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东叶月(能登麻美子 配音)爱上了身为同性的初美(清水爱 配音)，然而，她深爱的人儿却在十六岁生日那天莫名消失了。为了寻找初美，叶月来到了图书馆，在这里，等待着她的是名叫莉莉丝(小林沙苗 配音)的图书管理员。莉莉丝告诉叶月，初美的真身其实正是创世始祖夏娃，此时的她正在无数个平行空间里的某一个中生活。
莉莉丝意外发现叶月的样貌和亚当很像，因此而爱上了她，于是，两人结伴，踏上了寻找初美的旅途。穿越在一个又一个迥异的世界中，遇见各种各样的旅人，叶月和莉莉丝并不知道，这趟旅途的终点在哪里，亦不知初美是否会在那里等待着她们。
每集列表
| 话数 | 日文标题 | 中文标题 | 剧本 | 分镜 | 演出 | 作画监督 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 葉月 | 叶月 | 望月智充 川濑敏文 |
山口祐司 西村纯二 |
山口祐司 | 堀越久美子 |
| 2 | 蓉子 | 蓉子 | 川濑敏文 | 西村纯二 | 佐藤照雄 | 江森真理子 |
| 3 | ジル | 吉尔 | 望月智充 中瀬理香 |
南康宏 林有纪 虎田功 |
南康宏 | 友冈新平 |
| 4 | マリエル | 玛莉艾尔 | 中瀬理香 | 林有纪 | 关崎高明 | |
| 5 | クイル | 葵尔 | 白根秀树 | とくしまひさし | 吉田俊司 | 塩川贵史 中野典克 |
| 6 | ミルカ | 密尔佳 | 望月智充 | 山本秀世 | 佐藤照雄 | 坂井久太 |
| 7 | 初美 | 初美 | 川崎逸朗 | 冈本英树 | 堀越久美子 | |
| 8 | 藤姫 | 藤姬 | 白根秀树 | 小林孝嗣 南康宏 |
南康宏 | 友冈新平 |
| 9 | メイリン | 梅凛 | 白根秀树 中瀬理香 |
小林孝嗣 小仓宏文 |
林有纪 | 江森真理子 |
| 10 | レイラ | 蕾拉 | 中瀬理香 望月智充 |
新留俊哉 山口祐司 川崎逸朗 |
鸟羽聪 | 关崎高明 |
| 11 | 玉藻の前 | 九尾妖狐 | 佐藤照雄 | 中野典克 门智昭 |
||
| 12 | ガルガンチュア | 格尔刚裘亚 | 中瀬理香 | 山本秀世 | 南康宏 | 堀越久美子 |
| 13 | リリス | 莉莉丝 | 望月智充 | 川瀬敏文 | 冈本英树 | 西田亜沙子 |
高町奈叶(田村由香里 配音)是一位平凡的高中三年级学生，某日，在上学的路上，她同来自异世界米德其路达的尤诺(水桥香织 配音)相遇了。尤诺告诉奈叶，她正在寻找遗落人间的太古遗产“圣石之种”，这种珍贵的宝物蕴藏着巨大的能量，如果弃之不顾有可能在人间界造成巨大的破坏，接二连三的波折之后，奈叶成为了帮助尤诺回收种子的魔法少女，开始了一段充满了危险和刺激的奇幻旅程。
某日，一位名叫菲特(水树奈奈 配音)的金发少女出现在了奈叶的面前，她和奈叶一样同为回收种子的魔法少女，也就是说，她们的关系是竞争者。奈叶能够打败这样一位强劲的对手吗?对于菲特来说，温柔而又努力的奈叶又是一种怎样的存在呢?