故事讲述某年某月某日，全球各地的小朋友都收到一套不可思议的卡牌。玩家能从牌中召唤出来自异世界的、叫爆丸的怪兽进行格斗。

全世界各地的小朋友面前出现了一种不可思议的卡片。使用这种卡片，可以在一个特殊的格斗空间召唤出一种叫做爆丸的怪兽进行对战。主角是位叫做空操弹马的男孩，在对战中的卡片里召唤出巨大的爆丸「独角巨龙」进行对战后，得知爆丸们的世界开始崩坏，原来是一种叫做超级次元洛巴的状态，这种状态来源于一只名叫白龙的白色无属性怪兽进入了巴斯洛亚的沉寂核心，这样的情况也开始影响到人类的世界。小弹和同伴们为了拯救世界，展开了一场又一场爆丸对战。

三年前稻叶夕士因为父母双亡，搬到伯父家，接受伯父一家的照顾，原本希望在考上高中后就搬进宿舍开始独立生活……没想到宿舍竟惨遭火灾肆虐而付之一炬!费尽千辛万苦的夕士在因缘际会之下搬进了房租便宜、附伙食还附温泉的超好康公寓——寿庄。但是，那里居然是有妖怪出没的“妖怪公寓”，夕士“普通”的高中生活就此展开。