高町奈叶(田村由香里 配音)是一位平凡的高中三年级学生，某日，在上学的路上，她同来自异世界米德其路达的尤诺(水桥香织 配音)相遇了。尤诺告诉奈叶，她正在寻找遗落人间的太古遗产“圣石之种”，这种珍贵的宝物蕴藏着巨大的能量，如果弃之不顾有可能在人间界造成巨大的破坏，接二连三的波折之后，奈叶成为了帮助尤诺回收种子的魔法少女，开始了一段充满了危险和刺激的奇幻旅程。

某日，一位名叫菲特(水树奈奈 配音)的金发少女出现在了奈叶的面前，她和奈叶一样同为回收种子的魔法少女，也就是说，她们的关系是竞争者。奈叶能够打败这样一位强劲的对手吗?对于菲特来说，温柔而又努力的奈叶又是一种怎样的存在呢?

突然出现在房间的椭圆球体，竟跑出一个小女孩，还是个超强的超能力少女?!在少女的暴力胁迫下，黑社会干部新田不得不屈服，让少女寄宿家里。新田不知道，这个决定，将会使他的人生从此天翻地覆!

黑社会干部X超能力少女的城市生活喜剧!在芦川组干部·新田的房间落下的奇妙的楕圆形的物体，那是所有的开始!在神秘物体里面有一个没表情的少女·雏。用不可抗拒的念动力威胁新田，雏住在了新田家。隐瞒着少女的来历，黑社会干部和超能力少女危险而爆笑的同居生活开始了!