自从驾驶真盖塔机器人的流龙马、一文字号、タイール在火星消失数十年后，神隼人为了抵御地球内及地球外的威胁，正着力武装化早乙女研究所及训练新的驾驶员。除了“恐龙帝国”的再袭外，还有来自外太空的威胁“仙女座流国”(アンドロメダ流国)。为了避免人类的灭亡，三位驾驶员流拓马、神威翔、山岸獏操控著早乙女博士的遗产“盖塔机器人ARC”开始了新的战斗。