1992年，成为大学生的上原芽衣子开始在“电脑商店R”打工。电脑商店R其实也在开发、销售美少女游戏，店铺2楼即为“Alcohol Soft”的开发室。芽衣子擅长绘画，店长(“店长”)六田胜觉得她有前途，带她去2楼代替跑路的员工当副美。芽衣子对电脑没什么了解，美少女游戏更是一窍不通，但还是在其他前辈员工指导下努力完成美术工作。芽衣子获主美下田香织赏识，之后的作品也被拉去帮忙，后在香织推荐下担任原画，成为原画家。

不久，香织受《心跳回忆》《DESIRE》等触动，主张制作“不只有H，且是认真描写恋爱的游戏”，遭到店长和编剧“僵尸”(五味川清)反对，未能达成一致。香织感到今后的美少女游戏可能性巨大，决定瞒着店长，拉上僵尸做完最后的大作当礼物，之后从Alcohol Soft辞职。结果店长挥泪留住香织，引发僵尸不满。公司内出现香织的Alcohol Soft和僵尸的SPIRITS SOFT两个品牌。

香织在Alcohol Soft专心当制作人，公司招进女高中生双胞胎キキララ当新编剧。芽衣子原画的新生Alcohol Soft游戏第1作发售。作品大受欢迎，Alcohol Soft招募新人才，扩大规模。

时间来到1996年，当时美少女游戏正从PC-98(DOS)转移至Windows平台。Alcohol Soft也准备转移至Windows，程序员“守”(六田守)讨厌Windows，声言辞职，被キキララ说服留下。店长打算将作品移植至游戏机，和Diamond Studio著名制作人市谷合作，却碰上Diamond Studio倒闭，市谷跑路。出资1亿日元的Alcohol Soft逃过破产但损失巨大，游戏机移植计划也打了水漂。

芽衣子自荐出任下一作品的企划，称想要推出以Comiket为舞台、同人志为题材的游戏。香织认可芽衣子的激情，同时担心芽衣子的企划会否受大众认可。后来在僵尸的建议下，成功找到办法解决问题。美少女游戏专门杂志越来越多，特集文章全被竞争对手企业“Shooting Star”独占，店长出手反击。不久，芽衣子企划的Alcohol Soft新作《Comic Paradise》发售。

花坂结衣(市道真央 配音)是一名十七岁的女子高中生，为了应对即将到来的升学考试，她从家乡搬到了东京，来投奔在这里生活的姐姐。虽然结衣平日看起来有些呆呆的，但实际上却是一个非常乐观和努力的姑娘。桃原奈月(村川梨衣 配音)虽然看上去娇小可爱，却意外的擅长料理家事，每一天都为了哥哥的生活忙东忙西。

青岛萌香(三森铃子 配音)一直以来都希望能够成为一名歌手，但真正走上这条道路后她才发现，前往充满了曲折和困难。虽然表面上非常的好胜要强，但萌香实际上却有着非常温柔的一面。和这三个可爱的女孩子一起，夏天开始了。

在史上最大规模的世界大战结束后，各国认知到战争太不符合成本效益，于是在缔结和平协议，摒弃明刀明枪的光明战争后，投入大量资源训练间谍，展开以资讯战为主的影子战争。

女主角之一、代号“花园”的百合是迪恩共和国的间谍学生，因自己冒失的性格而成为学校中的吊车尾。有一天，她被招募到由实力强大的间谍“燎火”克劳斯刚创立的“灯火”小队。“灯火”是专门解决“不可能任务”的间谍组织。虽然怕死但一心想着出人头地的百合到了“灯火”的根据地“阳炎宫”后，在大堂遇见其他六名少女，才发现这支小队除了长官克劳斯之外，其他成员都是跟自己年龄相近，而且在其他间谍学校也是吊车尾的问题学生。再者，克劳斯虽然身怀极为高超的间谍技术，却因自己太过于天才而缺乏教导他人的能力，更令百合对一个月后的任务担心不已。她们在阳炎宫一起生活时有一些规矩，包括第26条“七人合力生活”、第27条“外出时要拿出真本事”等等，也是莫名其妙。就这样子去执行“不可能任务”，恐怕难逃一死。百合面对眼前的必死困局，下定决心展开计划。

原来在迪恩共和国最强的间谍团队“火焰”覆灭后，克劳斯身为仅存的成员，亲自从各大间谍学校中挑选多名少女，创立间谍团队“灯火”。他根据“火焰”最后任务惨败的情形，判定“火焰”中存在叛徒，而且阳炎宫内可能存在窃听器，因此在各大间谍培育学校中，刻意选取尚未毕业的吊车尾学生，以避免人员情报外流。在第一次任务前，“灯火”一直假装成团队内只有七人来混淆视听。在成功完成生化武器夺还任务后，克劳斯原本打算解散“灯火”，并将成员送回培育学校。不过，在成员的坚持下，“灯火”继续运作。