《干物妹!小埋》描述女高中生土间埋与她的哥哥土间大平一起生活的故事。在学校里八面玲珑的小埋，一回到家就变成了游手好闲的干物妹，花大量的时间躺在地板上玩游戏，并不断指使她的哥哥做各种杂事，这也因此让大平感到十分苦恼。在这段生活中，有着另类性格的小埋与她的同学本场切绘成为了朋友，还遇到了在学校的竞争对手橘·希尔芬福特，而这两人的哥哥都是与大平同一间办公室的同事。

一宫绘瑠奈在国中时期过着单纯的御宅生活。在亲人与表哥二宫时雨的说服下开始挑选想要就读的高中，挑选条件毫无疑问是“可爱的制服”。最终挑选的结果是私立御神乐学园，虽然原本因为“二宫就读”而在最初就剔除，不过一宫在招生指南上看到御神乐星锁穿着制服的模样后马上就回心转意。不过，开学当天对今后生活心情激动的一宫，却在新生欢迎会上见到学长姐们暴走的身影。而且，这所学校里存在着“一个月内未参加任何社团活动的人将被强制退学”这样的校规。一宫能在学园中度过理想中的校园生活吗?

私立御神乐学园(私立ミカグラ学園)

作为本作背景舞台的学校。采取全住宿制，所有学生必须入住学校所提供的宿舍。

只存在文化类型的社团，而且也不允许建立文化类型以外的社团[b]。并且存在着强制参加社团的校规，无所属社团的人甚至会被退学。

御神乐学园采取完全中学的教育制度。有部分名额直升，部分名额借由入学考试审核从外部招募。

学校腹地广大，且建筑物应有尽有。学园内所有事物皆可由内部购得，包括各种日用品，甚至还有电影院跟游乐园。

每位学生都会拥有一件“终端机”，用来处理学园内生活事物以及“点数”。校园内事务包括各种校内指南以及对于对抗战的完善协助服务。而点数则是校内货币，所有的校内日用品包括餐点和热水都需要用点数来购买，可以借由出席日常课程或在对抗战中取胜来获得。

由御神乐、一宫与二宫的祖先们创建。

社团对抗战(部活対抗戦)

御神乐学园特有的系统。简称对抗战。

校内将会定期举办社团对抗战，用以将各社团排名。因此各社团除了社长以外，还会特别有“代表”一职用来代表社团出席对抗战[c]。

对抗战的场所是整栋校舍，而校舍四周会被结界封住无法通行。选手的身周会有三个心形水晶漂浮着，代表选手的生命值[d]。一个小时内将对手的水晶破坏殆尽，或者是让对手投降即算获胜。如果超过时间仍未分出胜负即算平局，但通常不会有这种事情发生。

对抗战的种类繁多，其中最具影响力的就是“期中战(中間試戦)”与“期末战(期末本戦)”，除此之外还有由学园官方指定出赛者的“单挑战(単発対抗戦)”以及限定一年级生出战的“新秀战(ルーキー戦)”等等。社团对抗战的表现将会影响社团排名，并进一步干涉所有社员的各种待遇，例如住宿与伙食。排名较高的社团会拥有较优良的居住环境以及膳食，相对的排名落后的社团甚至必须睡在走廊尽头楼梯底下的睡袋中。

学园内各处都有监视器，基本上是用来转播对抗战。

变态假扮游戏(変質者ごっこ)

幼年时的一宫原创的游戏。

基本规则以鬼ごっこ(日本游戏，规则近于捉迷藏)演变而来，只不过将鬼变成了变态，并且必须以兴奋状态来追逐未感染者。另外，因为在一宫的主观中有着“变态都跑不快”这样的误解，因此变态被禁止全力奔跑。

游戏的结局是整个公园充满了变态般缓慢行走并故作猥亵的小孩子们。也因为这样，使幼年的一宫以不好的方向声名大噪。

高中一年级的冬天，丸末晴在桥上偶遇班上的美少女作家可知白草，自此就喜欢上她。白草平常贯彻冰山美人的形象，对旁人态度十分冷淡，只对末晴相当友善。当末晴鼓起勇气准备表白之际，却意外得知白草已经有男朋友，备受打击。之前曾向末晴表白但遭拒绝的青梅竹马志田黑羽在此时从旁教唆：“与其这么痛苦，不如报复吧?来给她一场最棒的复仇吧!”末晴恼羞成怒，同意了黑羽的说法。目标是可知白草、以“恋爱报复恋爱”的“初恋复仇”自此展开，并将全校卷进一场大骚乱之中。