一直以来过着普通日常生活的主人公樱羽一时，

某天因遭到甲贺忍者的袭击，得知了自己身为伊贺忍者第19代正统继承人的真实身份，被卷入伊贺与甲贺长久以来对立的忍者世界中。

为了生存，一时认为自己也必须成为忍者来保护自己，他下定决心进入忍术学园学习，直面残酷的命运。

大正年间，豆狸小豆从乡下到大城市大阪办事，在以幻术戏弄人类时，于春来亭遇见知名落语家大黑亭文狐，见到她以落语让人类沉醉不已。小豆深受感动，立志成为落语家，并求文狐收自己为徒。身为上方落语四天王之一的文狐原先无意收徒，但在见到小豆的诚意后，允许她偷师。小豆寄于文狐篱下，除了学习有关落语的一切，也精进自身的幻术，并认识文狐以外的落语界的人士，包括四天王之一的椿白团治和他的弟子椿白良。

文狐曾与上一代大黑亭约好不收弟子。为了避免小豆遭业界封杀，文狐便按照白团治的建议，将她逐出师门，并让她接受四天王的考验，以证明她有能耐继承“大黑亭”之名。在通过考验后，小豆成功回到文狐门下。在一次演出后，小豆发现自己的变身术失灵，正逐渐变回原形。为了避免失去法力，小豆在天神的帮助下进入地狱，向传说中的狸猫左卫门讨教。

第3部 范马刃牙

全美最恶监狱篇

全美最恶监狱，亚利桑那州立监狱，通称黑色五角大厦，聚集了整个犯罪之国美国最凶恶的犯人。君临此地的是拥有钢铁般肌肉与无双怪力的罪犯，全美最强-比斯凯多.欧利巴与最强海盗集团首领-纯.凯巴尔的对决。刃牙绑架美国总统布希自愿进入此地，为了训练并最终与欧利巴一战。

原人皮可篇

一亿9000万年前白恶纪的原人，皮可，出土并奇迹般的被复活。以暴龙为主食，立足于白垩纪生态系顶点的皮可，拥有远超现代人类的强大肉体与野性战斗力。烈海王，愚地克己，刃牙，范马勇次郎强者聚集而来，现代最强VS白垩纪最强，将决定地球一亿9000万年的史上最强者。

地上最强的亲子打架

范马刃牙与范马勇次郎的最终决战。