私立开盟学园，通称“SKET团”，以帮助学生适应学园生活、解决委托人的烦恼为宗旨。虽然有着很漂亮的口号，但实际上只是大家口中的杂佣团，不论是寻找失物、打扫清洁，SKET团都是最好的帮手。
社团由无所事事的团长藤崎佑助(Bossun)、曾经是不良少女的鬼冢一爱(姬子)以及情报高手笛吹和义(Switch)三人组成。每回都会接受不同的委托，并且因而接触帮助了更多人，故事就此展开下去。
因为故事和JUMP上的《银魂》相近，而作者篠原健太曾担任空知英秋(《银魂》作者)的助手，常被戏称为“校园版《银魂》”，《银魂》动画第26集神乐称其为"劣质版的《银魂》"。
长篇
原则上故事多为1话完结的短篇故事，但有时也会有连载超过3话的情况。
话剧对决篇
单行本第二集(10~12话)
Sket团和学生会(话剧社)的对决。
不能看的DVD篇
单行本第二集(15~17话)
八木所遗落的DVD是不能看的?带有推理风格的故事。
GVB篇
单行本三集到四集(25~35话)
Sket团和学生会的对决。真人参加用手机游戏为题材的比赛，比赛分为前锋、次锋、中锋、副将和大将五回合战。
SWITCH OFF
单行本第五集(连接回41话，42~44话)
Switch的过去前篇。揭露了Switch之所以不说话的原因。
开盟摇滚祭篇
单行本第六集(49~51话)
Sket团为了激励犹豫出国留学的同学，组乐团的故事。
OGRESS
单行本第七集(连接回56话，57~62话)
姬子的过去篇。揭露姬子过去被称为不良少女“鬼姬”的过去。
玻璃男篇
单行本第八集(69~71话)
Sket团寻找打破玻璃的犯人，却……?带有推理风格的故事。
Happy Birthday
单行本第十集(连接回81话，82~86话)
Bossun过去篇。揭露Bossun乐心助人的原因和身世。
Happy Rebirthday
单行本第十集(87~90话)
时间回到现在，在Bossun生日兼校庆时，又有更大的秘密揭露?
电子情书
单行本第十三集(110~112话)
Bossun透过振藏交了电子笔友，约出来见面，没想到对方竟然是……
椿与浅雏
单行本第十三到十四集(116~119话)
Daisy被不良少年纠缠，知道这件事的椿会如何?
毕业旅行狂诗曲
单行本十五到十六集(132~138话)
Bossun和姬子交换身体?这个旅行会有怎么样的发展?
trouble travel
单行本二十六集(227~232话)
黄金周到了，姬子的朋友小堇邀请姬子到大阪旅行，到底在大阪会发生什么事呢?
Switch ON
单行本二十八集(241~251话)
Switch过去后篇。揭露Switch加入Sket团的原因及Sket团成立的经过。
Last Dance
〔280~285话〕
Sket团最后的工作!开盟学园遇上最大的危机，到底Sket团怎样解决?
番外篇
番外篇-伤心邂逅
收录于第三集。使用浪漫的漫画以作中作的方式呈现的故事。
番外篇-正义侠盗团 准之章
收录于第三集。舞台来到江户时代的忍者风故事。
番外篇-BlSCUIT DANCE~大家都是好朋友之卷
收录于第四集。主角们变成幼童的四格漫画。
番外篇-偶戏DANCE
收录于第五集。主角们变成布偶戏的四格漫画。
番外篇-渡假DANCE
收录于第五集。女性角色穿泳衣在沙滩玩文字接龙的故事。
番外篇-ROCKET DANCE 遭遇
收录于第六集。舞台来到宇宙的科幻风故事。
番外篇-SILENT DANCE 人情巧克力好难送之卷
收录于第七集。描述姬子送巧克力给Bossun的故事。
番外篇-BlSCUIT DANCE 最喜欢老师了之卷
收录于第八集。糟糕泽变成幼稚园老师的故事。
番外篇-“两人好紧张” 夏日热炎炎 心却冷冰冰之卷
收录于第九集。作中作的草稿。
番外篇-BISCUIT DANCE 开心的游艺会之卷
收录于第15集。以极短篇形式呈现。
番外篇-QUEST DANCE 旅程的开始
收录于第17集。主角们在RPG世界中组团准备讨伐魔王。
番外篇-ROBOT DANCE
收录于第22集。舞台来到机械工学发达的太空城市。
「可否为我配制一帖♯♯?」
猫猫的眼眸瞬间浮现出惊讶与好奇的色彩──
位处大陆中央的某个大国，有位姑娘置身于皇帝宫阙之中。
姑娘名唤猫猫，原在烟花巷担任药师，眼下则在后宫做下女。
这个绝对称不上美女的姑娘很懂分寸，只是静待期满离宫。
她有自信，皇帝绝对不会「宠幸」她。
其间，猫猫得知皇子皆年幼早夭的事，
并听闻连尚在人世的皇子皇女也身染重病，她开始调查他们的病因──
广获赞誉的酣畅淋漓推理之作，众所期盼的第一集终于出版。
以中世东方为舞台，「试毒」少女将一一解决宫中发生的悬疑案件!
位于大陆中央的一个大国。那个国家皇帝的妃子们住的后宫中有一个少女，
名字叫猫猫。
之前在花街当药师，目前在后宫工作中。
某日，她听闻皇帝的孩子们很短命的传言，现在的两个儿子都因病而日渐虚弱，出于兴趣猫猫开始调查这件事的原因，就像是在说不可能有这样的诅咒。
美型的宦官——壬氏，安排猫猫去做皇帝宠妃的试毒者。
虽然对人类没有兴趣，但出于对毒与药异常的执著，在花街长大的药师就这样被卷进了各种流言和事件。
美丽的蔷薇长着刺，女人的花园里到处是毒，总是少不了的流言与阴谋。
尽管麻烦，猫猫还是处理着壬氏不断地推给她的各种工作。
难得一见的爱毒少女今天也在后宫里跑来跑去。
漫画
‘第一部’漫画于1992年至2001年间，在《周刊少年Magazine》上连载，由1992年10月28日开始，以《歌剧院杀人事件》为金田一一初登场的第一个案件，而《金田一少年敢死之行》最后一话则于2001年1月1日出刊，为第一部完结时漫画的最后案件，同年4月20日推出小说《邪宗馆杀人事件》，至此《金田一少年事件簿》‘第一部’告一段落。
1997年，在《银幕之杀人鬼》之后金成阳三郎退出漫画创作团队，原作由天树征丸担当，跟佐藤文也继续《金田一少年事件簿》的新故事。由《歌剧院杀人事件》开始至《速水玲香诱拐事件》为止的19个案件的长篇，组成了第一部“File系列”。而后的7个中篇及长篇的案件组成了第一部“Case系列”。
2000年末，随着“Case系列”最终回《金田一少年的敢死行》的结束，从1992年开始连续8年的金田一漫画连载画上了休止符。通常，“File系列”、“Case系列”、“Short File系列”、“明智系列”与长短篇小说等，被合称为“第一部”。
于第一部与第二部之间刊登了《旅行途中》短篇小说，简短的交代金田一一于第一部完结时的单车之旅所为何事，现在可以于金田一20周年官网中看到此文。
‘第二部’漫画是以3个系列构成，分别是“新系列”“20周年系列”“R系列”组成，以《吸血鬼传说杀人事件》为起点，直至R系列的《金一二三诱拐杀人事件》为止。
“新系列”---2004年夏，在同作者(天树征丸与佐藤文也)结束了《侦探学园Q》的连载后，2004年8月开始在《周刊少年Magazine》恢复不定期连载，距第一部完结时隔四年发表了《金田一少年事件簿》第二部的第一个案件《吸血鬼传说杀人事件》。由2004年8月18日开始连载的《吸血鬼传说杀人事件》至《游戏馆杀人事件》最后1话于2011年6月8日为止，之后的2004年-2011年间，不定期的连载了8个长篇案件以及7个短篇案件。由于连载不定期，虽然File编号依然延续，但没有官方的系列名，通常被称为“新系列”。
“二十周年纪念系列”---2012年《金田一少年事件簿》踏入20周年，漫画故事再次长期连载，而漫画亦由《食人研究所杀人事件》开始，以第1期为名称开始于2012年3月7日开始在《周刊少年Magazine》恢复长期连载(20周年系列)，连续推出了三个长篇及一个短篇作为“二十周年纪念系列”。直至《蔷薇十字馆杀人事件》于2013年4月17日连载完成最后一话，作为20周年系列的终点。
“R系列”---2013年11月，“二十周年纪念系列”之后，漫画宣布以《金田一少年事件簿R》为题连载再开，代表归来之意的Returns系列，可能会是一个较为长期而稳定的连载。《金田一少年事件簿 R》以《雪鬼传说杀人事件》作为起始案件于2013年11月27日开始连载，最后的案件为《金田一二三诱拐杀人事件》。
同一时间于手机程式MangaBox中连载《高远少年之事件簿》以及《金田一少年之2日1夜小旅行》。以不同漫画家执笔的官方补完系列展开，第一次由佐藤文也老师以外的漫画家——あわ箱作画，轻松搅笑向的《金田一少年之2日1夜小旅行》;以及由佐藤友生作画的《明智警部之事件簿》。
‘第三部’漫画以《金田一37岁之事件簿》为名，以《歌岛渡假村杀人事件》为起点，至今一直连载在讲谈社的Evening杂志连载中。故事主要围绕地狱傀儡师高远遥一及他的诡计执行者们跟金田一的对决。天树曾在作者的话中说《金田一少年事件簿》并未完结，所以再回到17岁的少年系列继续发展还是有可能，只是暂时仍未有相关情报。
“金田一37岁之事件簿”---《金田一37岁之事件簿》是《R系列》的后续故事，时间线现定在20年后，讲述37岁金田一所发生的故事。和第二部新系列相同，由天树征丸担任原作者，佐藤文也作画。并改由《Evening》连载。《金田一37岁之事件簿》以《歌岛度假村杀人事件》作为起始案件开始连载，到《杀人二十面相》篇连载完后暂时休载，目前未知复载时刻。
“三十周年纪念系列”---2022年《金田一少年事件簿》踏入30周年，漫画故事再次推出新作连载，并由《八呎乌村杀人事件》开始。