自西历20XX年，人类从肯尼亚图尔卡纳湖的湖畔挖出了一个名叫索哈尔(Zohar)的物体之后，便开始对它进行研究，后来有人重建出来所谓的“神之语言”，并建立计算机程序以启动原始索哈尔，进行和上位领域的U-DO(上位领域当中的红色波动存在)链接的链接实验，但很不幸地，从上位领域流入下位领域的能量造成了事象变移，使地球(游戏中所谓的“失落耶路撒冷”)几乎完全从宇宙中“消失”，人类因而被迫逃亡，离开地球。

到了四千多年后，在游戏开始前十五的T.C.4753年，米尔奇亚行星(Miltia)爆发了所谓的米尔奇亚冲突事件，在此次事件当中，米尔奇亚行星的人类疑似遭到了格诺西斯(Gnosis)的攻击，并在冲突事件后消失，但事件的真相却因为米尔奇亚的消失而不为人知。在事件后，启动原始索哈尔(后来人类制造出了十二具索哈尔模拟体，因此原有的索哈尔就被称之为原始索哈尔)所需的神之语言、原始索哈尔的研究成果、米尔奇亚的U.M.N.座标等事物，都被封存在Y资料当中，而Y资料又被封存在百式观测用合成人(Relian)M.O.M.O.的意识内，然而这么做却引起了各方势力对M.O.M.O.的争夺，因此星团联邦政府(游戏中统治各行星的政府，Galaxy Federation)雇了一个名叫Ziggurat 8的生化人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的安全。

另一方面，在米尔奇亚冲突事件结束后的十几年，也就是大约在游戏EPI开始的时候，当时最大的企业贝克达公司以对抗格诺西斯侵扰的名义，进行对格诺西斯用战斗兵器KOS-MOS的开发计划，但和当时多使用合成人(Realian)与生化人(Cyborg)的情况所不同的是，KOS-MOS是个纯粹的机械制品。另一方面，在EPI开始时，参与KOS-MOS开发计划的贝克达公司第一开发局研究人员卯月紫苑，正乘着当时载有还没正式启动的KOS-MOS的Woglinde号太空船进行旅途。但没想到其太空船却被冲着索哈尔而来的格诺西斯所攻击，而KOS-MOS也在此时突然启动，卯月紫苑因而被卷入一连串和格诺西斯及索哈尔有关的阴谋，以及会改变人类命运的事件当中……

佐藤和真在某次意外中死亡。负责管理日本意外死亡青少年的水流女神阿克娅表示，某个异世界正受到魔王军肆虐、人口大量减少，假如和真愿意转生到该世界，和真可以受到保留记忆、带走一样额外的神装或技能等优待。与此同时，阿克娅不断嘲笑和真在原世界的颓废与丢脸的死法。于是和真受不了阿克娅的冷嘲热讽，在转生前选择不带走任何神装而带走阿克娅——负责接替阿克娅的女神表示，唯有打倒魔王，才会让阿克娅回到原本的职位。

被当成冒险者送到异世界的和真，与明明是水流女神却只精进于宴会才艺的阿克娅、每日限定一发爆裂魔法的红魔族少女惠惠、命中率0%且被打反而会高潮的抖M波霸美女达克妮丝这些特别的角色结伴，过着在异世界为获得安定生活而努力的日常，但基本上故事没有一个是正常人。

然而这是一个相当疯狂且超乎现代一般人常识的异世界，虽然背景设定极似和真熟悉的RPG游戏，但里头从动植物、怪物、恶魔到冒险者们都具有各自的“强烈”特性，让原本想循一般冒险者晋级模式在新手城镇平淡过日子的和真一开始就相当辛苦。偏偏身边这些个性特别的伙伴惹出许多事端，一度让和真陷入背负庞大债务又被怀疑是魔王军人马而论罪的险境，好在每次都有惊无险又意外不断地度过难关。

之后在解决阿尔达普逼婚达克妮丝的风波后，稍显成熟了点的和真一行开始踏出新手城镇，先后在红魔之里、贝尔泽古王都和埃尔罗得王国经历“不可思议”的冒险，又阴错阳差间打倒了许多魔王军干部，最终成功打倒魔王。

原本是平凡生活中的一天，整个世界发生异变，床主市街上出现大量如同丧尸般的死体，主角“小室孝”所就读的藤美学园也遭到死体的袭击。为了求生小室孝集结包含青梅竹马在内的一批人，在这如同地狱般世界中，过去的各种价值观及法律已毫无意义，为了能在这现实的世界存活下去，人们的自私、黑暗、疯狂开始渐渐浮现，主角一行人必须抛弃从前所谓的理想，面对残酷的现实，并在这崩坏的世界求得一线生机…

用语

床主市

故事发生的舞台，架空城市，临太平洋的100万人口规模的地方都市。拥有建于海上的大型机场，参照了北海道与九州的风土作为其原型。

藤美学园

位于床主市，主角就读的学校。

死体（奴ら）

死体的日文直译为“它们”，在本作中因为幸存的人们，不知如何称呼所以直接以“它们”称之，而在中国台湾角川书店出版的中文版翻译为“它们”。 (也叫活死人或丧尸)

死体如同丧尸，会袭击人，吃人。被咬到的人会在短时间内死亡，并成为死体的一分子，死体化后力量会增大至足以破坏一般门扉，并具有持久性，不会随时间而变弱。死体没有痛觉，在肉体受到损伤也无碍其行动，只要肌肉还能牵引骨头，就会一直活动下去，因此即使全身被火焰烧灼，只要物理上的运动机能还存在仍会继续行动，目前已知只要破坏头部就会停止行动。死体速度迟缓、仅依照本能行动，没有意识与情感且无法思考，可能没有视觉，却对声音极为敏感，目前仍然不知道死体是从何处开始出现。因此逃离死体也决非一件易事，因为已经死亡，所以其肉体也会开始腐败，虽然主人公们已有这方面的讨论，不过作中尚未针对这方面特别作描写，不过所有物种中死体只会攻击人类而不会袭击其他动物。之所以用“它们”为名，是为了使尚活着的人在自保的过程中说服自己，“它们”已经不是人，若不杀“它们”就是他们杀了自己，并使自己不认为自己是在杀人，而令自己的心灵不感到压力。

死体化

即为由人类变为死体时的名词。当人类被死体所咬死去后，便会立刻转化为死体。死去后少于三十秒内完成死体化过程。

当如果被咬后尚未死去，便会在1小时内不等成为死体。

目前没有方法阻止死体化。

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