故事讲述重考生本须和秀树，身无分文只身来到东京却想拥有一部价格昂贵的人形电脑。于东京，人形电脑是非常普及的家电。他心想“如果可在垃圾堆中捡到一部就好了”，却如他所愿在东京的一晚捡到一部人形电脑。由于该电脑没有装上任何软件， 故此只会以“唧(chi)”作应对，故他把该电脑命名为小唧，并与小唧朝夕相对。

当秀树发现小唧拥有很高的学习能力，就常购买书给小唧。之后，秀树又发现小唧有别于一般人形电脑，例如没有装上任何软件却会自行活动，可强行进入其他电脑而不被发现，更特别的是一般电脑的开关制都设于耳朵后，但小唧的却在阴道内。

其后秀树更发现公寓的管理员日比谷千岁原来是制造小唧的科学家之妻子(小唧的母亲)。原来，小唧从前有个与她一模一样的姐姐芙蕾亚，芙蕾亚却爱上自己的父亲而极其难过，最终系统负载过重“死了”(电脑系统损坏且难以维修)。临死前，小唧硬把姐姐的记忆接收到自己身上。随后小唧遭到重置失去了记忆。她在死之前说了“请把我放远一点!”(后于垃圾堆处巧被秀树所发现)。最后，秀树与小唧互相相爱。

故事发生在日本虚构城市“友枝市”。木之本樱某天将父亲的古书籍打开，意外把封印在书中的卡牌释出。它们是由魔法师库洛·里多创造的称之为“库洛牌”的魔法卡牌，每张卡牌都有不同的能力和自我意识，卡牌的随意行动能够对世界造成灾难。为了防止灾难发生，樱受封印书之守护者“可洛贝洛斯”的委托下，将四散的卡牌回收至书中。卡牌在成功回收后，樱也能将卡牌的能力解放给自身使用，以方便回收下一张卡牌。

回收卡牌不久后，来了一位转校生，他是库洛·里多的母亲家族“李家”的后人——李小狼。李小狼在得知库洛牌的封印解除后，便来到日本打算回收卡牌。起初李小狼认为木之本樱无法胜任卡牌回收，故常和木之本樱争夺卡牌回收，但最后认同木之本樱回收卡牌的能力。在所有卡牌回收并写上名字后，封印书之另一守护者“月”便会进行审判，判断持有卡牌之人是否能成为卡牌的新主人。木之本樱在审判中改变原有的封印杖，创造出星封印杖，最终通过了审判者月的审判。

在通过审判后的第二学期，班中转入一位从英国来的留学生——柊泽艾力欧。与此同时，木之本樱所持有的库洛封印书变成为樱封印书，以及木之本樱受到不明的攻击。在应对攻击时，却发现审判过程中转变而成的星封印杖与库洛牌无法使用，而令木之本樱、守护者与大道寺知世遭遇危险，最后木之本樱使用新魔法阵并将库洛牌转变成樱之卡，解决当前危险。