瓦古娜利亞北海道某城市分店，一班充满独特个性的店员，包括喜欢小东西的主角小鸟游、有如吉祥物般的种岛、患有男性恐惧症的真昼、腹黑又掌握所有人底细的相马、原本是不良少女的店长杏子……等，而新加入的工读生也带来了更多有趣的话题。

一位小学5年级学生天野景太在暑假中的时候偶然发现了树下摆着一台破旧的扭蛋机，于是用硬币扭出扭蛋’硬币扭出扭蛋之后，打开了一个神秘的扭蛋。扭蛋中飞出了一个 自称为“妖怪执事” 的妖怪[威斯帕]。威斯帕它必须要用“妖怪pad”查询妖怪！从此以后，景太就可以用妖怪手表看到身边出现的各种不可思议的妖怪了。遇到困难的时候可以用妖怪徽章召唤妖怪朋友们呢!

首部结合偶像歌手、恋爱、战机变形机器人等元素的动画剧集，当时掀起一波热潮。西历1999年，一颗巨大陨石坠落在南太平洋亚塔利亚岛。经过调查之后发现，这颗“陨石”原来是一艘拥有超越地球人类科技的巨型宇宙战舰。明白告诉了地球人类，在地球以外还有其他高智慧的生物存在，而且更有可能是一些比起地球人类身高高五倍，以战争为生之巨人。于是各国政府抛开国家之间的利害关系，成立整合世界现有国家的单一人类政府，并开始重建这艘代号为ASS-1（Alien Star Ship-1）的外星太空船。

重建的10年期间，虽然决定组成地球统合宇宙军，但地球各地亦发生了很多为利害冲突而展开的激烈战争。在战争期间重建的工作仍然继续进行，直至战争结束，地球恢复平静，这艘ASS-1终于重建完成，并且改名SDF-1 马克罗斯。就在纪念马克罗斯重建完成纪念当天，马克罗斯突然失控自动发射主炮……