2003年，在英国威尔士梅尔帝亚纳魔法学校学习魔法并以第一名毕业的涅吉·史普林菲尔德(ネギ·スプリングフィールド)(虚岁10岁)，目标是成为像他爸爸一样的“伟大的魔法师”(Magister Magi)。毕业的修业课程是“a teacher in Japan”——被指派到日本埼玉县麻帆良学园担任实习教师。想不到，他竟然被分配到“女子中学”，到有31个人的问题班级“2年A班”(2-A)担任班导师……

瓦古娜利亞北海道某城市分店，一班充满独特个性的店员，包括喜欢小东西的主角小鸟游、有如吉祥物般的种岛、患有男性恐惧症的真昼、腹黑又掌握所有人底细的相马、原本是不良少女的店长杏子……等，而新加入的工读生也带来了更多有趣的话题。

在这个世界，人类的生活遭到被称作“耳无”的神秘生命体威胁。只有能插上（Plugin）战斗装甲“装备”（Equipment）、并操纵它的能力者“祈手”（Prayer）能够与耳无对抗。生活在废铁城市“里弗切斯特”的少年“艾可”，自从10年前目击到耳无和祈手（Prayer）在大战“Fes”中留下传说的祈手“吉米”以来，暗地里对祈手产生强烈憧憬的同时，他也闷闷不乐地生活着。然而在某天，一如既往在垃圾山做着采掘工作的艾可，与丧失记忆的少女“缪”相遇了。腰间有着插孔（Input Jack）的她也曾是祈手。不久，两人为了追寻缪的出身以及身为Fes的中心人物却谜团重重的人物吉米，踏上了旅程。

每集列表