舞台是东京新宿……

樱花盛开的季节里，转校来到「真神学园」的迷团重重的男子「绯勇龙麻」。

就像被引导着一样，结识了剑道部的「蓬莱寺京一」，摔跤部的「醍醐雄矢」，射箭部的「樱井小蒔」，以及学生会会长「美里葵」。

他们受到突然或心活性化的《龙脉》的影响，《拥有的力量的人》觉醒了。

与此同时，同样受到龙脉影响的被叫做《鬼》的异形也出现了，并且开始了对东京的袭击。

并且，存在着使用《外法》操纵这些鬼怪的人。

为了保护东京的龙麻一行，不久又和要逃离自身的《宿星》相遇了……

第一季

在东京的新宿，一切就像受到了某种力量的引导一样。主人公绯勇龙麻转校来到了真神学园，并遇到了剑道部的蓬莱寺京一、摔跤部的醍醐雄矢、弓道部的樱井小莳以及学生会会长美里葵。众人由于受到了“龙脉”的影响，各自体内的未知力量开始觉醒了。同样受到龙脉影响的名为“鬼”的异形也出现在了东京，并被某个神秘的对东京有企图的黑手所操纵。为了保护东京，也为了各自所背负的宿命，龙麻等人决定去面对即将发生的一切。

第二季

本以为战斗可以平息下来的真神学园"打鬼部"的成员们,没想到迎接他们的将是更加惨烈的战斗,"九角天童"背后的神秘人物终于在"拳武篇"中现身,这个给予"九角天童"邪恶力量的人究竟是怎样的,还有等待"龙麻、京一"等人的星宿的宿命又是怎样的,种种的谜团都将在"东京魔人学园剑风帖 拳武篇"中得到解答.

庆长十九年（1614年），取得天下的德川家康为继承问题堪忧，他不想牺牲自己麾下的武士，便令相互仇视的伊贺和甲贺两大忍术宗家相争，进行十人对十人的忍术生死战，以解决继承问题。甲贺隶属国千代派（德川忠长），伊贺隶属竹千代派（德川家光），双方宗长在卷轴写上门下十个忍者的姓名，并在缔下战约后相杀，双双身亡。这些姓名中包括双方继承人甲贺弦之介和伊贺胧，他们分处两个阵营却彼此相爱，原本要论及婚嫁，但这场战事破坏了他们的姻缘。

卷轴传回甲贺卍谷和伊贺锷隐谷的边界，伊贺锷隐众读过卷轴后，隐瞒双方开战的消息并杀掉甲贺忍众中的三人，后朝甲贺卍谷出击，但他们的行动失败，只捉住甲贺的胡夷便撤退。甲贺忍众得知开战的消息后，杀死伊贺中的一人，并赶往锷隐谷营救弦之介。

双方首领都得知了开战的消息，弦之介靠着强大的眼术压制伊贺忍众，撤回甲贺卍谷。珑不愿意见到双方兵戎相见可能为锷隐造成的崩坏，使用秘药封住双眼及自己的眼术。弦之介打算率甲贺众到骏府城想向德川家康询问原委，伊贺众趁他们露宿时追击，封住了弦之介的双眼。双方在路途中持续激斗，各剩三人。

伊贺众遇见竹千代的乳娘阿福（春日局），与她一同前去骏府城，在阿福的协力下，双方厮杀之后，演变成仅剩弦之介和胧的局面。双方的决斗由服部半藏担任裁判，决斗开始后，珑自杀，弦之介在卷轴上写下珑的名字后也投海殉情。德川家光继任德川三代将军。

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