故事背景为一场史无前例的大灾害彻底摧毁了现代文明并且已经过去了十五年。故事使用双线描述，其中一支为一群孩子被圈养在某个封闭设施中，他们被告知外面世界充满各种怪物，一天时男收到一条消息询问他是否想到设施外面，而和他亲密的弥美姬则预言到外面会有两个人到来救她出去，而且其中一个人和时男样貌相同;另一支则是在外面荒废的世界，贵留子受委托作为保镖，带着小丸前去一个名为“天国”的地方。

每集列表

不善与其他人相处的少女－葵，在成为高校生的这天，有位做事不经大脑，名为日向的少女前来热情地搭话，并且劝诱葵从现在开始一起去登山。虽然害怕与人交往且患有畏高症的葵不断拒绝，但在日向强行拖拉之下，一同前往了日向的家。葵的内心虽然对日向抱有不满，但在进入日向父亲所展示的帐篷参观时，看到日向与自己重逢后的举动与喜悦，及自己的所见所闻，加下从帐篷望见美丽的夕阳，令葵勾起一些回忆。

葵在幼年时，曾与日向跟随日向的父亲前往某座山上观看日出。少女们在受到这情境所感动后，2人约定在成为高校生时定要再次看到相同的景色。回想到这个场境，葵很自然地从口中说出“前往不太高的山也不错（高くない山ならば行ってもいい）”这话。

虽然知道与日向一起登山，但因担心可能在山上遇难并有生命危险，令葵相当不安。就这样日向就选择了标高197米的天览山，作为与葵第一次登上的山。就在沿山径上山时看到穿着普通服装的小孩时，葵的不安感一扫而空，后来更在山顶欣赏到远方的美景。葵在知道日向了解自己不习惯登山而选择了天览山后，开始对与日向登山的看法有所转变。而开始对登山有兴趣的葵，这时在下课回家途中就逛了逛登山用品店。与日向进入了店内的葵，遇上了一位穿着相同校服的女学生。这女学生正为选择睡袋的事而犹豫不决，但后来在跟葵谈话，终于确定了自己想购买的睡袋。这位女孩就为齐藤枫，在跟葵说自己也喜欢登山后，两人就交换了电邮地址，而枫亦为葵在日向以外的第一个朋友。

接着，日向就提议登另一座山，但这次让葵去选择。但因葵没有任何山岳知识，所以对如何选择感到迷惘，这时只好跟枫商量。后来枫就列举出秩父、丹泽、八岳、谷川岳等这些位于关东内并适合新手登上的山，而葵最后选择了自己最有兴趣，在山道中拥有能量景点（power spot）的高尾山。为了准备前往登山，日向就陪伴葵去购买之前从没拥有过的登山用背囊，葵亦很欣赏日向不害怕与别人相处的态度。就这样就到了登山当日，在葵心中，日向虽然有时会强人所难，却十分为自己着想，因此葵很想送件礼物给日向，但对找不到时机而非常烦恼，不过无论怎样，葵与日向一起在高尾山登山确实十分快乐，最后葵亦成功在山顶将礼物送给日向。在下山时，日向提议取道高尾山中难道最高的登山道下山，途中，2人就遇上了一名因鞋破损而相当苦恼的少女可可奈。可可奈前来高野山的原因是为寻找鼯鼠，其后葵与日向就和这位带有“天然”气味的女孩共3人一起回到登山口，最后看到可可奈发现松鼠时露出的笑容，感到十分快乐。

童年时一次看电视转播的经历，在少年日向翔阳(村濑步 配音)的心中种下了排球的种子。他在初中时代是排球部的主将，可是人丁寥落的排球部始终没有起色，唯一一场比赛也以惨败告终。在此之后，他终于如愿考入梦寐以求的学府乌野高中，并加入了该校的排球部。当年翔阳在电视上看到的正是乌野 高中的比赛，如今这个学校的排球却正面临着衰败的命运。与宿命的对手和好友影山飞雄(石川界人 配音)聚首于此，心怀排球梦想的少年们将团结一心，带领着乌野这名王者再度振翅高飞……

本片根据古馆春一的漫画原作改编。

1.

小时候，日向翔阳从电视上看见排球比赛，乌野高中的一名小个子在球上的英姿，简直就是个“小巨人”，对此非常深刻，并开始迷上排球，一直想成为“小巨人”一样的人。

初中时排球部不够人数，只好默默等待，后来在终于有新成员后，参与了第一次也是最后一赛的比赛，不幸对决了最强队伍，结果当然落败。

单凭自己的话，是绝对无办法看见那景色的，不是自己一人的话，或许就能看见了。为了能够打出“胜利”的比赛，翔阳努力考入乌野高中，实现成为“小巨人”的排球梦想!

2.

在宫城县预选赛败于青叶城西后，乌野高中排球部为了春季高中排球赛而努力，为了磨练实力，他们参加了由枭谷学园组织，包括音驹高中在内的数所关东高校组成的练习赛团体。

通过这次合宿，乌野高中排球部的所有人都得已“进化”，于春季高中排球赛上大放异彩。

3.

“没落的强豪，无法飞翔的乌鸦”——。曾经被如此称呼的乌野高中，终于抵达的“顶”之舞台。春季高中排球宫城县代表决定战，决赛。

在高中联赛预选准决胜中惜败于青叶城西高中，朝着春高预选再次启程的乌野，为追求更高等级而挑战的是与关东强豪队伍进行的联合合宿。痛感到与并列于枭谷、生川、森然、音驹的全国级别队伍之间的力量差，乌野高中追求着队伍的“进化”，一心持续着挑战。

终于到来的春高预选。一度封印起来的日向与影山的“怪人速攻”展现出更进一步的进化，每个齿轮相互咬合，驱动着队伍全体，乌野将并列的强豪们击破。之后，在宫城县代表决定战准决胜中再次阻挡在前的，是宿敌·青叶城西。在因缘的对手面前展开毫不退让的攻防，比赛进入了总力战。在双方的自尊互相冲撞的最后，取下超越体力极限的激战胜利的是，乌野高中。

距离全国，还差一步。对手是绝对的王者，白鸟泽学园高中。拥有超高校级王牌·牛岛若利的县内最强队伍。要在激斗中取胜，并掌握通往春高预选的门票，仅剩这一所学校。乌野高中 VS 白鸟泽学园高中!现在，乌野高中最大的挑战开始了——!

4.

春季的高中排球宫城县预选中，在一番激斗后取胜，终于实现在全国大赛中出场这一夙愿的乌野高中排球部。

就在他们为全国大赛做准备的时候，传来了影山受到全日本青年强化合宿召集的消息。

而月岛也受到宫城县一年级选拔强化合宿的召集。

同为一年级，对于差距感到不安的日向，擅自前去参加宫城县一年级选拔强化合宿，但……

以全国大赛正赛为目标，日向、影山以及乌野高中排球部开始了更加艰巨的挑战。

风格设计

古馆春一以“超厉害的二传手，完美地配合主攻的故事”，开始了《排球少年!!》的故事。

运动描写虽然有些夸张，但基本上是以现实比赛中使用的战术为基础进行描绘的。因此，作为少年漫画风格有些“朴素”。但是，只有主角的快攻配合是古馆想出来的，实际上是不可能的、非现实的描绘。

为了让对排球没有兴趣的人也能容易地阅读，对于规则和玩法的说明穿插在了故事中。比赛中的“轮换”，虽然有时候制约了主人公的行动，但也是为了角色下次活跃时的释放。诸如“顶端的景色”(頂きの景色)、“停下的托球”(止まるトス)等经典台词让人对比赛留下了深刻的印象。