在勇者麦克斯和同伴打败魔王的十年之后，魔王从沉睡中苏醒并且威风不再。魔王急着找麦克斯复仇，却发现麦克斯成了独居在公寓套房里的废人，不但变得个性懒散、外表邋遢，还有诸多负面新闻。魔王起初瞧不起麦克斯自甘堕落，但在发现他实力依旧后，感到十分可惜，便搬进公寓与他同居，顺便学习人类社会的变化。随后魔王的秘书洁妮亚也搬到隔壁房间，就近监视。

战士雷奥是麦克斯过去的同伴，如今他背叛王国，率领被视为恐怖组织的刚玛共和国强占王国北部。同为麦克斯过去同伴的僧侣弗雷德现职魔导厅的长官，奉命率军歼灭刚玛共和国。麦克斯原先无意介入此战事，然而在此战演变成雷奥和弗雷德同室操戈后，魔王干涉了两人的单挑，迫使麦克斯插手阻止同伴厮杀。麦克斯使用过去的魔法师同伴尤莉亚遗留的强化魔法，于三方混战中胜出，并为伙伴们造成的困扰向世人磕头道歉，使战争就此平息。后来刚玛共和国成为了王国的自治区，弗雷德升任大臣。

有一天，对这个世界绝望了的加贺道夫发现了一个奇怪的网络游戏。

游戏中写着，如果这个世界不好生存的话，就在异世界生活就好了。等待着设定和角色创建结束的道夫的，是与现实不同的真正的异世界。

以存在各种技能、任务、魔法、迷宫等宛如游戏般的异世界为舞台，利用可以自由重新设定自身状态的能力，道夫的冒险拉开了序幕。

混入网络深渊部的高中生加贺道夫。在奇怪的网站上做着类似网络游戏角色创建的事情，不知为何转移到了异世界。当回过神来的时候从某个村庄醒来。乍一看似乎很和平的村庄，却遭到了众多盗贼的袭击。道夫利用角色所设定的武器，击退了盗贼。这里是角色设定的武器和技能等都可以实际使用的现实世界。

玩家须与游戏中的女主角互动以推动剧情发展。玩家在游玩《Soul Link》时将会花费大多数时间观看出现在萤幕上的文字叙述、人物对话以及角色心理等，借由这样的方式除了让故事获得进展外，也可以与游戏角色对话进行交流。

本作由四章构成，分成序章?第1章?第2章?第3章。在每次阅读故事发展以及与其他角色对话后，玩家便有机会能够在与角色互动时、从游戏提供的数个选项中挑选其中一项。这时游戏会暂停一会儿以提供玩家依据先前的对话作出决定，玩家在某些关键选项之中的抉择则会影响到游戏朝特定方向展开，并进入各式分支情节中。借由决定于数个选项抉择的方式来让游戏系统判定玩家攻略的故事剧情，同时游戏中所做的决定也会影响这些角色故事后半段呈现不一样的结局。该作比前作《SHUFFLE!》的选项更多，并拥有20种以上的坏结局，包括死亡、强暴等。

时代是在公历2045年、秋天。

载着6名军官候补生的太空站「白羊座号」，被突如其来的激进派组织·哈拉拉克斯压制。

……身在宇宙空间，这种脱离着地球的无路可逃的窘境。

然而军官候补生们即使身在这样的绝境之中，依然没有放弃希望，努力寻找夺回白羊座号的方法。

之后，他们将会离这起事件惊人的幕后真相越来越近……。

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