上条当麻是学园都市的一名高中生。在这座位于东京都西部的封闭都市中，学生占到了总人口的八成，“超能力开发”被列为绝大多数学生的必修课，在Level 0到Level 5的等级排名上相互竞争。不幸地，上条当麻被评定为无能力者；但他的右手有着能将一切异能消除的不明力量，他本人称其为“幻想杀手”。似乎是连同神的祝福一同抹杀的关系，他每天都过着不幸的生活。

暑假的一天，在宿舍的阳台上，上条当麻遇见了一位挂在阳台栏杆上的修女。她自称“禁书目录Index”，脑海中装有十万三千册“魔道书”，正在从不为人所知的“魔法”世界逃亡。就这样，上条一脚踏进了魔法与科学的纷争。

本作的世界观以现实世界为蓝本，但并未说明详细历史时期，大致可以推测故事发生在虚构的近未来[d]。其历史与现实世界有共通点（如前两次世界大战、冷战等；亚雷斯塔更是现实中存在的人物），但也有显著的差异。

学园都市是科学势力的大本营，同时也是本作的主要舞台。位于日本东京西部，居住着230万人口，其中八成人口是学生，而这些学生大都是超能力开发的实验对象。学园都市具有领先世界20-30年的科技实力，掌握着多种近未来高科技兵器，并公开地培养超能力者；事实上是由统括理事会所主导的、严格封闭的国中之国。

而魔法势力则较为分散，主要由名目繁多的宗教组织和魔法结社构成，也有不属于任何组织的魔法师存在。教会势力中，十字教有三大主要教派：英国清教、罗马正教和俄罗斯正教（分别以英国圣公会、天主教和东正教为原型）；而魔法结社则包括以黄金黎明为源头的黄金系结社、依靠北欧神话理论的“捣蛋鬼”，阿兹特克系的“有翼者的归来”等。魔法势力之间常会出于各自不同的目的互相斗争，魔法师出于个人信念私自行动的现象也广泛存在。

在魔法势力与科学势力之外，尚有两不从属的一般组织与国家，如美国；作品中也出现了许多虚构的政权，除学园都市外，还有“伊莉沙里纳独立国同盟”、“巴格吉城”等。

本作中，除“现实世界”之外，尚存在更高等级的、无法以一般手段探知的其他次元的“位相”；神、魔神、天使、妖精、无法以语言名状的高等级存在[e]，也均在作品中有所提及。

一个杂志人气排行榜老是垫底的连载漫画家、一个美女助手、一个崇拜作者的可爱天然呆粉丝，再加上拥有格斗技的责任编辑，同聚在一间工作室中，这样让漫画家爱徒勇气，要如何在一个宛如后宫的漫画工作室，创造出属于“男人的浪漫”的神级之作呢?

每集列表

作品为谷川尼可以用来形容不受欢迎、没恋爱经验女性的日本网络用语“丧女”一词为题材，所创作的单元剧形式漫画。其契机来自于谷川尼可的编辑在浏览一些网络论坛上的丧女讨论板后，所作出的提议。而漫画标题则是作者基于该时期多数的日本漫画、轻小说都采用相当长的名称倾向，所想出的决定。

剧情描述著缺乏社交技巧的女高中生──黑木智子，在每一日上学时面对周遭人物忽略、漠视时，所作出的各种事迹。在上高中之前，智子便已在多款少女倾向的恋爱游戏里揣摩各种情况；并且幻想着当就读高中时就能如同游戏般地会受欢迎。可惜上高中后事与愿违，过了两个月智子仍未交到任何朋友。而在面临现实情况之下，智子开始试着做出能让自己变得受欢迎的各种无厘头行动。