八队属于独立于该四个阵营以外而建立的。“安德拉”是被称为地狱的异世界，圣阳教会和灰岛重工利用创造了这颗星球的圣火“安德拉爆炎”为动力，合建火力发电厂“天照”供给更多能源，成为皇国发展的中枢。

剧情大纲

太阳历198年，可以从脚喷出火焰、因而获得外号“恶魔的足迹”的少年森罗日下部加入第八特殊消防队，他的目标是实现小时候的梦想──成为英雄，同时他找出12年前烧死母亲与弟弟的神秘火灾的原因。

第八队从第五队取得的研究资料得知，有人暗中以虫为媒介制造焰人，森罗在潜入第一队调查期间，得知始作俑者被称为“传道者”，他与其旗下身穿白衣的成员(烈火星宫)交战后，得知自己具有安德拉爆炎，也得知传道者的目的。传道者的目标是透过将人变成焰人，借此寻找具有安德拉爆炎的人，在全世界点燃火焰。传道者一事惊动皇国中央，皇王下令讨伐传道者，JOKER则透露森罗的弟弟象不但仍然在世，更成为传道者麾下白衣人组织“灰焰骑士团”的团长。

第八队在一次搜查行动后与第七队结成同盟，在拉拢新成员伏尔甘入队时，与没能达成相同目的、转而谋害伏尔甘的第三队交战，森罗在该次战斗中被象瞬间击败，该次战斗也揭示了第三队长是白衣人的同伙。后来森罗接受第七队的指导并开发出必杀技，和第八队主动向灰焰骑士团出击，双方人马捉对厮杀，森罗再度与象交战，他在对战中逐渐掌握“安德拉连结”的能力，不但得以与象抗衡，两人的记忆更因此连结，让象取回记忆，但森罗最终仍重伤落败。他被送往第六队接受医治，并在痊愈后听闻了12年前自家火灾的真相。

为了理解何谓安德拉连结，森罗到第四队进行调查，期间受到“第一柱”以安德拉连结煽动并失控，却也得知传道者的目的集结具有安德拉爆炎的八个“柱”，为了调查柱，森罗等人组成调查队前往中华半岛，在当地发现另一座天照，并得知天照的动力源是柱，而传道者的目的是凑齐八柱启动天照引发大灾害。JOKER透过调查发现初代皇王、圣阳教的创立者可能是由白衣人(约拿)假冒，借此操控民众思想。由于事涉机密，这些调查成果没有对平民公布。

第八队将调查对象转为与圣阳教共建天照的灰岛重工，期间双方为了争夺被灰岛当成实验对象第六柱(烈火当初的实验对象并对他造成心理阴影)而大打出手，白衣人加入后更演变成三方混战，在第八队和灰岛重工击退白衣人后，他们得知灰岛的目的是得到另一个柱作为天照的备用能源，虽然灰岛的社长表示牺牲第一柱是维持国家运作的必要之恶，而他也愿意协助开发不需要牺牲性命的发电机。

第二队和第八队调查白衣人的地下根据地，遭遇传导者麾下的另一支紫烟骑士团伏击，在击退对方后得知被安德拉之火烧伤的人也能触发安德拉连结。白衣人开始追杀见过安德拉的人，在第四队长遇袭身亡后，消防队、教会和军队团结起来对抗白衣人，但白衣人已入侵皇国中枢，将第八队长以莫须有罪名逮捕。第八队为了救回樱备，不惜成为叛贼前往府中大监狱，在那里遇见杀害第四队长的屠杀者并与其对战。正陷入危机时受到第七队大队长红丸的援助而逃至浅草，森罗也被冠上杀害第一队大队长班兹的罪名。