东京篇

主角绯村剑心流浪至东京，因为神谷薰的挽留而留在东京。其后认识了明神弥彦、相乐左之助及高荷惠等人，又与前幕府杀手鹈堂刃卫、御庭番众首领四乃森苍紫决斗，其间剑心经历了多次战斗，令剑心自觉慢慢变回昔日的刽子手拔刀斋(千人斩拔刀斋)(人斩り抜刀斎)。最后在与幕末时代的对手前新撰组第三小队组长斋藤一决战及得知志志雄一党的阴谋后，独自前往京都与志志雄一党对决。(漫画、电视动画)

京都篇

前维新志士志志雄真实及他的同党正在秘密活动，目的是推翻明治政府，由他带领日本成为强国。剑心为了阻止志志雄的计划得逞，独自离开东京前往京都。后来剑心的同伴亦逐一赶到京都寻找剑心，剑心从师傅比古清十郎身上学会飞天御剑流的最终奥义“天翔龙闪”后，与其同伴相乐左之助及斋藤一、四乃森苍紫联手，终于打败了志志雄一党。(漫画、电视动画)

漫画及电视动画的东京篇及京都篇在故事上大致相同。在京都篇完结后，由于当时漫画只是刚开始连载人诛篇，跟不上电视动画的制作进度，因此电视动画另行制作了岛原篇、胜海舟篇、由太郎篇(黑骑士团篇)及风水篇。但受到原作版本的读者批评与原作版浪客剑心的世界观相异，因此后期收视不太理想，在风水篇后便终止制作。

追忆篇

故事发生于剑心在幕末身为长州派维新志士时担当刽子手的年代(东京篇之前的故事)。故事讲述剑心与第一任妻子雪代巴的过去，解明了剑心左边面颊的十字疤之谜。OVA故事共分四幕，第四幕尾段雪代巴为阻挡敌人向剑心发出最后一撃的同时，亦被剑心一剑杀死，临死前用自杀的小刀在剑心面上划上一刀，与未婚夫清里和剑心死斗时划下的一刀，交织成剑心脸上的十字疤。漫画版的追忆篇连载于人诛篇初期剑心的回忆自述，而OVA则独立讲述剑心的过去。(漫画、OVA)

OVA版本的追忆篇内容虽然与漫画原著并无太大出入，但其风格却与之前的电视动画版大大不同。彻底摆脱了少年漫画的风格，特别是拔刀斋出招时其没有像过往一般大喊出必杀技名称，而一般很难于少年漫画及电视动画中出现的大量血花四溅的残酷场面亦一一呈现。坊间对此等手法毁誉参半，例如其血腥露骨的场面可能不适合原作的主要读者(小学生、中学生)，但亦得到一般未看过原作的人支持。而本作于日本海外评价亦相当高，在美国的销售亦曾登上全年DVD销售榜的第7位。

人诛篇

雪代巴之弟雪代缘当年亲眼看到姐姐死于剑心的刀下，长大后集合了“六人同志”，向剑心展开复仇行动(在上海流浪垂死之际被好心日本家庭收留，却因为只想练能攻克剑心武功的念头而杀死对方一家并取走武功秘笈单刀法而自练出倭刀术以及其绝招虎伏绝刀势)。由于雪代缘的阴谋，使剑心一度以为神谷薰被杀而意志消沈(神谷薰之死令当时少年JUMP周刊的读者引起一阵回响)。最后剑心回复斗志并打败雪代缘，雪代缘持着其姊的日记消失在剑心等人面前。(漫画)

番外篇

结束连载以后以SP模式连载两个番外篇，分别是《早春樱花》及《弥彦的逆刃刀》。前者提到了结局之后众人各自的新旅程，如左之助的世界一圈之旅到了蒙古。后者是弥彦以神谷活心流行侠仗义的活跃篇。

第零幕

2012年初由日本漫画杂志“JUMP SQ”公开了《浪客剑心》将于八月号开始推出新连载《第零幕》，与1999年结束的连载相隔十三年的新篇章。

北海道篇

2017年9月连载的新续篇，故事发生在“人诛篇”后5年(1885年)，绯村剑心和神谷薰动身前往北海道寻找薰的父亲神谷越路郎，同时和环游世界回来的左之助、在日本流浪的宗次郎、在北海道服刑的安慈、与调往北海道的斋藤一重逢。就连新撰组的永仓新八，也将在“北海道篇”出现。

在人类面临灭亡之际，

突如其来的韦驮天出现，并与魔族战斗并封印，那是距今800年前的事。

时光飞逝，没有战斗经验、生在和平时代的新韦驮天们将面临复活的魔族。

神、人、魔物的生存战就此开始！

“韦驮天” × “魔族” × “人类”，世人无从知晓的禁断大逃杀现在开始——经过一番壮烈的战斗，以压倒性的速度与强大而自豪的战斗诸神“韦驮天”封印了导致世界毁灭的“魔族”，自那以后过了800年。如今，“那场战斗”不过是遥远神话当中的传说故事而已。从出生起一次都没有战斗过的“平稳世代的韦驮天们”享受着安逸的生活，此时不知何人让魔族从漫长的沉睡当中再度复活了——武力、智略、政治、阴谋，总之只要是能用上的东西不论什么都拿出来吧！无规则＆无限制的三方大逃杀现在开始！！

身为大学二年级的岩谷尚文，在镇上的公立图书馆翻到一本书“四圣武器书”。当翻阅到空白的页面时，竟被召唤到另一个世界，被称为“盾之勇者”。在一个视盾牌为罪恶象征的异世界里，盾之勇者又被公主诬陷为强暴犯，跌入深渊中的尚文变得再也不相信任何人地独自行动……他是否能在这恶劣的开场下，走完他的勇者之路回到原本的世界呢?

一场命运弄人而越挫越勇的逆天史诗冒险谭，开幕!

四圣勇者

所使用的武器为盾、枪、剑、弓。

而绊世界的四圣器分别为狩猎具、纸牌、钝器、球。

每个世界代表的圣武器不同。

四圣勇者必须全员死亡才可重新召唤，唯一的例外只有四圣武器的精灵找到适任者才会递补四圣成员，例如绊世界之中，除了风山绊以外的四圣都被浪潮先锋杀了，这时希尔荻娜在与持有纸牌圣武器的神祇者爪牙对战时，被纸牌圣武器选为绊世界的四圣勇者，因此递补了四圣的空缺。

实职是己方世界的守护者。当四圣勇者在浪潮中全数被刺杀时，己方的世界就会被入侵的世界吞噬。

一般而言，四圣勇者是禁止入侵别世界的，唯有得到己方世界所属的四灵兽签发的特别通行证或圣武器精灵的特例许可的四圣勇者，方可不受限制入侵别世界，而持有通行资格的勇者，可以带领少数同伴以及另一名四圣勇者前往异世界。

无法成为奴隶。

当四圣勇者的心灵受到严重伤害时，大罪系列的武器就会觉醒。大罪武器拥有其他武器望尘莫及之力，却伴随着强大的诅咒。

在其他世界中虽不是四圣勇者，但也可以使用原世界的圣武器，除此之外，也有成为七星勇者的例子，如尚文在绊世界中被镜之眷属器选上而成为镜之勇者。

实质战斗实力不完全受到技能与素质版面影响，另一种影响性为自身实战的体能与经验，以及战技流派对勇者的各种技能有大幅度额外加成效果，甚至失去武器时也能应用各流派武术来战斗。