青春的乐曲开始了。

因某个理由而放弃拉小提琴的原天才少年青野一。

在初中三年级的秋天，与一名少女和高中管弦乐部的邂逅让他那停止的时间重新动了起来——

音乐与音乐、心与心所连结的合奏青春剧，开幕。

故事发生在前传故事《鹫尾须美是勇者》两年后，神世纪300年。主要讲述初中二年级学生结城友奈，天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系。本作正是以友奈等人的“勇者部”的活动为主线进行相关叙述的。

表面看来，结城友奈(照井春佳 配音)是一个平凡的初中二年级女生，个性开朗热情的她是校园中的活跃分子，深受老师和朋友们的喜爱。可实际上，放课后的她还有着另一重身份——勇者部的部员。

友奈的邻居兼好友，沉默寡言却意外的温柔的东乡美森(三森铃子 配音)、个性大大咧咧果断直率，却意外的擅长做家务的犬吠埼风(内山夕实 配音)、风的妹妹，像小动物一样惹人怜爱的犬吠埼树(黑泽朋世 配音)、看似桀骜不驯难以接近，实际上非常害羞傲娇的三好夏凛(长妻树里 配音)，除了友奈，活跃在勇者部的是这些性格迥异的女孩们，她们所要面对的，是名为巴提克的强大敌人。

为了终结持续不断的内战而制造出来的拟神兵，终于替国家带来了和平，成为英雄。但在战争结束后，他们却堕落为野兽，并不断遭到猎兽者的追杀。少女夏尔的爸爸也被猎兽者杀死，因此决定找猎兽者报仇。然而实际认识了猎兽者汉克，并与他一同踏上猎杀拟神兵的旅程之后，夏尔才发现他的真实身份，与潜藏在其内心那不为人知的苦衷。