东京篇
主角绯村剑心流浪至东京，因为神谷薰的挽留而留在东京。其后认识了明神弥彦、相乐左之助及高荷惠等人，又与前幕府杀手鹈堂刃卫、御庭番众首领四乃森苍紫决斗，其间剑心经历了多次战斗，令剑心自觉慢慢变回昔日的刽子手拔刀斋(千人斩拔刀斋)(人斩り抜刀斎)。最后在与幕末时代的对手前新撰组第三小队组长斋藤一决战及得知志志雄一党的阴谋后，独自前往京都与志志雄一党对决。(漫画、电视动画)
京都篇
前维新志士志志雄真实及他的同党正在秘密活动，目的是推翻明治政府，由他带领日本成为强国。剑心为了阻止志志雄的计划得逞，独自离开东京前往京都。后来剑心的同伴亦逐一赶到京都寻找剑心，剑心从师傅比古清十郎身上学会飞天御剑流的最终奥义“天翔龙闪”后，与其同伴相乐左之助及斋藤一、四乃森苍紫联手，终于打败了志志雄一党。(漫画、电视动画)
漫画及电视动画的东京篇及京都篇在故事上大致相同。在京都篇完结后，由于当时漫画只是刚开始连载人诛篇，跟不上电视动画的制作进度，因此电视动画另行制作了岛原篇、胜海舟篇、由太郎篇(黑骑士团篇)及风水篇。但受到原作版本的读者批评与原作版浪客剑心的世界观相异，因此后期收视不太理想，在风水篇后便终止制作。
追忆篇
故事发生于剑心在幕末身为长州派维新志士时担当刽子手的年代(东京篇之前的故事)。故事讲述剑心与第一任妻子雪代巴的过去，解明了剑心左边面颊的十字疤之谜。OVA故事共分四幕，第四幕尾段雪代巴为阻挡敌人向剑心发出最后一撃的同时，亦被剑心一剑杀死，临死前用自杀的小刀在剑心面上划上一刀，与未婚夫清里和剑心死斗时划下的一刀，交织成剑心脸上的十字疤。漫画版的追忆篇连载于人诛篇初期剑心的回忆自述，而OVA则独立讲述剑心的过去。(漫画、OVA)
OVA版本的追忆篇内容虽然与漫画原著并无太大出入，但其风格却与之前的电视动画版大大不同。彻底摆脱了少年漫画的风格，特别是拔刀斋出招时其没有像过往一般大喊出必杀技名称，而一般很难于少年漫画及电视动画中出现的大量血花四溅的残酷场面亦一一呈现。坊间对此等手法毁誉参半，例如其血腥露骨的场面可能不适合原作的主要读者(小学生、中学生)，但亦得到一般未看过原作的人支持。而本作于日本海外评价亦相当高，在美国的销售亦曾登上全年DVD销售榜的第7位。
人诛篇
雪代巴之弟雪代缘当年亲眼看到姐姐死于剑心的刀下，长大后集合了“六人同志”，向剑心展开复仇行动(在上海流浪垂死之际被好心日本家庭收留，却因为只想练能攻克剑心武功的念头而杀死对方一家并取走武功秘笈单刀法而自练出倭刀术以及其绝招虎伏绝刀势)。由于雪代缘的阴谋，使剑心一度以为神谷薰被杀而意志消沈(神谷薰之死令当时少年JUMP周刊的读者引起一阵回响)。最后剑心回复斗志并打败雪代缘，雪代缘持着其姊的日记消失在剑心等人面前。(漫画)
番外篇
结束连载以后以SP模式连载两个番外篇，分别是《早春樱花》及《弥彦的逆刃刀》。前者提到了结局之后众人各自的新旅程，如左之助的世界一圈之旅到了蒙古。后者是弥彦以神谷活心流行侠仗义的活跃篇。
第零幕
2012年初由日本漫画杂志“JUMP SQ”公开了《浪客剑心》将于八月号开始推出新连载《第零幕》，与1999年结束的连载相隔十三年的新篇章。
北海道篇
2017年9月连载的新续篇，故事发生在“人诛篇”后5年(1885年)，绯村剑心和神谷薰动身前往北海道寻找薰的父亲神谷越路郎，同时和环游世界回来的左之助、在日本流浪的宗次郎、在北海道服刑的安慈、与调往北海道的斋藤一重逢。就连新撰组的永仓新八，也将在“北海道篇”出现。
本作是一个以僵尸为主的恋爱故事，严格来说从头到尾并非喜剧，主要场景为K县足仓郡紫阳町。男主角降谷千纮在一次机缘巧合的情况下，意外令本来已死的女主角散华礼弥因复活药而成为僵尸。
散华礼弥(内田真礼 配音)本该是一个快乐活泼的女孩，可是与亡母过分想象的外貌激发了父亲散华团一郎(石冢运升 配音)超限度的溺爱和束缚，这让礼弥感到痛苦万分，甚至因此而失足从悬崖上摔落而死。没想到，礼弥的死却促成了她和偶然间邂逅的少年降谷千紘(木村良平 配音)之间的一段缘分。为了使爱猫复活，对僵尸极其狂热的降谷研发了一种怪异的药剂，他将这种药剂用在了已死的礼弥身上，没想到，礼弥居然以僵尸的形式重生了。
就这样，僵尸礼弥顺其自然的成为了降谷家的寄宿者，而为了使礼弥能够重新成为普通的女孩，降谷开始为了研究新的药剂而开始了奔波。
每集列表
| 话数 | 原文标题 | 中文标题 | 剧本 | 分镜 | 演出 | 作画监督 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| #0 （OAD） |
運命って…ヤツは… A Tiny Wind |
所谓…命运之物… 一阵微风 |
高木登 | 名村英敏 | 竹下健一 | 樱井正明 中岛美子 中本尚 |
| #1 | 私が…ゾンビに…なったら Wellful of Wails |
我…变成…僵尸的话 嚎啕的任性 |
畠山守 | 胡阳树 冈户智凯（道具） |
||
| #2 | 成功…してた Being Sanka Rea |
成功…了 作为散华礼弥 |
畠山守 | 西村博昭 | 氏家嘉宏 平川亚喜雄 |
|
| #3 | さんか…れあ A Zombie is Born |
散华…礼弥 一名僵尸的诞生 |
久保太郎 | 泷原美树 金顺渊 |
||
| #4 | 普通の…女の子… She'll Sleep When She's Dead |
普通的…女孩子… 她于死亡中入眠 |
杉原研二 | 小泷礼 | 吉田俊司 | 平川亚喜雄 胡阳树 |
| #5 | ゾンビって…コトは… Upstairs Grave |
僵尸…究竟是… 上层的坟墓 |
武田浩介 | 山崎光惠 | 松本正幸 | Hue Hye Jung |
| #6 | あなたに…出会えたから 2 Days Later |
因为…遇见了你 两日以后 |
高木登 | 畠山守 | 西村博昭 | 氏家嘉宏 |
| #7 | おさな…なじみ… Run Ranko Run |
青梅…竹马… 跑吧兰子 |
杉原研二 | 小坂知 | 高山秀树 | 高泽美佳 金顺渊 |
| #8 | 偽りに…自由… Taken Away |
虚伪的…自由… 拐走 |
武田浩介 | 山崎光惠 | 吉田俊司 | 平川亚喜雄 门智昭 |
| #9 | 母の…手… Is the Truth Out There? |
妈妈的…手… 真相并非如此吗？ |
西村博昭 | 氏家嘉宏 小坂知 |
||
| #10 | 強い…思い… All About Her Stepmother |
强烈的…思念… 关于她的继母的一切 |
杉原研二 | 大山清和 | 松本正幸 | Hue Hye Jung Han Jeong I Kim Kang Won |
| #11 | 特別…なんかじゃ…ない Goodbye Father |
才…不是…特别的 再见了爸爸 |
名村英敏 | 久保太郎 | 平川亚喜雄 稻田真树 室山祥子 山田太郎 |
|
| #12 | あの瞬間…俺は… The Meaning of Bite |
那个瞬间…我是… 咬下的意义 |
高木登 | 畠山守 | 吉田俊司 | 泷原美树 平川亚喜雄 稻田真树 氏家嘉宏 |
| #13 （OAD） |
吾輩も…ゾンビである… Cat on a Cool Tin Roof |
我也是…僵尸 保持冷静 |
武田浩介 | 名村英敏 | 氏家嘉宏、牧内桃子 平川亚喜雄 池下博纪 |
|
| #14 （OAD） |
身はゾンビに…心は… The Girl with the Thorn in Her Side |
身为僵尸…心为… 心中带刺的女人 |
高木登 | 赤城博昭 | 樱井正明 中岛美子 清水胜祐 大木贤一 室山祥子 |
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《辉夜大小姐想让我告白～天才们的恋爱头脑战～》(日语：かぐや様は告らせたい～天才たちの恋愛頭脳戦～)是由赤坂明(赤坂アカ)创作的一部恋爱喜剧漫画。
“在恋爱中先告白的人就是输家!”
备受期待的菁英云集的秀知院学园，在学生会中相遇的副会长四宫辉夜与会长白银御行，本应相互吸引的两人之间……却什么也没发生的度过了半年!麻烦的是，自尊心过高而无法变得坦率的两人，变得只想着要“如何让对方先告白”!?
直至今日，辉夜与白银使尽浑身解数的恋爱头脑战仍在持续著。
在那里学生会相遇的、副会长-四宫辉夜和会长-白银御行，本应该互相吸引的两人……什么也没有发生的过了半年!!
自尊心很高不能变得诚实的两人，变的麻烦不断，尽是在考虑“怎么样让对方告白呢”!!这两人的将来会是怎么样!?
这是一个只要A上去就能赢但双方都要疯狂走位的故事两个人互有好感却都有心坎，绞尽脑汁想让对方先告白的故事。
实际就是看秀知院学园的两位天才怎样变相撒狗粮