故事舞台为苇原町的“创圣学院(創聖学院)”，学院分为两个学部，一为明治时代以来的女校“创圣女学院”学部，俗称“完美(フローレス)”(来是由钻石的净度级别FL(Flawless)，指无瑕，是最高级的净度);二为近年创立的男女校“创圣一般学部”，俗称“细微(スライトリー)”(同是来自钻石的净度级别，指微瑕疵的SI1和SI2(Slightly Included)，比FL低数级)。前者是校风严肃的传统名门学校，后者是自由度高、理念革新的学校，两者几乎相反。而男主角泉户裕理则是属于一般学部，并且是八衢神社宫司泉户裕导的儿子，并有几乎如亲妹妹一样的小鸟游由美奈。

裕理与友人河合亚芽里和要三九郎一起度过升上三年级前的春假，当时学院正进行操场的扩充工程，其间发掘到刻有奇异文字的遗迹，其文字就是裕理家中神社所奉祀的神祇“太转依(太転依(たゆたい))”。但学院鉴定遗迹并无价值而继续工程。数日后开学仪式的当日，裕理被女学院学部如月美冬质疑是阻止扩充工程的人，裕理虽自身知道无关系，但不能辩驳而逃走。裕理认为破坏遗迹恐怕会有灾难发生，遂于深夜潜入学院，进行转换神祇灵魂的仪式，名为“绮久罗美守毘卖(綺久羅美守毘売(きくらみかみのひめ))”、看上去如神一般的纯白灵体立刻出现，并述说约五百年前人类与太转依的共存问题，最后“化成”另一位有狐狸耳和尾的小女孩。之后裕理替其取名为“真白(ましろ)”。

“真白(ましろ)”需要通过睡眠才能回复力量，于是来到八衢神社。

上条当麻是学园都市的一名高中生。在这座位于东京都西部的封闭都市中，学生占到了总人口的八成，“超能力开发”被列为绝大多数学生的必修课，在Level 0到Level 5的等级排名上相互竞争。不幸地，上条当麻被评定为无能力者；但他的右手有着能将一切异能消除的不明力量，他本人称其为“幻想杀手”。似乎是连同神的祝福一同抹杀的关系，他每天都过着不幸的生活。

暑假的一天，在宿舍的阳台上，上条当麻遇见了一位挂在阳台栏杆上的修女。她自称“禁书目录Index”，脑海中装有十万三千册“魔道书”，正在从不为人所知的“魔法”世界逃亡。就这样，上条一脚踏进了魔法与科学的纷争。

本作的世界观以现实世界为蓝本，但并未说明详细历史时期，大致可以推测故事发生在虚构的近未来[d]。其历史与现实世界有共通点（如前两次世界大战、冷战等；亚雷斯塔更是现实中存在的人物），但也有显著的差异。

学园都市是科学势力的大本营，同时也是本作的主要舞台。位于日本东京西部，居住着230万人口，其中八成人口是学生，而这些学生大都是超能力开发的实验对象。学园都市具有领先世界20-30年的科技实力，掌握着多种近未来高科技兵器，并公开地培养超能力者；事实上是由统括理事会所主导的、严格封闭的国中之国。

而魔法势力则较为分散，主要由名目繁多的宗教组织和魔法结社构成，也有不属于任何组织的魔法师存在。教会势力中，十字教有三大主要教派：英国清教、罗马正教和俄罗斯正教（分别以英国圣公会、天主教和东正教为原型）；而魔法结社则包括以黄金黎明为源头的黄金系结社、依靠北欧神话理论的“捣蛋鬼”，阿兹特克系的“有翼者的归来”等。魔法势力之间常会出于各自不同的目的互相斗争，魔法师出于个人信念私自行动的现象也广泛存在。

在魔法势力与科学势力之外，尚有两不从属的一般组织与国家，如美国；作品中也出现了许多虚构的政权，除学园都市外，还有“伊莉沙里纳独立国同盟”、“巴格吉城”等。

本作中，除“现实世界”之外，尚存在更高等级的、无法以一般手段探知的其他次元的“位相”；神、魔神、天使、妖精、无法以语言名状的高等级存在[e]，也均在作品中有所提及。

樱小路樱是一名普通女高中生，某天，在乘公共汽车回家的途中，看见一名用蓝色火焰来焚烧别人的黑发青年。隔天，樱赶到案发现场，却没有任何尸体，警方亦只当一般火灾事故处理。沮丧的她回到学校，遇见和那位黑发青年长得一模一样的转学生大神零。大神零的真实身份是....

用语

异能（いのう）

某种异能者拥有的特殊能力，类型因人而异，但在力量使用过剩后会有24小时的能力丧失时间。若过度使用异能的话，异能最终将反噬使用者本身，直至死亡，称为“CØDE END”。另外异能者会因为某些类型的樱花香味醉倒。

CØDE END（コード エンド）

指异能者若持续使用自身能力的话，异能便会反噬异能者本身。例如人见便被电能反噬死亡（同时代表大神会被蓝色火焰吞噬成灰、刻会死在磁力、平家将会被光反噬致亡，依此类推）

CØDE：BREAKER（コード：ブレイカー）

制裁法律无法制裁的罪恶，保护法律无法保护的人。由6位异能者组成。其编号1-6是依照能力高低排序，数字愈小代表其能力愈强。目前1号似乎是空位。

CØDE：Name（コード：ネーム）

“伊甸”里除了“CØDE:BREAKER”外还有其他异能者，并非是“CØDE:Number”而是各自拥有“CØDE:Name”的异能者，成员都具备较强的异能外，拥有的异能种类也不只一种而已，并且能够控制身为异能之源的生命力因此可以抑制细胞的新陈代谢使外表的年龄不会改变，身份较“CØDE:BREAKER”高，被称为超高异能者。搜索者就是过去隶属伊甸的超高异能者，目前仅存四位。

伊甸（エデン，Eden）

管理CØDE:BREAKER和CØDE:Name的组织，全貌仍是谜。过去由CØDE：EMPEROR、平家将臣、樱小路的母亲－樱小路 樱子和ZERD共同创立，这四位被称为伊甸的创世四杰。现在最高管理人是藤原总理。

Re-CØDE（Re-CODE）

“搜寻者”的直属亲卫队，和CØDE:BREAKER对立的存在，同样是由异能者组成。

稀有品种（珍種（ちんしゅ））

不同于异能者，能够将异能无效化并且吸取异能。不同于24小时的能力丧失时间，有时会身体缩小，每一个稀有种都有弱点。被伊甸称为天使，目前已知的稀有品种有樱小路 樱、涉谷和便当君他们。

混血种

异能者和稀有品种所生的孩子，是禁忌的存在。异能者和稀有品种的血混一起会产生极大的破坏力。尤其地狱皇帝谱系和稀有品种的混血种是绝对禁忌的存在，如大神零。

人造种

伊甸人工创造的人，身上都有条码，会根据能力和素质来判定等级，不够强的就会被消灭。游骑和时雨都是人造种中的成功品，但绝大多数人造种都在儿时被伊甸残忍的消灭，即使残存也会被伊甸视为没有存在意义的废物而已。

地狱皇帝谱系（じごくのこうていのけいふをつぎしもの）

皇帝一族。这一门年轻时的容貌都非常相似，但会随着年龄增长容貌有所改变。一族中能操纵七种火焰的人少之又少，但就算不能操纵七种火焰，也是非常强大的异能者。目前已知属于这一族的有大神 零、搜寻者和黑门寺 曾知及涉谷以外的历任会长。

猫丸（にゃんまる）

本作中出现的猫型玩偶，是个充满正义感的侠义角色，游骑的最爱。另外还有影丸等角色。

潘朵拉的盒子（パンドラの箱）

据说打开盒子的人就能成为传说中领先遗传因子代码的最强异能者。搜寻者和刻的异能曾被封印在此，还能赋予非异能者的春人异能“变形”。

打开需要稀有品种的血。

珍镇水

须要稀有品种的血才能制作，具有让身体缩小的稀有品种恢复外，混入珍镇水的建材具有封印异能的功能。

虚无化

异能者和稀有品种的血融合碰撞会产生巨大的力量，比如樱小路的一滴血和大神的一滴血相融会引发大爆炸。皇帝曾为了避免虚无化的发生决定将异能者和稀有品种分离，最后却引发12月32日惨案。

辉望高等学校（輝望高校，きぼうこうこう）

大神零和樱小路 樱就读的公立学校，由皇帝创立，目的是为了找到同志。过去都由皇帝地狱系谱一族担任校长和会长，但目前校长和会长全都由涩谷一手包办。其中，在部分校舍因为混入珍镇水所以在建筑物内是无法使用异能的。

过去作为异能者的养成学校。

辉望祭

辉望高中自创校来不曾中断的庆典，如今已经变为每年例行的文化祭。过去做为皇帝招收同志的目的而举办的仪式，从培养的强大又聪明的学生(异能者)中，在某个仪式中满足条件将会成为同志，而那个仪式就是‘辉望祭’的由来。为了保护树敌众多的地狱皇帝系谱一族，那七个能与七只恶魔对抗的人们，将被给予强大的力量。

闲成学院高中（閉成学院）

刻和冴亲就读的明星高中。入学考超难考但进入东大的升学率却是全日本第一。

12月32日（じゅうにがつさんじゅうににち）

指的是过去发生的异能者和稀有品种大量死亡事件。

在“虚无化”能力被发现后，皇帝决定将异能者和稀有品种隔离，遭到反对后，皇帝决定将大量稀有品种燃烧殆尽。目击一切的大神、樱小路和便当君。身为稀有品种的便当君杀害大量异能者，为保护异能者的大神与便当君对立，结果却是让小樱亲眼看见同为稀有品种的便当君杀了大神并夺取了大神的手臂后，以一人之力抹消的当场的所有力量，将足以毁灭世界的虚无力量封印在盒子中（也就是后来的潘多拉的盒子），结束了12月32日惨案。

惨案之后，小樱和大神的记忆部分丧失。大神本身的能力被伊甸四杰夺走并封印，被皇帝左手臂复活后跟随搜寻者；樱小路一家三人分离，樱被樱子的远亲樱小路夫妇收养，虽过着正常人的生活，却有着无法容忍杀人、即便恶人的性命也会拼命保护的心伤；伊甸为了防止惨剧再次发生而要抹消稀有品种的存在，珍种与异能者从此对立，搜寻者因为想知道真相而被暗杀，脱离伊甸。

涩谷庄（しぶや）

原为CØDE:BREAKER的养成所，因为某事件后停用，被涩谷改建为宿舍，过去搜寻者和人见都曾居住在此。

每集列表

话数	日文标题	中文标题	分镜	演出	作画监督
第1话	大いなる神の審判	大神的审判	入江泰浩	迫井政行	诸贯哲朗、服部聪志 りば、野崎敦子
第2话	燃え咲く螺旋の青い花	燃烧绽放的蓝色螺旋花朵	小岛正幸	かおり	松尾亚希子
第3话	怒れる勇気・刻まれる鉄槌	愤怒的勇气、烙印的铁锤	小美野雅彦 入江泰浩	小美野雅彦	诸贯哲朗
第4话	鬨の声	揭战之声	迫井政行		水树乃乃 りば
第5话	願いのうたげ	渴望的飨宴	小岛正幸	かおり	越后光嵩 田畑昭
第6话	ロストワン	Lost One	坂上一郎	菊田幸一	松尾亚希子
第7话	桜、光の中に	樱，在光之中	小美野雅彦		土屋友次、诸贯哲朗
第8话	王と兵、子と家	王与兵、子与家	小岛正幸	熨斗谷充孝	竹内由香里
第9话	止まった時間	停止的时间	迫井政行		まじろ
第10话	人の見る世界	人所见的世界	入江泰浩	かおり	松尾亚希子
第11话	5万人の人質	5万名人质	迫井政行	池畠博史	土屋友次 中岛美子
第12话	魔王・神と人・見守る桜	魔王、神与人、一旁守护的樱	入江泰浩	迫井政行	まじろ 野崎丽子
最终话	神と咲く花	神与绽放的花朵	入江泰浩		野崎丽子、松尾亚希子