《寻找失去的未来》作为一款十八禁恋爱冒险游戏，玩家须与游戏中4名女主角互动以推动剧情发展。玩家在游玩《寻找失去的未来》时将会花费大多数时间观看出现在萤幕上的文字叙述、人物对话以及角色心理等，借由这样的方式除了让故事获得进展外，也可以与游戏角色对话进行交流。玩家可以选择不同选项，并随着游戏的进行而与女主角关系渐趋亲密，甚至最后还有可能发生更加亲密的关系。

玩家于游戏中能够体会到4条主要故事路线。在每次阅读故事发展以及与其他角色对话后，玩家便有机会能够在与角色互动时、从游戏提供的数个选项中挑选其中一项。这时游戏会暂停一会儿以提供玩家依据先前的对话作出决定，玩家在某些关键选项之中的抉择则会影响到游戏朝特定方向展开，并进入各式分支情节中。借由决定于数个选项抉择的方式来让游戏系统判定玩家攻略的故事剧情，同时游戏中所做的决定也会影响这些角色故事后半段呈现不一样的结局。

天文学会所属的秋山奏，与很有才能的副会长佐佐木佳织、文武双全的才女会长支仓爱理、策略家的大小姐华宫凪沙、美国的交换留学生长船?KENNY?英太郎成员的独特个性，共同解决内滨学园的骚乱。

因为放学后在保健室旁的奏，听到校舍内发出震动与怪声，跑去现场后发现，全裸的少女倒在地上。自称叫唯的少女，完全不谈论当时的情况，为何好像知道奏的名字，隔日加入天文学会。

之后天文学会收到了学生会的委托，负责“校内出现幽灵”、“内滨症候群”、“事故多发地区”的事件调查。

赤龙战役

煌历3015年，两大国多纳提亚与黄烂进入冷战状态，世界因此变得四分五裂。其中小岛国尼尔加姆伊丧失独立权，国家的守护神“赤龙”发生异变而暴走，为此，来自三国的精英们组成了名为“混成调查队”的部队前往调查事件真相。

混沌战争

在因为“赤龙”陷入疯狂而引发的“赤龙战役”十年后，身为世界根源的七龙之中，又有三柱龙陷入疯狂。狂乱的魔素将人转化为非人之物，世界到处都是混沌龙的军队，世界因此陷入混沌战争之中。

霸王春秋

西方大国“多纳提亚”的皇帝驾崩，多纳提亚与东方大国“黄烂”之间因而终止了短暂的和平。多纳提亚帝国分裂成数个独立国家。所有国家为了掌握世界的霸权纷纷争夺龙的遗骸“龙骸”，还有狂乱之龙所造成的“魔素之地”为目标而开始行动。

来自七个国家的七位霸者，赌上世界霸权而互相争斗。历史的巨轮来到“霸王春秋”的时代。

一款席卷游戏界的网络游戏“YGGDRASIL(世界树)”，在营运十二年后停止一切服务，一名喜欢该游戏的普通上班族“飞鼠”，在营运的最后一刻来到游戏中曾名噪一时、由其担任会长的强大公会—“安兹·乌尔·恭”的根据地纳萨力克大坟墓进行最后巡礼，等待营运的结束。

—原本应该是如此。

虽然营运时间结束，玩家角色却无法登出游戏。而公会内的NPC也开始拥有自己的思想、如活人般地活动起来。在原本的游戏中拥有骷髅魔法师外表的飞鼠，就这样与他率领的公会展开前所未有的奇幻传奇冒险。