上条当麻是学园都市的一名高中生。在这座位于东京都西部的封闭都市中，学生占到了总人口的八成，“超能力开发”被列为绝大多数学生的必修课，在Level 0到Level 5的等级排名上相互竞争。不幸地，上条当麻被评定为无能力者；但他的右手有着能将一切异能消除的不明力量，他本人称其为“幻想杀手”。似乎是连同神的祝福一同抹杀的关系，他每天都过着不幸的生活。

暑假的一天，在宿舍的阳台上，上条当麻遇见了一位挂在阳台栏杆上的修女。她自称“禁书目录Index”，脑海中装有十万三千册“魔道书”，正在从不为人所知的“魔法”世界逃亡。就这样，上条一脚踏进了魔法与科学的纷争。

本作的世界观以现实世界为蓝本，但并未说明详细历史时期，大致可以推测故事发生在虚构的近未来[d]。其历史与现实世界有共通点（如前两次世界大战、冷战等；亚雷斯塔更是现实中存在的人物），但也有显著的差异。

学园都市是科学势力的大本营，同时也是本作的主要舞台。位于日本东京西部，居住着230万人口，其中八成人口是学生，而这些学生大都是超能力开发的实验对象。学园都市具有领先世界20-30年的科技实力，掌握着多种近未来高科技兵器，并公开地培养超能力者；事实上是由统括理事会所主导的、严格封闭的国中之国。

而魔法势力则较为分散，主要由名目繁多的宗教组织和魔法结社构成，也有不属于任何组织的魔法师存在。教会势力中，十字教有三大主要教派：英国清教、罗马正教和俄罗斯正教（分别以英国圣公会、天主教和东正教为原型）；而魔法结社则包括以黄金黎明为源头的黄金系结社、依靠北欧神话理论的“捣蛋鬼”，阿兹特克系的“有翼者的归来”等。魔法势力之间常会出于各自不同的目的互相斗争，魔法师出于个人信念私自行动的现象也广泛存在。

在魔法势力与科学势力之外，尚有两不从属的一般组织与国家，如美国；作品中也出现了许多虚构的政权，除学园都市外，还有“伊莉沙里纳独立国同盟”、“巴格吉城”等。

本作中，除“现实世界”之外，尚存在更高等级的、无法以一般手段探知的其他次元的“位相”；神、魔神、天使、妖精、无法以语言名状的高等级存在[e]，也均在作品中有所提及。

非常普通的高中生——多华宫仄，某天在扫除时发现了被扔在垃圾桶里的布偶。布偶身上写了“晴天 有时 校舍会从天而降”的文字。后来校舍钟楼真的如这段文字所言，开始往仄的头上倒下。此时，仄的同班同学火火里绫火出面拯救了仄。两人之间的故事也就此展开。

用语

工房魔女（工房の魔女）

提倡保护世界，在人们聚集形成的城市建立工房，为了让魔法不在城市内被滥用而加以管理的魔女组织。

塔之魔女（塔の魔女）

提倡随意使用魔法，目的虽然不明但是她们总是企图让世界陷入混乱，是一群无论世界变成什么样无论多少人死去都不在乎的魔女组织。

据火火里绫火所说如果世界落入她们手中的话或许“人类会灭亡，地球会爆炸，大魔王会复活，长颈鹿的脖子会更长”。

冬月市（冬月市）

仄与绫火居住的城市，本作故事的舞台。

由风音担任工房长的职务，在12区内有着100名工房魔女。

KMM团（KMM団）

塔之魔女5人组所组成的同好会。

每集列表

一话完结型的搞笑/讽刺漫画。虽然作品名中有落语，但其实故事内容是在落语结束后才开始的，实际上与落语有关的只有每回第一页与篇名，接下来的故事则全部在后台中发生。主要内容是以一个很平常但没有人会注意的问题（例：你们觉得猫好还是狗好？）带出的，登场人物的名字是出现在舞台上的标牌上。作画基本上使用了久米田的全身绘与四段分镜法。

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